المؤلفون: Amarsy, R., Granger, B., Fournier, S., Monteil, C., Trystram, D., Siorat, V., Jarlier, V., Robert, J., Lefevre, Laurence Armand, Aubry, Alexandra, Avettand-Fenoel, Véronique, Barbut, Frédéric, Belec, Laurent, Bercot, Béatrice, Bonacorsi, Stéphane, Calvez, Vincent, Cambau, Emmanuelle, Carbonnelle, Etienne, Charpentier, Charlotte, Chevaliez, Stéphane, Decousser, Jean-Winoc, Delaugerre, Constance, Descamps, Diane, Dortet, Laurent, Doucet-Populaire, Florence, Frange, Pierre, Fourati, Slim, Gaillard, Jean-Louis, Gault, Elyanne, Herrmann, Jean-Louis, Jarlier, Vincent, Kerneis, Solen, Le Goff, Jérôme, Mainardi, Jean-Luc, Marcelin, Anne-Geneviève, Morand-Joubert, Laurence, Pawlotsky, Jean-Michel, Poyart, Claire, Rameix-Welti, Marie-Anne, Robert, Jérôme, Rodriguez, Christophe, Roque Afonso, Anne-Marie, Rottman, Martin, Rozenberg, Flore, Ruppé, Etienne, Skurnik, David, Veziris, Nicolas, Zahar, Jean-Ralph, Barnaud, Guilene, Billard-Pomares, Typhaine

المصدر: Journal of Hospital Infection ; volume 143, page 97-104 ; ISSN 0195-6701

مصطلحات موضوعية: Infectious Diseases, Microbiology (medical), General Medicine

الإتاحة: https://doi.org/10.1016/j.jhin.2023.09.022Test
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https://api.elsevier.com/content/article/PII:S0195670123003328?httpAccept=text/plainTest

المؤلفون: Gschwind, Rémi, Petitjean, Marie, Fournier, Claudine, Lao, Julie, Clermont, Olivier, Nordmann, Patrice, Mellmann, Alexander, Denamur, Erick, Poirel, Laurent, Ruppé, Etienne

المساهمون: Uhlemann, Anne-Catrin, French Ministry of Defense | Direction Générale de l'Armement, Joint Programming Initiative on Antimicrobial Resistance, Universität Freiburg | National Center of Competence in Research Bio-Inspired Materials, University of Fribourg, Swiss national science foundation, Laboratoire Europeen Associe, INSERM "Emerging antibiotic resistance in Gram-negative bacteria"

المصدر: Antimicrobial Agents and Chemotherapy ; volume 68, issue 4 ; ISSN 0066-4804 1098-6596

الإتاحة: https://doi.org/10.1128/aac.01459-23Test

المؤلفون: Lao, Julie, Marin, Pierre, Dallet, Romain, Mareuil, Fabien, Toisy, Alix De, Hillion, Kenzo-Hugo, Birer, Aurélien, Goué, Nadia, Bonnet, Richard, Ruppé, Etienne, Corguillé, Gildas Le, Glaser, Philippe, Médigue, Claudine

المساهمون: Institut Français de Bioinformatique (IFB-CORE), Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Infection, Anti-microbiens, Modélisation, Evolution (IAME (UMR_S_1137 / U1137)), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité)-Université Sorbonne Paris Nord, Plateforme Auvergne Bioinformatique (AuBi), Mésocentre Clermont Auvergne, Université Clermont Auvergne (UCA)-Université Clermont Auvergne (UCA), ABiMS - Informatique et bioinformatique = Analysis and Bioinformatics for Marine Science (ABIMS), Fédération de recherche de Roscoff (FR2424), Station biologique de Roscoff = Roscoff Marine Station (SBR), Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Station biologique de Roscoff = Roscoff Marine Station (SBR), Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Hub Bioinformatique et Biostatistique - Bioinformatics and Biostatistics HUB, Institut Pasteur Paris (IP)-Université Paris Cité (UPCité), Nantes Université (Nantes Univ), CHU Clermont-Ferrand, Écologie et Évolution de la Résistance aux Antibiotiques / Ecology and Evolution of Antibiotics Resistance (EERA), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris-Saclay-Université Paris Cité (UPCité)-Microbiologie Intégrative et Moléculaire (UMR6047), Institut Pasteur Paris (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Pasteur Paris (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Génomique métabolique (UMR 8030), Genoscope - Centre national de séquençage Evry (GENOSCOPE), Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), This work is financially supported by the French Priority Research Programme on Antimicrobial Resistance (PPR Antibiorésistance), coordinated by Inserm and funded by the Secrétariat général pour l’investissement (SGPI), Federation of European Microbiological Society

