Exploring selective autophagy events in multiple biologic models using LC3-interacting regions (LIR)-based molecular traps
| العنوان: | Exploring selective autophagy events in multiple biologic models using LC3-interacting regions (LIR)-based molecular traps |
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| المؤلفون: | Grégoire Quinet, Pierre Génin, Oznur Ozturk, Naima Belgareh-Touzé, Lilas Courtot, Renaud Legouis, Robert Weil, Mickael M. Cohen, Manuel S. Rodriguez |
| المساهمون: | Laboratoire de chimie de coordination (LCC), Institut de Chimie de Toulouse (ICT-FR 2599), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre d'Immunologie et des Maladies Infectieuses (CIMI), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de Biologie Moléculaire et Cellulaire des Eucaryotes (LBMCE), Institut de biologie physico-chimique (IBPC (FR_550)), Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), REPERE and prematuration (Ubipiège) programs of Occitanie (France), CONACyT-SRE (Mexico) grant 0280365, Ligue Régionale contre le Cancer (M29506), ANR-11-LABX-0011,DYNAMO,Dynamique des membranes transductrices d'énergie : biogénèse et organisation supramoléculaire.(2011), ANR-17-CE13-0026,MOMIT,Dissection structurale de l'ancrage mitochondrial par imagerie super-résolutive(2017), ANR-19-CE11-0018,MITOFUSION,Structure, assemblage et propriétés biophysiques des mitofusines(2019), Gulli, Marie-Hélène, Dynamique des membranes transductrices d'énergie : biogénèse et organisation supramoléculaire. - - DYNAMO2011 - ANR-11-LABX-0011 - LABX - VALID, Dissection structurale de l'ancrage mitochondrial par imagerie super-résolutive - - MOMIT2017 - ANR-17-CE13-0026 - AAPG2017 - VALID, Structure, assemblage et propriétés biophysiques des mitofusines - - MITOFUSION2019 - ANR-19-CE11-0018 - AAPG2019 - VALID, Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) |
| المصدر: | Scientific Reports Scientific Reports, 2022, 12 (1), pp.7652. ⟨10.1038/s41598-022-11417-z⟩ |
| بيانات النشر: | HAL CCSD, 2022. |
| سنة النشر: | 2022 |
| مصطلحات موضوعية: | Mammals, Multidisciplinary, Saccharomyces cerevisiae, Proteases, Models, Biological, Biochemistry, embryonic structures, Macroautophagy, Autophagy, Animals, biological phenomena, cell phenomena, and immunity, [SDV.BBM.BC]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Biochemistry [q-bio.BM], Caenorhabditis elegans, Microtubule-Associated Proteins, [SDV.BBM.BC] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Biochemistry [q-bio.BM], Protein Binding |
| الوصف: | Autophagy is an essential cellular pathway that ensures degradation of a wide range of substrates including damaged organelles or large protein aggregates. Understanding how this proteolytic pathway is regulated would increase our comprehension on its role in cellular physiology and contribute to identify biomarkers or potential drug targets to develop more specific treatments for disease in which autophagy is dysregulated. Here, we report the development of molecular traps based in the tandem disposition of LC3-interacting regions (LIR). The estimated affinity of LC3-traps for distinct recombinant LC3/GABARAP proteins is in the low nanomolar range and allows the capture of these proteins from distinct mammalian cell lines, S. cerevisiae and C. elegans. LC3-traps show preferences for GABARAP/LGG1 or LC3/LGG2 and pull-down substrates targeted to proteaphagy and mitophagy. Therefore, LC3-traps are versatile tools that can be adapted to multiple applications to monitor selective autophagy events in distinct physiologic and pathologic circumstances. |
| وصف الملف: | application/pdf |
| اللغة: | English |
| تدمد: | 2045-2322 |
| الوصول الحر: | https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_dedup___::8c365cad86fe8fe8f8e47a7ebf7ad1ffTest https://hal.science/hal-03666597Test |
| حقوق: | OPEN |
| رقم الانضمام: | edsair.doi.dedup.....8c365cad86fe8fe8f8e47a7ebf7ad1ff |
| قاعدة البيانات: | OpenAIRE |
| تدمد: | 20452322 |
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