المؤلفون: Fabien Le Chevalier, Isabelle Correia, Lucrèce Matheron, Morgan Babin, Mireille Moutiez, Nicolas Canu, Muriel Gondry, Olivier Lequin, Pascal Belin

المصدر: Microbial Cell Factories, Vol 19, Iss 1, Pp 1-16 (2020)

مصطلحات موضوعية: Synthetic biology, Combinatorial biosynthesis, Natural products, 2,5-diketopiperazine, Cyclodipeptide synthase, Cyclodipeptide oxidase, Microbiology, QR1-502

وصف الملف: electronic resource

العلاقة: http://link.springer.com/article/10.1186/s12934-020-01432-yTest; https://doaj.org/toc/1475-2859Test

الوصول الحر: https://doaj.org/article/f25dc7239b8a4460a3d5f4a96e21e08cTest

المؤلفون: Emmanuelle Schmitt, Gabrielle Bourgeois, Muriel Gondry, Alexey Aleksandrov

المصدر: Scientific Reports, Vol 8, Iss 1, Pp 1-11 (2018)

مصطلحات موضوعية: Medicine, Science

وصف الملف: electronic resource

العلاقة: https://doaj.org/toc/2045-2322Test

الوصول الحر: https://doaj.org/article/67204e16422a4345b9f2793575e3a217Test

المؤلفون: Muriel Gondry, Isabelle B. Jacques, Robert Thai, Morgan Babin, Nicolas Canu, Jérôme Seguin, Pascal Belin, Jean-Luc Pernodet, Mireille Moutiez

المصدر: Frontiers in Microbiology, Vol 9 (2018)

مصطلحات موضوعية: secondary metabolites, biosynthetic pathways, cyclodipeptide synthase, tRNA-dependent enzymes, diketopiperazine, activity prediction, Microbiology, QR1-502

وصف الملف: electronic resource

العلاقة: http://journal.frontiersin.org/article/10.3389/fmicb.2018.00046/fullTest; https://doaj.org/toc/1664-302XTest

الوصول الحر: https://doaj.org/article/38fc13c19ddf4b8dbba2bb0e59d6d428Test

المؤلفون: Carine Tellier, Robin Vinck, Robert Thai, Morgan Babin, Nicolas Canu, Mireille Moutiez, Olivier Cinquin, Jean-Christophe Cintrat, Jérôme Seguin, Inès Ajel, Muriel Gondry, Pascal Belin

المساهمون: Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Enzymologie et Biosynthèse Peptidique Non Ribosomale (BIOSYN), Département Microbiologie (Dpt Microbio), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Médicaments et Technologies pour la Santé (MTS), Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), ANR-19-CE44-0012,Flex-Pep,Décrypter les interactions des Synthases de Cyclodipeptides avec leurs substrats aminoacyl-ARNt pour générer des enzymes modifiées(2019)

المصدر: Nucleic Acids Research
Nucleic Acids Research, 2020, 48 (20), ⟨10.1093/nar/gkaa903⟩

مصطلحات موضوعية: AcademicSubjects/SCI00010, [SDV]Life Sciences [q-bio], RNA, Transfer, Amino Acyl, Biology, 010402 general chemistry, environment and public health, 01 natural sciences, 03 medical and health sciences, RNA, Transfer, Genetics, Peptide Synthases, Production pipeline, Enzyme Assays, 030304 developmental biology, chemistry.chemical_classification, 0303 health sciences, ATP synthase, Nucleic Acid Enzymes, Substrate (chemistry), Acceptor, 0104 chemical sciences, Enzyme, Biochemistry, chemistry, Transfer RNA, biology.protein, Transfer RNA Aminoacylation

الوصول الحر: https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_dedup___::28572c70ff192a669dc92cf591f0b786Test
https://doi.org/10.1093/nar/gkaa903Test

المؤلفون: Nicolas Canu, Muriel Gondry, Isabelle Correia, Pascal Belin, Robert Thai, Olivier Lequin, Isabelle Jacques, Pavlina Dubois, Steven G. DuBois, Fabien Le Chevalier, Mireille Moutiez