المصدر: FEMS 2023 European Congress of Microbiology ; https://hal.science/hal-04369134Test ; FEMS 2023 European Congress of Microbiology, Jul 2023, Congress Center Hamburg Hamburg, Germany, Germany

مصطلحات موضوعية: antibioresistance, genomic surveillance, epidemiology, FAIR data, database, Galaxy Workflow, [INFO.INFO-BI]Computer Science [cs]/Bioinformatics [q-bio.QM], [SDV.BBM.GTP]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Genomics [q-bio.GN], [SDV.MP.BAC]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Bacteriology

جغرافية الموضوع: Germany

الوقت: Congress Center Hamburg Hamburg, Germany, Germany

العلاقة: hal-04369134; https://hal.science/hal-04369134Test; https://hal.science/hal-04369134/documentTest; https://hal.science/hal-04369134/file/ABRomics_poster_FEMS_2023.pdfTest

الإتاحة: https://hal.science/hal-04369134Test
https://hal.science/hal-04369134/documentTest
https://hal.science/hal-04369134/file/ABRomics_poster_FEMS_2023.pdfTest

المؤلفون: Lao, Julie, Marin, Pierre, Dallet, Romain, Mareuil, Fabien, Toisy, Alix De, Birer, Aurélien, Goue, Nadia, Bonnet, Richard, Ruppe, Etienne, Corguille, Gildas Le, Glaser, Philippe, Médigue, Claudine

المساهمون: Institut Français de Bioinformatique (IFB-CORE), Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Infection, Anti-microbiens, Modélisation, Evolution (IAME (UMR_S_1137 / U1137)), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité)-Université Sorbonne Paris Nord, Plateforme Auvergne Bioinformatique (AuBi), Mésocentre Clermont Auvergne, Université Clermont Auvergne (UCA)-Université Clermont Auvergne (UCA), ABiMS - Informatique et bioinformatique = Analysis and Bioinformatics for Marine Science (ABIMS), Fédération de recherche de Roscoff (FR2424), Station biologique de Roscoff = Roscoff Marine Station (SBR), Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Station biologique de Roscoff = Roscoff Marine Station (SBR), Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Hub Bioinformatique et Biostatistique - Bioinformatics and Biostatistics HUB, Institut Pasteur Paris (IP)-Université Paris Cité (UPCité), CHU Clermont-Ferrand, Écologie et Évolution de la Résistance aux Antibiotiques / Ecology and Evolution of Antibiotics Resistance (EERA), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris-Saclay-Université Paris Cité (UPCité)-Microbiologie Intégrative et Moléculaire (UMR6047), Institut Pasteur Paris (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Pasteur Paris (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Analyse Bio-Informatique pour la Génomique et le Métabolisme (LABGeM), Génomique métabolique (UMR 8030), Genoscope - Centre national de séquençage Evry (GENOSCOPE), Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Genoscope - Centre national de séquençage Evry (GENOSCOPE), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), This work is financially supported by the French Priority Research Programme on Antimicrobial Resistance (PPR Antibiorésistance), coordinated by Inserm and funded by the Secrétariat général pour l’investissement (SGPI), INRAE (Benoit Doublet)

المصدر: 9ème symposium sur la résistance aux antimicrobiens chez les animaux et dans l'environnement (ARAE 2023)
https://hal.science/hal-04369175Test
9ème symposium sur la résistance aux antimicrobiens chez les animaux et dans l'environnement (ARAE 2023), Jul 2023, Vinci International Convention Centre, Tours, France

مصطلحات موضوعية: antibioresistance, genomic surveillance and research, epidemiology, FAIR data, database, Galaxy Workflow, [INFO.INFO-BI]Computer Science [cs]/Bioinformatics [q-bio.QM], [SDV.BBM.GTP]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Genomics [q-bio.GN], [SDV.MP.BAC]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Bacteriology

جغرافية الموضوع: Tours, France

الوقت: Vinci International Convention Centre, Tours, France

العلاقة: hal-04369175; https://hal.science/hal-04369175Test; https://hal.science/hal-04369175/documentTest; https://hal.science/hal-04369175/file/ABRomics_poster_ARAE_2023%20copie.pdfTest

الإتاحة: https://hal.science/hal-04369175Test
https://hal.science/hal-04369175/documentTest
https://hal.science/hal-04369175/file/ABRomics_poster_ARAE_2023%20copie.pdfTest

المؤلفون: Ruppé, Etienne, on behalf of the Network for Enhancing Tricycle ESBL Surveillance Efficiency (NETESE) group

