المؤلفون: Bisio, Hugo, Legendre, Matthieu, Giry, Claire, Philippe, Nadege, Alempic, Jean-Marie, Jeudy, Sandra, Abergel, Chantal

المساهمون: Information génomique et structurale (IGS), Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

المصدر: ISSN: 2041-1723.

مصطلحات موضوعية: Nucleocytoviricota pandoravirus mollivirus phycodnavirus mimivirus CRISPR Acanthamoeba evolution genetic robustness NCLDV, Nucleocytoviricota, pandoravirus, mollivirus, phycodnavirus, mimivirus, CRISPR, Acanthamoeba, evolution, genetic robustness, NCLDV, MESH: DNA Viruses, MESH: CRISPR-Cas Systems, MESH: Acanthamoeba castellanii, MESH: Giant Viruses, MESH: Viruses, MESH: Genome, Viral, MESH: Phylogeny, MESH: Evolution, Molecular, [SDV.MP.VIR]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Virology

العلاقة: info:eu-repo/semantics/altIdentifier/pmid/36702819; hal-03962773; https://hal.science/hal-03962773Test; https://hal.science/hal-03962773/documentTest; https://hal.science/hal-03962773/file/HugoCrisp.pdfTest; PUBMED: 36702819; PUBMEDCENTRAL: PMC9879987

الإتاحة: https://doi.org/10.1038/s41467-023-36145-4Test
https://hal.science/hal-03962773Test
https://hal.science/hal-03962773/documentTest
https://hal.science/hal-03962773/file/HugoCrisp.pdfTest

المؤلفون: Bisio, Hugo, Legendre, Matthieu, Giry, Claire, Philippe, Nadège, Alempic, Jean-Marie, Jeudy, Sandra, Abergel, Chantal

المساهمون: Information génomique et structurale (IGS), Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

المصدر: https://hal.science/hal-03810585Test ; 2022.

مصطلحات موضوعية: [SDV]Life Sciences [q-bio]

العلاقة: hal-03810585; https://hal.science/hal-03810585Test; BIORXIV: 2022.08.18.504477

الإتاحة: https://doi.org/10.1101/2022.08.18.504477Test
https://hal.science/hal-03810585Test

المؤلفون: Liu, Yang, Bisio, Hugo, Toner, Chelsea, Marie, Jeudy, Sandra, Philippe, Nadege, Zhou, Keda, Bowerman, Samuel, White, Alison, Edwards, Garrett, Abergel, Chantal, Luger, Karolin

المساهمون: Nanyang Technological University Singapour, Information génomique et structurale (IGS), Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institute for Advanced Biosciences / Institut pour l'Avancée des Biosciences (Grenoble) (IAB), Centre Hospitalier Universitaire CHU Grenoble (CHUGA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Etablissement français du sang - Auvergne-Rhône-Alpes (EFS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA), University of Colorado Boulder, European Project: 832601,Cells and giant viruses: a win-win co-evolution

المصدر: ISSN: 0092-8674.

مصطلحات موضوعية: NCLDV giant virus viral nucleosome doublet histone, Analytical, Ultracentrifugation cryo-EM viral factory histone tail acidic patch non-eukaryotic nucleosome nucleosome-like-particle, Melbournevirus genetics, KO fitness impact, [SDV]Life Sciences [q-bio]

العلاقة: info:eu-repo/grantAgreement//832601/EU/VIREVOL /Cells and giant viruses: a win-win co-evolution; hal-03329028; https://amu.hal.science/hal-03329028Test; https://amu.hal.science/hal-03329028/documentTest; https://amu.hal.science/hal-03329028/file/1-s2.0-S0092867421008230-main.pdfTest

الإتاحة: https://doi.org/10.1016/j.cell.2021.06.032Test
https://amu.hal.science/hal-03329028Test
https://amu.hal.science/hal-03329028/documentTest
https://amu.hal.science/hal-03329028/file/1-s2.0-S0092867421008230-main.pdfTest

المؤلفون: Jeudy, Sandra, Bertaux, Lionel, Alempic, Jean-Marie, Lartigue, Audrey, Legendre, Matthieu, Belmudes, Lucid, Santini, Sébastien, Philippe, Nadège, Beucher, Laure, Biondi, Emanuele, G, Juul, Sissel, Turner, Daniel J., Couté, Yohann, Claverie, Jean-Michel, Abergel, Chantal

