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1دورية أكاديمية
المؤلفون: Anne Guichard, Fabrice Legeai, Denis Tagu, Claire Lemaitre
المصدر: BMC Bioinformatics, Vol 24, Iss 1, Pp 1-17 (2023)
مصطلحات موضوعية: Local assembly, Gap-filling, Linked-reads, Barcode, Computer applications to medicine. Medical informatics, R858-859.7, Biology (General), QH301-705.5
وصف الملف: electronic resource
العلاقة: https://doaj.org/toc/1471-2105Test
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2دورية أكاديمية
المؤلفون: Daniel J Richter, Romain Watteaux, Thomas Vannier, Jade Leconte, Paul Frémont, Gabriel Reygondeau, Nicolas Maillet, Nicolas Henry, Gaëtan Benoit, Ophélie Da Silva, Tom O Delmont, Antonio Fernàndez-Guerra, Samir Suweis, Romain Narci, Cédric Berney, Damien Eveillard, Frederick Gavory, Lionel Guidi, Karine Labadie, Eric Mahieu, Julie Poulain, Sarah Romac, Simon Roux, Céline Dimier, Stefanie Kandels, Marc Picheral, Sarah Searson, Tara Oceans Coordinators, Stéphane Pesant, Jean-Marc Aury, Jennifer R Brum, Claire Lemaitre, Eric Pelletier, Peer Bork, Shinichi Sunagawa, Fabien Lombard, Lee Karp-Boss, Chris Bowler, Matthew B Sullivan, Eric Karsenti, Mahendra Mariadassou, Ian Probert, Pierre Peterlongo, Patrick Wincker, Colomban de Vargas, Maurizio Ribera d'Alcalà, Daniele Iudicone, Olivier Jaillon
المصدر: eLife, Vol 11 (2022)
مصطلحات موضوعية: plankton biogeography, metagenomics, metabarcoding, microbial oceanography, Medicine, Science, Biology (General), QH301-705.5
وصف الملف: electronic resource
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3دورية أكاديمية
المؤلفون: Wesley J. Delage, Julien Thevenon, Claire Lemaitre
المصدر: BMC Genomics, Vol 21, Iss 1, Pp 1-17 (2020)
مصطلحات موضوعية: Short reads, Variant calling, Structural variants, Insertions, Biotechnology, TP248.13-248.65, Genetics, QH426-470
وصف الملف: electronic resource
العلاقة: http://link.springer.com/article/10.1186/s12864-020-07125-5Test; https://doaj.org/toc/1471-2164Test
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4دورية أكاديمية
المؤلفون: Fabrice Legeai, Bernardo F. Santos, Stéphanie Robin, Anthony Bretaudeau, Rebecca B. Dikow, Claire Lemaitre, Véronique Jouan, Marc Ravallec, Jean-Michel Drezen, Denis Tagu, Frédéric Baudat, Gabor Gyapay, Xin Zhou, Shanlin Liu, Bruce A. Webb, Seán G. Brady, Anne-Nathalie Volkoff
المصدر: BMC Biology, Vol 18, Iss 1, Pp 1-23 (2020)
مصطلحات موضوعية: Endogenous virus architecture, Polydnavirus, Parasitoid wasp, Koinobiont, Campopleginae, IVSPERs, Biology (General), QH301-705.5
وصف الملف: electronic resource
العلاقة: http://link.springer.com/article/10.1186/s12915-020-00822-3Test; https://doaj.org/toc/1741-7007Test
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5دورية أكاديمية
المؤلفون: Cervin Guyomar, Fabrice Legeai, Emmanuelle Jousselin, Christophe Mougel, Claire Lemaitre, Jean-Christophe Simon
المصدر: Microbiome, Vol 6, Iss 1, Pp 1-21 (2018)
مصطلحات موضوعية: Host-microbiota interactions, Aphids, Metagenomics, Symbiosis, Phylogeny, Microbial ecology, QR100-130
وصف الملف: electronic resource
العلاقة: http://link.springer.com/article/10.1186/s40168-018-0562-9Test; https://doaj.org/toc/2049-2618Test
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6دورية أكاديمية
المؤلفون: Jérémy Gauthier, Charlotte Mouden, Tomasz Suchan, Nadir Alvarez, Nils Arrigo, Chloé Riou, Claire Lemaitre, Pierre Peterlongo
المصدر: PeerJ, Vol 8, p e9291 (2020)
مصطلحات موضوعية: RAD-seq, SNPs, Reference-free, Insertions, Deletions, Variants, Medicine, Biology (General), QH301-705.5
وصف الملف: electronic resource
العلاقة: https://peerj.com/articles/9291.pdfTest; https://peerj.com/articles/9291Test/; https://doaj.org/toc/2167-8359Test
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7دورية أكاديمية
المؤلفون: Gaëtan Benoit, Pierre Peterlongo, Mahendra Mariadassou, Erwan Drezen, Sophie Schbath, Dominique Lavenier, Claire Lemaitre
المصدر: PeerJ Computer Science, Vol 2, p e94 (2016)
مصطلحات موضوعية: Comparative metagenomics, k-mer, k-mer counting, Metagenomic, Large scale, Ecological distance, Electronic computers. Computer science, QA75.5-76.95
وصف الملف: electronic resource
العلاقة: https://peerj.com/articles/cs-94.pdfTest; https://peerj.com/articles/cs-94Test/; https://doaj.org/toc/2376-5992Test
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8
المؤلفون: Jérémy Gauthier, Joana Meier, Fabrice Legeai, Melanie McClure, Annabel Whibley, Anthony Bretaudeau, Hélène Boulain, Hugues Parrinello, Sam T. Mugford, Richard Durbin, Chenxi Zhou, Shane McCarthy, Christopher W. Wheat, Florence Piron‐Prunier, Christelle Monsempes, Marie‐Christine François, Paul Jay, Camille Noûs, Emma Persyn, Emmanuelle Jacquin‐Joly, Camille Meslin, Nicolas Montagné, Claire Lemaitre, Marianne Elias