مصطلحات موضوعية: Policy & Practice

جغرافية الموضوع: Geneve

العلاقة: Bulletin of the World Health Organization; 10; 101; https://iris.who.int/handle/10665/373250Test; PMC10523813

الإتاحة: https://doi.org/10.2471/BLT.22.289520Test
https://iris.who.int/handle/10665/373250Test

المؤلفون: Dalmasso, Guillaume, Beyrouthy, Racha, Brugiroux, Sandrine, Ruppé, Etienne, Guillouard, Laurent, Bonnin, Virginie, Saint-Sardos, Pierre, Ghozlane, Amine, Gaumet, Vincent, Barnich, Nicolas, Delmas, Julien, Bonnet, Richard

المساهمون: Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte (M2iSH), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Clermont Auvergne (UCA), Centre National de Référence de la Résistance aux Antibiotiques CHU Clermont-Ferrand (CNR), CHU Clermont-Ferrand, Infection, Anti-microbiens, Modélisation, Evolution (IAME (UMR_S_1137 / U1137)), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité)-Université Sorbonne Paris Nord, Département d'Epidemiologie, Biostatistique et Recherche Clinique (DEBRC), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard Paris, Hub Bioinformatique et Biostatistique - Bioinformatics and Biostatistics HUB, Institut Pasteur Paris (IP)-Université Paris Cité (UPCité), Imagerie Moléculaire et Stratégies Théranostiques (IMoST), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne (UCA), This study was supported by the Ministère de la Recherche et de la Technologie, the Inserm (UMR 1071), the INRAe (USC-2018), the French government’s IDEX-ISITE initiative 16-IDEX-0001 (CAP 20-25), the National Program ‘Microbiote’ Inserm, the Joint Programming Initiative on Antimicrobial Resistance (JPIAMR) programme TransComp-ESC-R of the European Commission, and a grant (‘DYASPEO’) from the national priority research program for antimicrobial resistance (PPR-AMR)., ANR-20-PAMR-0003,DYASPEO,Dynamics, AMR, spread, persistence, evolution, colonization, human, animal, environment(2020), ANR-16-IDEX-0001,CAP 20-25,CAP 20-25(2016), European Project: 323209,EC:FP7:HEALTH,FP7-JPROG-2012-RTD,JPIAMR(2012)

المصدر: EISSN: 2049-2618 ; Microbiome ; https://pasteur.hal.science/pasteur-04086913Test ; Microbiome, 2023, 11 (1), pp.12. ⟨10.1186/s40168-022-01457-y⟩

مصطلحات موضوعية: mcr-1, Colistin, Antibiotic resistance, Antimicrobial peptides, Virulence, Inflammation, Microbiota, Escherichia coli, Commensalism, [SDV]Life Sciences [q-bio], [INFO.INFO-BI]Computer Science [cs]/Bioinformatics [q-bio.QM]

العلاقة: info:eu-repo/semantics/altIdentifier/pmid/36670449; info:eu-repo/grantAgreement/EC/FP7/323209/EU/Coordination Action for the early implementation of the Joint Programming Initiative on Antimicrobial Resistance/JPIAMR; pasteur-04086913; https://pasteur.hal.science/pasteur-04086913Test; https://pasteur.hal.science/pasteur-04086913/documentTest; https://pasteur.hal.science/pasteur-04086913/file/s40168-022-01457-y.pdfTest; PUBMED: 36670449; PUBMEDCENTRAL: PMC9863213; WOS: 000931396800003

الإتاحة: https://doi.org/10.1186/s40168-022-01457-yTest
https://pasteur.hal.science/pasteur-04086913Test
https://pasteur.hal.science/pasteur-04086913/documentTest
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المؤلفون: Gschwind, Rémi, Ugarcina Perovic, Svetlana, Weiss, Maja, Petitjean, Marie, Lao, Julie, Coelho, Luis Pedro, Ruppé, Etienne

المساهمون: Infection, Anti-microbiens, Modélisation, Evolution (IAME (UMR_S_1137 / U1137)), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité)-Université Sorbonne Paris Nord, Fudan University Shanghai, Danmarks Tekniske Universitet = Technical University of Denmark (DTU), ANR-19-JAMR-0004,EMBARK,Establishing a Monitoring Baseline for Antibiotic Resistance in Key environments(2019)

المصدر: ISSN: 0305-1048.

