مؤتمر
MRM protein quantification and serum sample classification
| العنوان: | MRM protein quantification and serum sample classification |
|---|---|
| المؤلفون: | Szacherski, Pascal, Gerfault, Laurent, Giovannelli, Jean-François, Giremus, Audrey, Mahé, Pierre, Fortin, Tanguy, Choquet, Geneviève, Klich, Amna, Mercier, Catherine, Roy, Pascal, Salvador, Arnaud, Lemoine, Jérôme, Charrier, Jean-Philippe, Lacroix, Bruno, Grangeat, Pierre |
| المساهمون: | Laboratoire de l'intégration, du matériau au système (IMS), Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Institut Polytechnique de Bordeaux-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Electronique des Systèmes Santé (LE2S), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives - Laboratoire d'Electronique et de Technologie de l'Information (CEA-LETI), Direction de Recherche Technologique (CEA) (DRT (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Xerox Research Centre Europe Meylan, Xerox Company, bioMérieux, BIOMERIEUX, Biomérieux Lyon, Biostatistiques santé, Département biostatistiques et modélisation pour la santé et l'environnement LBBE, Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive - UMR 5558 (LBBE), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive - UMR 5558 (LBBE), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut des Sciences Analytiques (ISA), Institut de Chimie du CNRS (INC)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Biomérieux SA - R&D Proteom, bioMérieux SA, Human Genetics Department |
| المصدر: | 61st conference of the American Society of Mass Spectrometry https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00909875Test 61st conference of the American Society of Mass Spectrometry, Jun 2013, Minneapolis, United States |
| بيانات النشر: | HAL CCSD |
| سنة النشر: | 2013 |
| المجموعة: | Archive ouverte HAL (Hyper Article en Ligne, CCSD - Centre pour la Communication Scientifique Directe) |
| مصطلحات موضوعية: | [INFO.INFO-TS]Computer Science [cs]/Signal and Image Processing, [SPI.SIGNAL]Engineering Sciences [physics]/Signal and Image processing, [SDV.BBM.GTP]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Genomics [q-bio.GN] |
| جغرافية الموضوع: | Minneapolis, United States |
| الوصف: | Quantification and classification are key points for differential analysis of proteomic studies and diagnostic tests. A MRM analytical chain is a cascade of molecular events depicted by a graph structure, each node being associated to a molecular state such as protein, peptide or ion and each branch to a molecular processing. Each protein is associated to a set of transition measurements. One key question is how to infer the protein level and the class label. We propose to compare a hierarchical model based Bayesian Hierarchical Inversion combining all transitions and a non-linear processing based on logarithmic transformation of standardized peak value combined with a median filter. Classification performances are evaluated on a colorectal cancer cohort for LFABP and PDI biomarkers. |
| نوع الوثيقة: | conference object |
| اللغة: | English |
| العلاقة: | hal-00909875; https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00909875Test; https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00909875/documentTest; https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00909875/file/ASMS_2013-abstract-V6.pdfTest |
| الإتاحة: | https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00909875Test https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00909875/documentTest https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00909875/file/ASMS_2013-abstract-V6.pdfTest |
| حقوق: | info:eu-repo/semantics/OpenAccess |
| رقم الانضمام: | edsbas.BE00F8A1 |
| قاعدة البيانات: | BASE |
| الوصف غير متاح. |