المساهمون: Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire des biomolécules (LBM UMR 7203), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Département de Chimie - ENS Paris, École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Chimie Moléculaire de Paris Centre (FR 2769), Institut de Chimie du CNRS (INC)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Ecole Superieure de Physique et de Chimie Industrielles de la Ville de Paris (ESPCI Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Service d'Ingénierie Moléculaire pour la Santé (ex SIMOPRO) (SIMoS), Médicaments et Technologies pour la Santé (MTS), Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut Pasteur de Lille, Réseau International des Instituts Pasteur (RIIP), This work was supported by the French Alternative Energies and Atomic Energy Commission (CEA), the French National Centre for Scientific Research (CNRS), the Sorbonne University and the French National Research Agency (grant ANR-16-CE29-0026)., We thank Dr Taek Soon Lee and Melanya Gudzeva from the Lawrence Berkeley National Laboratory for providing us with plasmids pJBEI-3085 and pJBEI-3122., ANR-16-CE29-0026,DKP-COMBIBIO,L'utilisation des voies de biosynthèse dépendant des synthases de cyclodipeptides pour obtenir de nouvelles 2,5-dicétopipérazines bioactives(2016), Chimie Moléculaire de Paris Centre (FR 2769), École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Département de Chimie - ENS Paris, Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC), Institute of Neurosciences and Psychology [Glasgow], University of Glasgow, Institut de Neurosciences de la Timone (INT), Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

المصدر: Scientific Reports, Vol 9, Iss 1, Pp 1-13 (2019)
Scientific Reports
Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2019, 9 (1), pp.9208. ⟨10.1038/s41598-019-45519-y⟩
Scientific Reports, 2019, 9 (1), pp.9208. ⟨10.1038/s41598-019-45519-y⟩

مصطلحات موضوعية: 0301 basic medicine, Stereochemistry, [SDV]Life Sciences [q-bio], lcsh:Medicine, Context (language use), Diketopiperazines, medicine.disease_cause, Article, Indole Alkaloids, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, medicine, Escherichia coli, Moiety, [CHIM]Chemical Sciences, Author Correction, lcsh:Science, 2. Zero hunger, chemistry.chemical_classification, Indole test, Prenylation, Multidisciplinary, Chemistry, Alkaloid, lcsh:R, Bioproduction, 030104 developmental biology, Enzyme, Biocatalysis, lcsh:Q, Mevalonate pathway, Genetic Engineering, Metabolic engineering, 030217 neurology & neurosurgery

الوصول الحر: https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_dedup___::a5a5335bac05615da5e01450efeb2a44Test
http://link.springer.com/article/10.1038/s41598-019-45519-yTest

المؤلفون: Morgan Babin, Alexey Aleksandrov, Hannu Myllykallio, Muriel Gondry, Anastasia Croitoru

المساهمون: Laboratoire d'Optique et Biosciences (LOB), École polytechnique (X)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Aleksandrov, Alexey, ANR-18-CE44-0002,ATMCADD,Modèles atomiques précis pour la conception de médicaments assistée par ordinateur(2018)

المصدر: Biochemistry
Biochemistry, 2021, 60 (1), pp.64-76. ⟨10.1021/acs.biochem.0c00761⟩
Biochemistry, American Chemical Society, 2021, 60 (1), pp.64-76. ⟨10.1021/acs.biochem.0c00761⟩

مصطلحات موضوعية: Models, Molecular, Protein Conformation, alpha-Helical, Subfamily, Structural similarity, Stereochemistry, AlbC, [SDV.BBM.BS] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Structural Biology [q-bio.BM], nonribosomal peptide biosynthesis, RNA, Transfer, Amino Acyl, Biochemistry, Peptides, Cyclic, aa-tRNA utilizing enzymes, Bacterial Proteins, Protein biosynthesis, Cyclodipeptide Synthase, Homology modeling, Peptide Synthases, CDPS, tRNA, binding free energy, Protein subfamily, [SDV.BBM.BS]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Structural Biology [q-bio.BM], Chemistry, diketopiperazine, TRNA binding, Streptomyces, natural product biosynthesis, molecular dynamics, Docking (molecular), Transfer RNA, Mutation

وصف الملف: application/pdf

الوصول الحر: https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_dedup___::536421fea2c3f2cc0198ea4cdb051ca6Test
https://hal.science/hal-03084339Test

المؤلفون: Olivier Lequin, Nicolas Canu, Muriel Gondry, Pascal Belin, Isabelle Correia, Mireille Moutiez, Morgan Babin, Lucrèce Matheron, Fabien Le Chevalier

المساهمون: Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Enzymologie et Biosynthèse Peptidique Non Ribosomale (BIOSYN), Département Microbiologie (Dpt Microbio), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire des biomolécules (LBM UMR 7203), Chimie Moléculaire de Paris Centre (FR 2769), École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Ecole Superieure de Physique et de Chimie Industrielles de la Ville de Paris (ESPCI Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Département de Chimie - ENS Paris, Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Spectrométrie de Masse et Protéomique [IBPS] (IBPS-SPM), Institut de Biologie Paris Seine (IBPS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), ANR-16-CE29-0026,DKP-COMBIBIO,L'utilisation des voies de biosynthèse dépendant des synthases de cyclodipeptides pour obtenir de nouvelles 2,5-dicétopipérazines bioactives(2016)