مصطلحات موضوعية: [SDV]Life Sciences [q-bio]

العلاقة: info:eu-repo/semantics/altIdentifier/pmid/37207327; inserm-04510976; https://inserm.hal.science/inserm-04510976Test; https://inserm.hal.science/inserm-04510976/documentTest; https://inserm.hal.science/inserm-04510976/file/Gschwind%20Nucleic%20Acid%20Research%202023.pdfTest; PUBMED: 37207327; PUBMEDCENTRAL: PMC10320180

الإتاحة: https://doi.org/10.1093/nar/gkad384Test
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https://inserm.hal.science/inserm-04510976/file/Gschwind%20Nucleic%20Acid%20Research%202023.pdfTest

المؤلفون: Dalmasso, Guillaume, Beyrouthy, Racha, Brugiroux, Sandrine, Ruppé, Etienne, Guillouard, Laurent, Bonnin, Virginie, Saint-Sardos, Pierre, Ghozlane, Amine, Gaumet, Vincent, Barnich, Nicolas, Delmas, Julien, Bonnet, Richard

المساهمون: Microbes, Intestin, Inflammation et Susceptibilité de l'Hôte (M2iSH), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre de Recherche en Nutrition Humaine d'Auvergne (CRNH d'Auvergne)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Clermont Auvergne (UCA), Centre National de Référence de la Résistance aux Antibiotiques CHU Clermont-Ferrand (CNR), CHU Clermont-Ferrand, Infection, Anti-microbiens, Modélisation, Evolution (IAME (UMR_S_1137 / U1137)), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité)-Université Sorbonne Paris Nord, AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard Paris, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Hub Bioinformatique et Biostatistique - Bioinformatics and Biostatistics HUB, Institut Pasteur Paris (IP)-Université Paris Cité (UPCité), Bioinformatique évolutive - Evolutionary Bioinformatics, Institut Pasteur Paris (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Imagerie Moléculaire et Stratégies Théranostiques (IMoST), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Clermont Auvergne (UCA)

المصدر: EISSN: 2049-2618 ; Microbiome ; https://hal.science/hal-04205871Test ; Microbiome, 2023, 11 (1), pp.23. ⟨10.1186/s40168-023-01489-y⟩

مصطلحات موضوعية: Antibiotic resistance, Antimicrobial peptides, Colistin, Commensalism, Escherichia coli, Inflammation, Microbiota, Virulence, mcr-1, [SDV.CAN]Life Sciences [q-bio]/Cancer

العلاقة: info:eu-repo/semantics/altIdentifier/pmid/36755345; hal-04205871; https://hal.science/hal-04205871Test; https://hal.science/hal-04205871/documentTest; https://hal.science/hal-04205871/file/s40168-023-01489-y.pdfTest; PUBMED: 36755345; PUBMEDCENTRAL: PMC9909984

الإتاحة: https://doi.org/10.1186/s40168-023-01489-yTest
https://hal.science/hal-04205871Test
https://hal.science/hal-04205871/documentTest
https://hal.science/hal-04205871/file/s40168-023-01489-y.pdfTest

المؤلفون: Hauser, S, Lazarevic, Vladimir, Tournoud, M, Ruppe, Etienne, Santiago Allexant, E, Guigon, G, Schicklin, S, Lanet, V, Girard, Myriam, Mirande, C, Gervasi, G, Schrenzel, Jacques

المصدر: ISSN: 2165-0497 ; Microbiology spectrum, vol. 11, no. 6 (2023) e0129423.

مصطلحات موضوعية: info:eu-repo/classification/ddc/616, HAP-VAP, Absolute quantification, Calibrator, Clinical metagenomics, Diagnosis, Metagenomics threshold, Sample processing control, Spike-in bacteria, Standardization

العلاقة: info:eu-repo/semantics/altIdentifier/pmid/37889000; info:eu-repo/semantics/dataset/url/https://www.ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA771365Test; https://archive-ouverte.unige.ch/unige:175404Test; unige:175404

الإتاحة: https://doi.org/10.1128/spectrum.01294-23Test
https://archive-ouverte.unige.ch/unige:175404Test

المؤلفون: Bengtsson-Palme, Johan, Abramova, Anna, Berendonk, Thomas U., Coelho, Luis Pedro, Forslund, Sofia K., Gschwind, Rémi, Heikinheimo, Annamari, Jarquín-Díaz, Víctor Hugo, Khan, Ayaz Ali, Klümper, Uli, Löber, Ulrike, Nekoro, Marmar, Osińska, Adriana D., Ugarcina Perovic, Svetlana, Pitkänen, Tarja, Rødland, Ernst Kristian, Ruppé, Etienne, Wasteson, Yngvild, Wester, Astrid Louise, Zahra, Rabaab

المصدر: Environment International ; volume 178, page 108089 ; ISSN 0160-4120

مصطلحات موضوعية: General Environmental Science

الإتاحة: https://doi.org/10.1016/j.envint.2023.108089Test
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