دورية أكاديمية
Covidex: an ultrafast and accurate tool for virus subtyping
العنوان: | Covidex: an ultrafast and accurate tool for virus subtyping |
---|---|
المؤلفون: | Cacciabue, Marco Polo Domingo, Aguilera, Pablo Nicolas, Gismondi, Maria Ines, Taboga, Oscar Alberto |
بيانات النشر: | Cold Spring Harbor Laboratory Press |
المجموعة: | CONICET Digital (Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas) |
مصطلحات موضوعية: | SARS-CoV-2, SUBTYPING, MACHINE LEARNING, COVID-19, https://purl.org/becyt/ford/1.2Test, https://purl.org/becyt/ford/1Test, https://purl.org/becyt/ford/1.6Test |
الوصف: | Covidex is an open-source, alignment-free machine learning subtyping tool for viral species. It is a shiny app that allows a fast and accurate classification in pre-defined clusters for SARS-CoV-2 and FMDV genome sequences. The user can also build its own classification models with the Covidex model generator. ; Fil: Cacciabue, Marco Polo Domingo. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación En Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina. Universidad Nacional de Luján. Departamento de Ciencias Básicas; Argentina ; Fil: Aguilera, Pablo Nicolas. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación En Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina. Universidad Nacional de Luján. Departamento de Ciencias Básicas; Argentina ; Fil: Gismondi, Maria Ines. Universidad Nacional de Luján. Departamento de Ciencias Básicas; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación En Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina ; Fil: Taboga, Oscar Alberto. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación En Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina |
نوع الوثيقة: | article in journal/newspaper |
وصف الملف: | application/pdf |
اللغة: | English |
تدمد: | 2692-8205 |
العلاقة: | info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.08.21.261347v1Test; http://hdl.handle.net/11336/129481Test; Cacciabue, Marco Polo Domingo; Aguilera, Pablo Nicolas; Gismondi, Maria Ines; Taboga, Oscar Alberto; Covidex: an ultrafast and accurate tool for virus subtyping; Cold Spring Harbor Laboratory Press; bioRxiv; 2020; 21-8-2020; 1-5; CONICET Digital; CONICET |
الإتاحة: | https://doi.org/10.1101/2020.08.21.261347Test http://hdl.handle.net/11336/129481Test |
حقوق: | info:eu-repo/semantics/openAccess ; https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/arTest/ |
رقم الانضمام: | edsbas.B28B823D |
قاعدة البيانات: | BASE |
ResultId |
1 |
---|---|
Header |
edsbas BASE edsbas.B28B823D 750 3 Academic Journal academicJournal 750 |
PLink |
https://search.ebscohost.com/login.aspx?direct=true&site=eds-live&scope=site&db=edsbas&AN=edsbas.B28B823D&custid=s6537998&authtype=sso |
FullText |
Array
(
[Availability] => 0
)
Array ( [0] => Array ( [Url] => https://doi.org/10.1101/2020.08.21.261347# [Name] => EDS - BASE [Category] => fullText [Text] => View record in BASE [MouseOverText] => View record in BASE ) ) |
Items |
Array
(
[Name] => Title
[Label] => Title
[Group] => Ti
[Data] => Covidex: an ultrafast and accurate tool for virus subtyping
)
Array ( [Name] => Author [Label] => Authors [Group] => Au [Data] => <searchLink fieldCode="AR" term="%22Cacciabue%2C+Marco+Polo+Domingo%22">Cacciabue, Marco Polo Domingo</searchLink><br /><searchLink fieldCode="AR" term="%22Aguilera%2C+Pablo+Nicolas%22">Aguilera, Pablo Nicolas</searchLink><br /><searchLink fieldCode="AR" term="%22Gismondi%2C+Maria+Ines%22">Gismondi, Maria Ines</searchLink><br /><searchLink fieldCode="AR" term="%22Taboga%2C+Oscar+Alberto%22">Taboga, Oscar Alberto</searchLink> ) Array ( [Name] => Publisher [Label] => Publisher Information [Group] => PubInfo [Data] => Cold Spring Harbor Laboratory Press ) Array ( [Name] => Subset [Label] => Collection [Group] => HoldingsInfo [Data] => CONICET Digital (Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas) ) Array ( [Name] => Subject [Label] => Subject Terms [Group] => Su [Data] => <searchLink fieldCode="DE" term="%22SARS-CoV-2%22">SARS-CoV-2</searchLink><br /><searchLink fieldCode="DE" term="%22SUBTYPING%22">SUBTYPING</searchLink><br /><searchLink fieldCode="DE" term="%22MACHINE+LEARNING%22">MACHINE LEARNING</searchLink><br /><searchLink fieldCode="DE" term="%22COVID-19%22">COVID-19</searchLink><br /><searchLink