المساهمون: Information génomique et structurale (IGS), Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Institute for Advanced Biosciences / Institut pour l'Avancée des Biosciences (Grenoble) (IAB), Centre Hospitalier Universitaire CHU Grenoble (CHUGA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Etablissement français du sang - Auvergne-Rhône-Alpes (EFS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Grenoble Alpes (UGA), Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Laboratoire de chimie bactérienne (LCB), Duke University Durham, Oxford Nanopore Technologies, Etude de la dynamique des protéomes (EDyP ), Laboratoire de Biologie à Grande Échelle (BGE - UMR S1038), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Grenoble Alpes (UGA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Grenoble Alpes (UGA), The Fondation Bettencourt Schueller (OTP51251) and the Provence-Alpes-Côte-d’Azur région (2010 12125), ANR-11-INBS-0013,IFB (ex Renabi-IFB),Institut français de bioinformatique(2011), ANR-10-INBS-0008,ProFI,Infrastructure Française de Protéomique(2010)

المصدر: ISSN: 1751-7362.

مصطلحات موضوعية: Cellular microbiology, Virology, [SDV.MP.VIR]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Virology

العلاقة: info:eu-repo/semantics/altIdentifier/pmid/31822788; hal-02409597; https://amu.hal.science/hal-02409597Test; https://amu.hal.science/hal-02409597/documentTest; https://amu.hal.science/hal-02409597/file/s41396-019-0565-y.pdfTest; PUBMED: 31822788

الإتاحة: https://doi.org/10.1038/s41396-019-0565-yTest
https://amu.hal.science/hal-02409597Test
https://amu.hal.science/hal-02409597/documentTest
https://amu.hal.science/hal-02409597/file/s41396-019-0565-y.pdfTest

المؤلفون: Jeudy, Sandra, Rigou, Sofia, Alempic, Jean-Marie, Claverie, Jean-Michel, Abergel, Chantal, Legendre, Matthieu

المساهمون: Information génomique et structurale (IGS), Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)

المصدر: ISSN: 2041-1723.

مصطلحات موضوعية: [SDV.MP.VIR]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Virology

العلاقة: hal-02634342; https://hal.science/hal-02634342Test; https://hal.science/hal-02634342/documentTest; https://hal.science/hal-02634342/file/Jeudy_et_al-2020-Nature_Communications.pdfTest

الإتاحة: https://doi.org/10.1038/s41467-020-16414-2Test
https://hal.science/hal-02634342Test
https://hal.science/hal-02634342/documentTest
https://hal.science/hal-02634342/file/Jeudy_et_al-2020-Nature_Communications.pdfTest

المؤلفون: Bertaux, Lionel, Lartigue, Audrey, Jeudy, Sandra

المساهمون: Information génomique et structurale (IGS), Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

المصدر: ISSN: 2331-8325 ; Bio-protocol ; https://hal.science/hal-03139695Test ; Bio-protocol , 2020, 10 (22), ⟨10.21769/BioProtoc.3827⟩.

مصطلحات موضوعية: Giant viruses, Mimivirus, CsCl density gradient, Virion purification, Ultracentrifugation, [SDV.MP.VIR]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Virology

العلاقة: hal-03139695; https://hal.science/hal-03139695Test; https://hal.science/hal-03139695/documentTest; https://hal.science/hal-03139695/file/protocole_purif.pdfTest

الإتاحة: https://doi.org/10.21769/BioProtoc.3827Test
https://hal.science/hal-03139695Test
https://hal.science/hal-03139695/documentTest
https://hal.science/hal-03139695/file/protocole_purif.pdfTest

المؤلفون: Legendre, Matthieu, Alempic, Jean-Marie, Philippe, Nadège, Lartigue, Audrey, Jeudy, Sandra, Poirot, Olivier, Ta, Ngan Thi, Nin, Sébastien, Couté, Yohann, Abergel, Chantal, Claverie, Jean-Michel

المساهمون: Information génomique et structurale (IGS), Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Etude de la dynamique des protéomes (EDyP ), Laboratoire de Biologie à Grande Échelle (BGE - UMR S1038), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes 2016-2019 (UGA 2016-2019 )-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Grenoble Alpes 2016-2019 (UGA 2016-2019 )-Institut de Recherche Interdisciplinaire de Grenoble (IRIG), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), This work was partially supported by the French National Research Agency (ANR-14-CE14-0023-01), France Genomique (ANR-10-INSB-01-01), Institut Français de Bioinformatique (ANR–11–INSB–0013), the Fondation Bettencourt-Schueller (OTP51251), by a DGA-MRIS scholarship, and by the Provence-Alpes-Côte-d’Azur région (2010 12125). Proteomic experiments were partly supported by the Proteomics French Infrastructure (ANR-10-INBS-08-01) and Labex GRAL (ANR-10-LABX-49-01). We thank the support of the discovery platform and informatics group at EDyP and the PACA-Bioinfo platform., ANR-14-CE14-0023,Pandoravirus,Caractérisation fonctionnelle et moléculaire des Pandoravirus(2014), ANR-10-INBS-0009,France Génomique,Organisation et montée en puissance d'une Infrastructure Nationale de Génomique(2010), ANR-11-INBS-0013,IFB (ex Renabi-IFB),Institut français de bioinformatique(2011), ANR-10-INBS-0008,ProFI,Infrastructure Française de Protéomique(2010), ANR-10-LABX-0049,GRAL,Grenoble Alliance for Integrated Structural Cell Biology(2010)

