التفاصيل البيبلوغرافية
| العنوان: |
Eukaryotic chromatin structure in the context of R-loops and histone modifications ; Eukarióta kromatinszerkezet az R-hurkok és a hisztonmódosítások összefüggésében |
| المؤلفون: |
Halász, László |
| المساهمون: |
Székvölgyi, Lóránt, Halász, László, Molekuláris sejt- és immunbiológia doktori iskola, DE--Általános Orvostudományi Kar -- Biokémiai és Molekuláris Biológiai Intézet |
| سنة النشر: |
2018 |
| المجموعة: |
University of Debrecen Electronic Archive (DEA) / Debreceni Egyetem elektronikus Archívum |
| مصطلحات موضوعية: |
Genomika, Genomics, bioinformatika, DRIP-seq, fragmentációs torzítás, RNS-DNS hibridek, kromatin szerkezet, H3K4me3, DSB, Set1C, Spp1, Mer2, bioinformatics, fragmentation bias, RNA-DNA hybrids, chromatin structure, Elméleti orvostudományok, Orvostudományok |
| الوصف: |
(1) Az RNS-DNS hibridek (R-hurkok) az életfa minden szintjén előforduló epigenetikai markerek. Az R-hurkok akkor alakulnak ki, amikor egy RNS molekula a vele homológ DNS molekulával hibridizál, létrehozva ezzel egy RNS-DNS hibridet és egy kitaszított egyszálú DNS szakaszt. A korai tudományos kutatások az R-hurkokat a genom-instabilitás potenciális forrópontjainak tekintette, mivel az egyszálú rész hajlamos a DNS károsítására, és mutációt vagy kromoszómális átrendezéseket hozhat létre. Egyre több bizonyíték utal azonban arra, hogy az R-hurkok masszívan jelen vannak fiziológiás körülmények között is és olyan kritikus sejtfolyamatokat szabályoznak, mint például a transzkripciós faktorok kötődése, génexpresszió vagy heterokromatin-képződés. Éppen ezért, ezeknek a struktúráknak a pontos azonosítása és jellemzése kulcsfontosságú. Eredményeink alapján, a nukleinsav fragmentálása szonikálással, valamint az RNase A kezelés elhagyása javíthat az RNS-DNS hibridek azonosításának specificitásán. Továbbá, a restrikciós enzim emésztés a hosszú DRIP fragmentumok felülreprezentációjához vezet, ami kifejezetten jellemző a gének első exonjára. Ez a torzított mintavételezés rontja a módszer felbontóképességét, valamint az R-hurkok egy részének pontos biológiai funkciójának a meghatározását. (2) A meiózis és meiotikus rekombináció az öröklődés és az evolúciós variabilitás esszenciája. A rekombináció egy programozott esemény, amely a szülői allélok új kombinációit eredményezik rekombináns és nem rekombináns útvonalakon keresztül. A meiotikus rekombinációt a DNS duplaszáltörések kialakulása indítja el a korai profázisban. Ezt a folyamatot a konzervált, topoizomeráz-szerű Spo11 kromoszóma-tengely fehérje katalizálja. Az utóbbi időkben, számos fajban feltérképezték a DNS duplaszáltöréseket teljes-genom szinten. Ezek a tanulmányok írták le, hogy a DNS duplaszáltörések diszkrét forrópontokban csoportosulnak a genomban és hierarchikus szinten szabályozottak. Ezek a forrópontok élesztő rendszerben, főképp GC-gazdag, H3K4me3 ... |
| نوع الوثيقة: |
other/unknown material |
| وصف الملف: |
application/pdf |
| اللغة: |
Hungarian
English |
| العلاقة: |
http://hdl.handle.net/2437/263577Test |
| الإتاحة: |
http://hdl.handle.net/2437/263577Test |
| رقم الانضمام: |
edsbas.209E6F4F |
| قاعدة البيانات: |
BASE |