fieldCode="DE" term="%22https%3A%2F%2Fpurl%2Eorg%2Fbecyt%2Fford%2F1%2E2%22">https://purl.org/becyt/ford/1.2</searchLink><br /><searchLink fieldCode="DE" term="%22https%3A%2F%2Fpurl%2Eorg%2Fbecyt%2Fford%2F1%22">https://purl.org/becyt/ford/1</searchLink><br /><searchLink fieldCode="DE" term="%22https%3A%2F%2Fpurl%2Eorg%2Fbecyt%2Fford%2F1%2E6%22">https://purl.org/becyt/ford/1.6</searchLink> ) Array ( [Name] => Abstract [Label] => Description [Group] => Ab [Data] => Covidex is an open-source, alignment-free machine learning subtyping tool for viral species. It is a shiny app that allows a fast and accurate classification in pre-defined clusters for SARS-CoV-2 and FMDV genome sequences. The user can also build its own classification models with the Covidex model generator. ; Fil: Cacciabue, Marco Polo Domingo. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación En Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina. Universidad Nacional de Luján. Departamento de Ciencias Básicas; Argentina ; Fil: Aguilera, Pablo Nicolas. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación En Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina. Universidad Nacional de Luján. Departamento de Ciencias Básicas; Argentina ; Fil: Gismondi, Maria Ines. Universidad Nacional de Luján. Departamento de Ciencias Básicas; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación En Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina ; Fil: Taboga, Oscar Alberto. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación En Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina ) Array ( [Name] => TypeDocument [Label] => Document Type [Group] => TypDoc [Data] => article in journal/newspaper ) Array ( [Name] => Format [Label] => File Description [Group] => SrcInfo [Data] => application/pdf ) Array ( [Name] => Language [Label] => Language [Group] => Lang [Data] => English ) Array ( [Name] => ISSN [Label] => ISSN [Group] => ISSN [Data] => 2692-8205 ) Array ( [Name] => NoteTitleSource [Label] => Relation [Group] => SrcInfo [Data] => info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.08.21.261347v1; http://hdl.handle.net/11336/129481; Cacciabue, Marco Polo Domingo; Aguilera, Pablo Nicolas; Gismondi, Maria Ines; Taboga, Oscar Alberto; Covidex: an ultrafast and accurate tool for virus subtyping; Cold Spring Harbor Laboratory Press; bioRxiv; 2020; 21-8-2020; 1-5; CONICET Digital; CONICET ) Array ( [Name] => URL [Label] => Availability [Group] => URL [Data] => https://doi.org/10.1101/2020.08.21.261347<br />http://hdl.handle.net/11336/129481 ) Array ( [Name] => Copyright [Label] => Rights [Group] => Cpyrght [Data] => info:eu-repo/semantics/openAccess ; https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/ ) Array ( [Name] => AN [Label] => Accession Number [Group] => ID [Data] => edsbas.B28B823D ) |
RecordInfo |
Array
(
[BibEntity] => Array
(
[Languages] => Array
(
[0] => Array
(
[Text] => English
)
)
[Subjects] => Array
(
[0] => Array
(
[SubjectFull] => SARS-CoV-2
[Type] => general
)
[1] => Array
(
[SubjectFull] => SUBTYPING
[Type] => general
)
[2] => Array
(
[SubjectFull] => MACHINE LEARNING
[Type] => general
)
[3] => Array
(
[SubjectFull] => COVID-19
[Type] => general
)
[4] => Array
(
[SubjectFull] => https://purl.org/becyt/ford/1.2
[Type] => general
)
[5] => Array
(
[SubjectFull] => https://purl.org/becyt/ford/1
[Type] => general
)
[6] => Array
(
[SubjectFull] => https://purl.org/becyt/ford/1.6
[Type] => general
)
)
[Titles] => Array
(
[0] => Array
(
[TitleFull] => Covidex: an ultrafast and accurate tool for virus subtyping
[Type] => main
)
)
)
[BibRelationships] => Array
(
[HasContributorRelationships] => Array
(
[0] => Array
(
[PersonEntity] => Array
(
[Name] => Array
(
[NameFull] => Cacciabue, Marco Polo Domingo
)
)
)
[1] => Array
(
[PersonEntity] => Array
(
[Name] => Array
(
[NameFull] => Aguilera, Pablo Nicolas
)
)
)
[2] => Array
(
[PersonEntity] => Array
(
[Name] => Array
(
[NameFull] => Gismondi, Maria Ines
)
)
)
[3] => Array
(
[PersonEntity] => Array
(
[Name] => Array
(
[NameFull] => Taboga, Oscar Alberto
)
)
)
)
[IsPartOfRelationships] => Array
(
[0] => Array
(
[BibEntity] => Array
(
[Identifiers] => Array
(
[0] => Array
(
[Type] => issn-print
[Value] => 26928205
)
[1] => Array
(
[Type] => issn-locals
[Value] => edsbas
)
[2] => Array
(
[Type] => issn-locals
[Value] => edsbas.oa
)
)
)
)
)
)
)
|
IllustrationInfo |