المصدر: ISSN: 1664-302X.

مصطلحات موضوعية: de novo gene creation, comparative genomics, Acanthamoeba, giant viruses, soil viruses, hAT transposase, [SDV.MP.VIR]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Virology, [SDV.BBM.GTP]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Genomics [q-bio.GN]

العلاقة: hal-02135607; https://hal.science/hal-02135607Test; https://hal.science/hal-02135607/documentTest; https://hal.science/hal-02135607/file/Pandoravirus%20Celtis%20Illustrates%20the%20Microevolution%20Processes%20at%20Work%20in%20the%20Giant%20Pandoraviridae%20Genomes.pdfTest

الإتاحة: https://doi.org/10.3389/fmicb.2019.00430Test
https://hal.science/hal-02135607Test
https://hal.science/hal-02135607/documentTest
https://hal.science/hal-02135607/file/Pandoravirus%20Celtis%20Illustrates%20the%20Microevolution%20Processes%20at%20Work%20in%20the%20Giant%20Pandoraviridae%20Genomes.pdfTest

المؤلفون: Poirot, Olivier, Jeudy, Sandra, Abergel, Chantal, Claverie, Jean-Michel

المساهمون: Information génomique et structurale (IGS), Aix Marseille Université (AMU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

المصدر: ISSN: 0022-538X.

مصطلحات موضوعية: 16 Genome composition, DNA editing, Host - virus relationship, Chaos Game Representation, Pandoravirus, Giant viruses, 4 - mer statistics, [SDV.MP.VIR]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Virology

العلاقة: info:eu-repo/semantics/altIdentifier/pmid/31534042; hal-02314004; https://amu.hal.science/hal-02314004Test; https://amu.hal.science/hal-02314004/documentTest; https://amu.hal.science/hal-02314004/file/Journal%20of%20Virology-2019-Poirot-JVI.01206-19.full.pdfTest; PUBMED: 31534042

الإتاحة: https://doi.org/10.1128/JVI.01206-19Test
https://amu.hal.science/hal-02314004Test
https://amu.hal.science/hal-02314004/documentTest
https://amu.hal.science/hal-02314004/file/Journal%20of%20Virology-2019-Poirot-JVI.01206-19.full.pdfTest

المؤلفون: Jeudy, Sandra, Bertaux, Lionel, Alempic, Jean-Marie, Lartigue, Audrey, Legendre, Matthieu, Belmudes, Lucid, Santini, Sébastien, Philippe, Nadège, Beucher, Laure, Biondi, Emanuele G, Juul, Sissel, Turner, Daniel J, Couté, Yohann, Claverie, Jean-Michel, Abergel, Chantal

المساهمون: Agence Nationale de la Recherche, Fondation Bettencourt Schueller, Provence-Alpes-Côte-d’Azur région, Institut Français de Bioinformatique

المصدر: The ISME Journal ; volume 14, issue 3, page 727-739 ; ISSN 1751-7362 1751-7370

مصطلحات موضوعية: Ecology, Evolution, Behavior and Systematics, Microbiology

الإتاحة: https://doi.org/10.1038/s41396-019-0565-yTest
https://www.nature.com/articles/s41396-019-0565-y.pdfTest
https://www.nature.com/articles/s41396-019-0565-yTest
https://academic.oup.com/ismej/article-pdf/14/3/727/55523725/41396_2019_article_565.pdfTest

المؤلفون: Legendre, Matthieu, Lartigue, Audrey, Bertaux, Lionel, Jeudy, Sandra, Bartoli, Julia, Lescot, Magali, Alempic, Jean-Marie, Ramus, Claire, Bruley, Christophe, Labadie, Karine, Shmakova, Lyubov, Rivkina, Elizaveta, Couté, Yohann, Abergel, Chantal, Claverie, Jean-Michel

المصدر: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2015 Sep . 112(38), E5327-E5335.

الوصول الحر: https://www.jstor.org/stable/26465169Test