التفاصيل البيبلوغرافية
| العنوان: |
Increased DNA methylation contributes to the early ripening of pear fruits during domestication and improvement ... : تساهم زيادة مثيلة الحمض النووي في النضج المبكر لثمار الكمثرى أثناء التدجين والتحسين ... |
| المؤلفون: |
Bobo Song, Jie‐Hui Yu, Xiaolong Li, Jiaming Li, Jing Fan, Hainan Liu, Weilin Wei, Lingchao Zhang, Ke Gu, Dongliang Liu, Kunkun Zhao, Jun Wu |
| بيانات النشر: |
OpenAlex |
| سنة النشر: |
2024 |
| المجموعة: |
DataCite Metadata Store (German National Library of Science and Technology) |
| مصطلحات موضوعية: |
Molecular Mechanisms of Plant Development and Regulation, Plant Science, Agricultural and Biological Sciences, Life Sciences, Molecular Mechanisms of Flavonoid Biosynthesis in Plants, Molecular Biology, Biochemistry, Genetics and Molecular Biology, Physiology and Management of Fruit Trees, Epigenetic Regulation, Biology, DNA methylation, Differentially methylated regions, PEAR, Ripening, Epigenetics, Domestication, Bisulfite sequencing, Methylation, Genetics, FOS Biological sciences, Gene, Botany, Gene expression |
| الوصف: |
Background DNA methylation is an essential epigenetic modification. However, its contribution to trait changes and diversity in the domestication of perennial fruit trees remains unknown. Results Here, we investigate the variation in DNA methylation during pear domestication and improvement using whole-genome bisulfite sequencing in 41 pear accessions. Contrary to the significant decrease during rice domestication, we detect a global increase in DNA methylation during pear domestication and improvement. We find this specific increase in pear is significantly correlated with the downregulation of Demeter-like1 ( DML1 , encoding DNA demethylase) due to human selection. We identify a total of 5591 differentially methylated regions (DMRs). Methylation in the CG and CHG contexts undergoes co-evolution during pear domestication and improvement. DMRs have higher genetic diversity than selection sweep regions, especially in the introns. Approximately 97% of DMRs are not associated with any SNPs, and these ... : الملخص: تعد ميثلة الحمض النووي في الخلفية تعديلًا جينيًا أساسيًا. ومع ذلك، فإن مساهمتها في تغييرات السمات والتنوع في تدجين أشجار الفاكهة المعمرة لا تزال غير معروفة. النتائج هنا، نقوم بالتحقيق في الاختلاف في مثيلة الحمض النووي أثناء تدجين الكمثرى وتحسينها باستخدام تسلسل ثنائي كبريتات الجينوم الكامل في 41 ملحقًا من الكمثرى. على عكس الانخفاض الكبير أثناء تدجين الأرز، نكتشف زيادة عالمية في مثيلة الحمض النووي أثناء تدجين الكمثرى وتحسينها. نجد أن هذه الزيادة المحددة في الكمثرى ترتبط ارتباطًا كبيرًا بإلغاء تنظيم الديميتر الشبيه بالديميتر 1 ( DML1 ، ترميز ديميثيلياز الحمض النووي) بسبب الانتقاء البشري. نحدد ما مجموعه 5591 منطقة معالجة بالميثيل بشكل تفاضلي (DMRs). تخضع المثيلة في سياقات مجموعة التنسيق ومجموعة التنسيق للتطور المشترك أثناء تدجين الكمثرى وتحسينها. تتمتع DMRs بتنوع وراثي أعلى من مناطق اكتساح الانتقاء، خاصة في الإنترونات. لا يرتبط ما يقرب من 97 ٪ من DMRs بأي SNPs، وترتبط DMRs هذه باستقلاب النشا والسكروز والتخليق الحيوي للفينيل بروبانويد. كما نقوم بتحليل الارتباط بين مثيلة الحمض النووي والتعبير الجيني. نجد ... |
| نوع الوثيقة: |
text |
| اللغة: |
English |
| العلاقة: |
https://dx.doi.org/10.60692/1z3ss-1sx84Test |
| DOI: |
10.60692/zzfmy-9ps25 |
| الإتاحة: |
https://doi.org/10.60692/zzfmy-9ps2510.60692/1z3ss-1sx84Test |
| حقوق: |
cc-by |
| رقم الانضمام: |
edsbas.AEA9E5F7 |
| قاعدة البيانات: |
BASE |
