المؤلفون: Gschwind, Rémi, Petitjean, Marie, Fournier, Claudine, Lao, Julie, Clermont, Olivier, Nordmann, Patrice, Mellmann, Alexander, Denamur, Erick, Poirel, Laurent, Ruppé, Etienne

المساهمون: Uhlemann, Anne-Catrin, French Ministry of Defense | Direction Générale de l'Armement, Joint Programming Initiative on Antimicrobial Resistance, Universität Freiburg | National Center of Competence in Research Bio-Inspired Materials, University of Fribourg, Swiss national science foundation, Laboratoire Europeen Associe, INSERM "Emerging antibiotic resistance in Gram-negative bacteria"

المصدر: Antimicrobial Agents and Chemotherapy ; volume 68, issue 4 ; ISSN 0066-4804 1098-6596

الإتاحة: https://doi.org/10.1128/aac.01459-23Test

المؤلفون: Royer, Guilhem, Clermont, Olivier, Marin, Julie, Condamine, Bénédicte, Dion, Sara, Blanquart, François, Galardini, Marco, Denamur, Erick

المساهمون: Infection, Anti-microbiens, Modélisation, Evolution (IAME (UMR_S_1137 / U1137)), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité)-Université Sorbonne Paris Nord, CHU Henri Mondor Créteil, Analyse Bio-Informatique pour la Génomique et le Métabolisme (LABGeM), Génomique métabolique (UMR 8030), Genoscope - Centre national de séquençage Evry (GENOSCOPE), Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Genoscope - Centre national de séquençage Evry (GENOSCOPE), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Écologie et Évolution de la Résistance aux Antibiotiques / Ecology and Evolution of Antibiotics Resistance (EERA), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris-Saclay-Université Paris Cité (UPCité)-Microbiologie Intégrative et Moléculaire (UMR6047), Institut Pasteur Paris (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut Pasteur Paris (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Génétique des génomes - Genetics of Genomes (UMR 3525), Institut Pasteur Paris (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité), Centre interdisciplinaire de recherche en biologie (CIRB), Labex MemoLife, École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Collège de France (CdF (institution))-Ecole Superieure de Physique et de Chimie Industrielles de la Ville de Paris (ESPCI Paris), Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Medizinische Hochschule Hannover = Hannover Medical School (MHH), AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard Paris, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), This work was partially supported by the “Fondation pour la Recherche Médicale” Equipe FRM 2016, grant number DEQ20161136698 to E.D. M.G. was funded by the Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG, German Research Foundation) under Germany’s Excellence Strategy - EXC 2155 - project number 390874280. G.R. was partially supported by the Agence Nationale de la Recherche under the French national action Plan on AntiMicrobial Resistance (PAMR) – project SEQ2DIAG (ANR-20-PAMR-0010)., ANR-20-PAMR-0010,Seq2DiAg,Séquençage du génome entier et intelligence artificielle pour caratériser et diagnostiquer la résistance aux antibiotiques et la capacité d'échapper au traitement(2020)

المصدر: ISSN: 2041-1723.

مصطلحات موضوعية: [SDV.MP]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology

العلاقة: info:eu-repo/semantics/altIdentifier/pmid/37339949; hal-04275628; https://hal.science/hal-04275628Test; https://hal.science/hal-04275628/documentTest; https://hal.science/hal-04275628/file/s41467-023-39428-y.pdfTest; PUBMED: 37339949; PUBMEDCENTRAL: PMC10282060

الإتاحة: https://doi.org/10.1038/s41467-023-39428-yTest
https://hal.science/hal-04275628Test
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المؤلفون: Bhattacharjee, Amrita, Sands, Kirsty, Mitra, Shravani, Basu, Ritojeet, Saha, Bijan, Clermont, Olivier, Dutta, Shanta, Basu, Sulagna, Papp-Wallace, Krisztina M., Saito, Jumpei

