التفاصيل البيبلوغرافية
| العنوان: |
The genome of Alcaligenes aquatilis strain BU33N: Insights into hydrocarbon degradation capacity ... : جينوم سلالة Alcaligenes aquatilis BU33N: رؤى حول قدرة تحلل الهيدروكربونات ... |
| المؤلفون: |
Mouna Mahjoubi, Habibu Aliyu, Simone Cappello, Mohamed Naifer, Yasmine Souissi, Don A. Cowan, Ameur Chérif |
| بيانات النشر: |
OpenAlex |
| سنة النشر: |
2019 |
| المجموعة: |
DataCite Metadata Store (German National Library of Science and Technology) |
| مصطلحات موضوعية: |
Microbial Bioremediation of Organic Pollutants, Pollution, Environmental Science, Physical Sciences, Marine Microbial Diversity and Biogeography, Ecology, FOS Biological sciences, Biological Methane Utilization and Metabolism, Molecular Biology, Biochemistry, Genetics and Molecular Biology, Life Sciences, Oil Biodegradation, Bioremediation, Phenanthrene, Alcaligenes, Biology, Metagenomics, Gene, Bacteria, Microbiology, Genome, Chemistry, Environmental chemistry, Biochemistry, Genetics, Pseudomonas |
| الوصف: |
Environmental contamination with hydrocarbons though natural and anthropogenic activities is a serious threat to biodiversity and human health. Microbial bioremediation is considered as the effective means of treating such contamination. This study describes a biosurfactant producing bacterium capable of utilizing crude oil and various hydrocarbons as the sole carbon source. Strain BU33N was isolated from hydrocarbon polluted sediments from the Bizerte coast (northern Tunisia) and was identified as Alcaligenes aquatilis on the basis of 16S rRNA gene sequence analysis. When grown on crude oil and phenanthrene as sole carbon and energy sources, isolate BU33N was able to degrade ~86%, ~56% and 70% of TERHc, n-alkanes and phenanthrene, respectively. The draft genome sequence of the A. aquatilis strain BU33N was assembled into one scaffold of 3,838,299 bp (G+C content of 56.1%). Annotation of the BU33N genome resulted in 3,506 protein-coding genes and 56 rRNA genes. A large repertoire of genes related to the ... : يشكل التلوث البيئي بالهيدروكربونات على الرغم من الأنشطة الطبيعية والبشرية المنشأ تهديدًا خطيرًا للتنوع البيولوجي وصحة الإنسان. يعتبر العلاج الحيوي الميكروبي الوسيلة الفعالة لمعالجة هذا التلوث. تصف هذه الدراسة بكتيريا منتجة للتوتر السطحي الحيوي قادرة على استخدام النفط الخام والهيدروكربونات المختلفة كمصدر وحيد للكربون. تم عزل سلالة BU33N من الرواسب الملوثة بالهيدروكربونات من ساحل بنزرت (شمال تونس) وتم تحديدها على أنها Alcaligenes aquatilis على أساس تحليل تسلسل جينات الحمض النووي الريبوزي 16S. عندما نمت على النفط الخام والفينانثرين كمصادر وحيدة للكربون والطاقة، كان عزل BU33N قادرًا على التحلل ~86 ٪ و ~56 ٪ و 70 ٪ من TERHc و n - alkanes و phenanthrene، على التوالي. تم تجميع مسودة تسلسل الجينوم لسلالة A. aquatilis BU33N في سقالة واحدة من 3،838،299 نقطة أساس (محتوى G+C من 56.1 ٪). نتج عن شرح جينوم BU33N 3،506 جينًا مشفرًا للبروتين و 56 جينًا من الحمض النووي الريبوزي. تم تحديد ذخيرة كبيرة من الجينات المتعلقة باستقلاب المركبات العطرية بما في ذلك الجينات التي تشفر الإنزيمات المشاركة في التحلل الكامل للبنزوات. كما تم ... |
| نوع الوثيقة: |
text |
| اللغة: |
English |
| العلاقة: |
https://dx.doi.org/10.60692/qnryc-kwc18Test |
| DOI: |
10.60692/wsbgn-q1a69 |
| الإتاحة: |
https://doi.org/10.60692/wsbgn-q1a6910.60692/qnryc-kwc18Test |
| حقوق: |
cc-by |
| رقم الانضمام: |
edsbas.CE2EBE5F |
| قاعدة البيانات: |
BASE |