المصدر: Microbial Cell Factories
Microbial Cell Factories, 2020, 19 (1), pp.178. ⟨10.1186/s12934-020-01432-y⟩
Microbial Cell Factories, Vol 19, Iss 1, Pp 1-16 (2020)

مصطلحات موضوعية: Combinatorial biosynthesis, Cyclodipeptide synthase, 2,5-diketopiperazine, [SDV]Life Sciences [q-bio], lcsh:QR1-502, Bioengineering, Diketopiperazines, 5-diketopiperazine, medicine.disease_cause, 01 natural sciences, Applied Microbiology and Biotechnology, lcsh:Microbiology, 03 medical and health sciences, chemistry.chemical_compound, Synthetic biology, Biosynthesis, Escherichia coli, medicine, Peptide Synthases, Phylogeny, 030304 developmental biology, chemistry.chemical_classification, Natural products, 0303 health sciences, 010405 organic chemistry, Research, 2,5-Diketopiperazine, Bioproduction, Biosynthetic Pathways, 0104 chemical sciences, Enzyme, chemistry, Biochemistry, Chemical diversity, Cyclodipeptide oxidase, Oxidoreductases, Biotechnology

الوصول الحر: https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_dedup___::faa52651c4bff891a3553dfcd2513e68Test
https://doi.org/10.1186/s12934-020-01432-yTest

المؤلفون: Mireille Moutiez, Muriel Gondry, Pascal Belin, Nicolas Canu

المساهمون: Enzymologie et Biosynthèse Peptidique Non Ribosomale (BIOSYN), Département Microbiologie (Dpt Microbio), Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), ANR-16-CE29-0026,DKP-COMBIBIO,L'utilisation des voies de biosynthèse dépendant des synthases de cyclodipeptides pour obtenir de nouvelles 2,5-dicétopipérazines bioactives(2016)

المصدر: Natural Product Reports
Natural Product Reports, Royal Society of Chemistry, 2020, ⟨10.1039/c9np00036d⟩
Natural Product Reports, 2020, ⟨10.1039/c9np00036d⟩

مصطلحات موضوعية: 0303 health sciences, 010405 organic chemistry, [SDV]Life Sciences [q-bio], Organic Chemistry, Computational biology, Diketopiperazines, Biology, Protein Engineering, 01 natural sciences, Biochemistry, 0104 chemical sciences, Substrate Specificity, 03 medical and health sciences, Drug Discovery, Amino Acids, Peptide Synthases, ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, 030304 developmental biology, Biotechnology

الوصول الحر: https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_dedup___::00e47fd6854eb455c1f591b7c2be86a8Test
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02415937Test

المؤلفون: Pavlina Dubois, Robert Thai, Mireille Moutiez, Steven G. DuBois, Muriel Gondry, Pascal Belin, Isabelle Correia, Nicolas Canu, Fabien Le Chevalier, Olivier Lequin, Isabelle Jacques

المساهمون: Enzymologie et Biosynthèse Peptidique Non Ribosomale (BIOSYN), Département Microbiologie (Dpt Microbio), Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

المصدر: Scientific Reports
Scientific Reports, Nature Publishing Group, 2019, 9 (1), pp.15009. ⟨10.1038/s41598-019-51404-5⟩
Scientific Reports, 2019, 9 (1), pp.15009. ⟨10.1038/s41598-019-51404-5⟩
Scientific Reports, Vol 9, Iss 1, Pp 1-2 (2019)

مصطلحات موضوعية: Indole test, 0303 health sciences, Multidisciplinary, Chemistry, [SDV]Life Sciences [q-bio], lcsh:R, lcsh:Medicine, medicine.disease_cause, 3. Good health, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Biochemistry, Prenylation, medicine, lcsh:Q, lcsh:Science, Reprogramming, Escherichia coli, 030217 neurology & neurosurgery, 030304 developmental biology

الوصول الحر: https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_dedup___::8263d20188764cd714303519890bc22aTest
https://doi.org/10.1038/s41598-019-51404-5Test

المؤلفون: Ludovic Sauguet, Mireille Moutiez, Yan Li, Pascal Belin, Jérôme Seguin, Marie-hélène Le Du, Robert Thai, Cédric Masson, Matthieu Fonvielle, Jean-luc Pernodet, Jean-baptiste Charbonnier, Muriel Gondry

المساهمون: The Pennsylvania State University CiteSeerX Archives

المصدر: ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/pub/pmc/6b/9a/Nucleic_Acids_Res_2011_May_3_39(10)_4475-4489.tar.gz

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العلاقة: http://citeseerx.ist.psu.edu/viewdoc/summary?doi=10.1.1.290.3963Test