وصف الملف: application/pdf

العلاقة: https://orca.cardiff.ac.uk/id/eprint/162983/1/bhattacharjee-et-al-2023-a-decade-long-evaluation-of-neonatal-septicaemic-escherichia-coli-clonal-lineages-genomes-and.pdfTest; Bhattacharjee, Amrita, Sands, Kirsty https://orca.cardiff.ac.uk/view/cardiffauthors/A451810P.htmlTest, Mitra, Shravani, Basu, Ritojeet, Saha, Bijan, Clermont, Olivier, Dutta, Shanta, Basu, Sulagna, Papp-Wallace, Krisztina M. and Saito, Jumpei 2023. A decade-long evaluation of neonatal septicaemic escherichia coli: Clonal lineages, genomes, and New Delhi metallo-beta-lactamase variants. Microbiology Spectrum 11 (4) 10.1128/spectrum.05215-22 https://doi.org/10.1128/spectrum.05215-22Test file https://orca.cardiff.ac.uk/id/eprint/162983/1/bhattacharjee-et-al-2023-a-decade-long-evaluation-of-neonatal-septicaemic-escherichia-coli-clonal-lineages-genomes-and.pdfTest

الإتاحة: https://doi.org/10.1128/spectrum.05215-22Test
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المؤلفون: Burgaya, Judit, Marin, Julie, Royer, Guilhem, Condamine, Bénédicte, Gachet, Benoit, Clermont, Olivier, Jaureguy, Françoise, Burdet, Charles, Lefort, Agnès, de Lastours, Victoire, Denamur, Erick, Galardini, Marco, Blanquart, François

المصدر: PLoS Genet

مصطلحات موضوعية: Research Article

العلاقة: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC10395866Test/; http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/37531401Test; http://dx.doi.org/10.1371/journal.pgen.1010842Test

الإتاحة: https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1010842Test
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC10395866Test/
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/37531401Test

المؤلفون: Clermont, Olivier, Condamine, Benedicte, Dion, Sara, Gordon, David, Denamur, Erick

المصدر: Environmental Microbiology ; https://doi-org.virtual.anu.edu.au/10.1111/1462-2920.15742Test

وصف الملف: application/pdf

العلاقة: http://hdl.handle.net/1885/289396Test; https://openresearch-repository.anu.edu.au/bitstream/1885/289396/3/TMP913324773202341992859.pdf.jpgTest

الإتاحة: https://doi.org/10.1111/1462-2920.15742Test
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المؤلفون: Denamur, Erick, Clermont, Olivier, Bonacorsi, Stephane, Gordon, David

المصدر: Nature Reviews Microbiology

وصف الملف: application/pdf

العلاقة: http://hdl.handle.net/1885/283922Test; https://openresearch-repository.anu.edu.au/bitstream/1885/283922/3/s41579-020-0416-x.pdf.jpgTest

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المؤلفون: Sokal, Aurélien, Royer, Guilhem, Esposito-Farese, Marina, Clermont, Olivier, Condamine, Bénédicte, Laouénan, Cedric, Lefort, Agnès, Denamur, Erick, Lastours, Victoire de, Groups, for the Colibafi Septicoli and Coliville

المصدر: Journal of Infectious Diseases; 6/15/2024, Vol. 229 Issue 6, p1679-1687, 9p

مصطلحات موضوعية: ESCHERICHIA coli diseases, SEPTIC shock, DRUG resistance in bacteria, ESCHERICHIA coli

المؤلفون: Denamur, Erick, Condamine, Bénédicte, Esposito-Farese, Marina, Royer, Guilhem, Clermont, Olivier, Laouenan, Cédric, Lefort, Agnès, Lastours, Victoire De, Galardini, Marco, Colibafi, The, Groups, Septicoli

المساهمون: Infection, Anti-microbiens, Modélisation, Evolution (IAME (UMR_S_1137 / U1137)), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité)-Université Sorbonne Paris Nord, AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard Paris, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Centre d'investigation Clinique CHU Bichat - Épidémiologie clinique (CIC 1425), Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Analyse Bio-Informatique pour la Génomique et le Métabolisme (LABGeM), Génomique métabolique (UMR 8030), Genoscope - Centre national de séquençage Evry (GENOSCOPE), Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Genoscope - Centre national de séquençage Evry (GENOSCOPE), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Hôpital Henri Mondor, Hôpital Beaujon AP-HP, Service de médecine interne, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Beaujon AP-HP, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Université Paris Cité (UPCité), Centre for Experimental and Clinical Infection Research (TWINCORE), Helmholtz Centre for Infection Research (HZI)-Medizinische Hochschule Hannover = Hannover Medical School (MHH), Medizinische Hochschule Hannover = Hannover Medical School (MHH), ANR-15-CE17-0019,SEPTICOLI,Facteurs pronostiques des septicémies à Escherichia coli face à l'émergence de clones multirésistants, score de gravité et implications thérapeutiques.(2015)

المصدر: ISSN: 1553-7404 ; Plos Genetics ; https://hal.science/hal-04281353Test ; Plos Genetics, 2022, 18 (3), pp.e1010112. ⟨10.1371/journal.pgen.1010112⟩.

مصطلحات موضوعية: [SDV]Life Sciences [q-bio]

العلاقة: hal-04281353; https://hal.science/hal-04281353Test; https://hal.science/hal-04281353/documentTest; https://hal.science/hal-04281353/file/journal.pgen.1010112.pdfTest

الإتاحة: https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1010112Test
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المؤلفون: Marin, Julie, Clermont, Olivier, Royer, Guilhem, Mercier-Darty, Mélanie, Decousser, Jean Winoc, Tenaillon, Olivier, Denamur, Erick, Blanquart, François

المساهمون: Infection, Anti-microbiens, Modélisation, Evolution (IAME (UMR_S_1137 / U1137)), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité)-Université Sorbonne Paris Nord, Hôpital Henri Mondor, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Henri Mondor-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Analyse Bio-Informatique pour la Génomique et le Métabolisme (LABGeM), Génomique métabolique (UMR 8030), Genoscope - Centre national de séquençage Evry (GENOSCOPE), Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Genoscope - Centre national de séquençage Evry (GENOSCOPE), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Dynamic Microbiology - EA 7380 (DYNAMIC), École nationale vétérinaire - Alfort (ENVA)-Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES)-Université Paris-Est (UPE)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12), Laboratoire de Génétique Moléculaire Hôpital Bichat, AP-HP - Hôpital Bichat - Claude Bernard Paris, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), Centre interdisciplinaire de recherche en biologie (CIRB), Labex MemoLife, École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Collège de France (CdF (institution))-Ecole Superieure de Physique et de Chimie Industrielles de la Ville de Paris (ESPCI Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), J.M. and F.B. were funded by the CNRS Momentum grant to F.B. E.D. was partially supported by the “Fondation pour la Recherche Médicale” (Equipe FRM 2016, grant number DEQ20161136698). G.R. was supported by a “Poste d’accueil” funded by the Assistance-Publique Hôpitaux de Paris (AP-HP) and the Commissariat à l’Energie Atomique et aux Energies Alternatives (CEA) personal grant for his PhD.

المصدر: ISSN: 0099-2240.

مصطلحات موضوعية: antibiotic resistance, commensal, Escherichia coli, evolution, genomics, virulence, MESH: Escherichia coli Infections, MESH: Escherichia coli, MESH: Metagenomics, MESH: Phylogeny, [SDV.MP.BAC]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Bacteriology, [SDV.GEN.GPO]Life Sciences [q-bio]/Genetics/Populations and Evolution [q-bio.PE], [SDV.BID.EVO]Life Sciences [q-bio]/Biodiversity/Populations and Evolution [q-bio.PE]

العلاقة: info:eu-repo/semantics/altIdentifier/pmid/35862685; hal-03835685; https://hal.science/hal-03835685Test; https://hal.science/hal-03835685/documentTest; https://hal.science/hal-03835685/file/Marin%20et%20al.%20Denamur%20Blanquart%20AEM%202022%20virulence%20and%20resistance%20France.pdfTest; BIORXIV: 2021.06.24.449745.1; PUBMED: 35862685; PUBMEDCENTRAL: PMC9361829

الإتاحة: https://doi.org/10.1128/aem.00664-22Test
https://hal.science/hal-03835685Test
https://hal.science/hal-03835685/documentTest
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المؤلفون: Royer, Guilhem, Ortiz de la Rosa, Jose-Manuel, Vuillemin, Xavier, Lacombe, Béatrice, Chau, Françoise, Clermont, Olivier, Mercier-Darty, Mélanie, Decousser, Jean-Winoc, Ricard, Jean-Damien, Nordmann, Patrice, Denamur, Erick, Poirel, Laurent

المصدر: Antimicrob Agents Chemother

مصطلحات موضوعية: Mechanisms of Resistance

العلاقة: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8923171Test/; http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/35225650Test; http://dx.doi.org/10.1128/aac.01972-21Test

الإتاحة: https://doi.org/10.1128/aac.01972-21Test
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8923171Test/
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/35225650Test