المساهمون: Natural History Museum [Geneva], Department of Zoology [Cambridge], University of Cambridge [UK] (CAM), Institut de Génétique, Environnement et Protection des Plantes (IGEPP), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro Rennes Angers, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT), Scalable, Optimized and Parallel Algorithms for Genomics (GenScale), Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-GESTION DES DONNÉES ET DE LA CONNAISSANCE (IRISA-D7), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Rennes 1 (UR1), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Institut de Systématique, Evolution, Biodiversité (ISYEB ), Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université des Antilles (UA), Laboratoire Ecologie, Evolution, Interactions des Systèmes amazoniens (LEEISA), Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Université de Guyane (UG)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), School of Biological Sciences [Auckland], University of Auckland [Auckland], Department of Ecology and Evolution [Lausanne], Université de Lausanne = University of Lausanne (UNIL), Institut de Génomique Fonctionnelle - Montpellier GenomiX (IGF MGX), Institut de Génomique Fonctionnelle (IGF), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-BioCampus (BCM), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), John Innes Centre [Norwich], Biotechnology and Biological Sciences Research Council (BBSRC), Department of Crop Genetics, Biotechnology and Biological Sciences Research Council (BBSRC)-Biotechnology and Biological Sciences Research Council (BBSRC), Department of Genetics [Cambridge], The Wellcome Trust Sanger Institute [Cambridge], Stockholm University, Institut d'écologie et des sciences de l'environnement de Paris (iEES Paris ), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Sorbonne Université (SU)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Ecologie Systématique et Evolution (ESE), AgroParisTech-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Cogitamus, Peuplements végétaux et bioagresseurs en milieu tropical (UMR PVBMT), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université de La Réunion (UR)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), ME acknowledges financial support from ANR (projects SPECREP, ANR-14-CE02-0011, and CLEARWING, ANR-16-CE02-0012) and HFSP (RGP0014/2016). MGX acknowledges financial support from France Génomique National infrastructure, funded as part of 'Investissement d’Avenir' program managed by Agence Nationale pour la Recherche (contract ANR-10-INBS-0009). RD, SM and CZ acknowledge financial support from Wellcome grant WT207492, and SM and work at the Wellcome Sanger Institute were also supported by Wellcome grant WT206194. We thank members of the Wellcome Sanger Institute Scientific Operations and Tree of Life core groups for their contributions to data production and assembly for the Melinaea genomes. We thank Mario Tuanama and Ronald Mori-Pezo for help with rearing and collecting butterflies. MM acknowledges a postdoctoral fellowship by the Fonds Québécois de la Recherche sur la Nature et les Technologies (FQRNT). STM acknowledges support from the BBSRC Institute Strategy Programme (BB/P012574/1). We thank the Peruvian authorities for research permits (236-2012-AG-DGFFS-DGEFFS, 201-2013-MINAGRI-DGFFS/DGEFFS, 002-2015-SERFOR-DGGSPFFS and 373-2017-SERFOR-DGGSPFFS), the Gobierno Regional San Martín PEHCBM (permit: 124-2016-GRSM/PEHCBM-DMA/EII-ANP/JARR) and the Museo de Historia Natural and Prof. Gerardo Lamas for their support. We thank the GenOuest BioInformatics Platform (http://www.genouest.orgTest), which allowed the use of a computing cluster for bioinformatic analyses., ANR-14-CE02-0011,SPECREP,Répétabilité du processus de spéciation chez les papillons: replications naturelles dans une zone de suture(2014), ANR-16-CE02-0012,CLEARWING,La transparence : origine physique, fonctions adaptatives et évolution chez les papillons transparents(2016), ANR-10-INBS-0009,France-Génomique,Organisation et montée en puissance d'une Infrastructure Nationale de Génomique(2010), Gauthier, Jérémy [0000-0001-6666-1002], Meier, Joana [0000-0001-7726-2875], Whibley, Annabel [0000-0003-1878-7705], Parrinello, Hugues [0000-0002-1151-001X], Wheat, Christopher W [0000-0003-1863-2340], Apollo - University of Cambridge Repository, Université de Rennes (UR)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro Rennes Angers, Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-École Pratique des Hautes Études (EPHE), International Aphid Genomics Consortium (IAGC), Department of Crop Genetics [Norwich], Department of Zoology [Stockholm]
المصدر: Molecular Ecology Resources
Molecular Ecology Resources, In press, ⟨10.1111/1755-0998.13749⟩
Molecular Ecology Resources, In press, pp.1-14. ⟨10.1111/1755-0998.13749⟩
Molecular ecology resources, vol. 23, no. 4, pp. 872-885
Molecular Ecology Resources (1755-098X) (Wiley) In Pressمصطلحات موضوعية: ithomiine butterflies, Genomics, chromosome-level genome, Adaptation, Physiological, Chromosomes, Phenotype, Hi-C, Genetics, Animals, [INFO.INFO-BI]Computer Science [cs]/Bioinformatics [q-bio.QM], Butterflies, Ecology, Evolution, Behavior and Systematics, mimicry, Biotechnology, Butterflies/genetics, Chromosomes/genetics, olfaction
وصف الملف: text/xml; application/pdf
الوصول الحر: https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_dedup___::1fa44ecb5ede3033de3616d35ac2798bTest
https://hal.inria.fr/hal-03926527Test -
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المؤلفون: Cervin Guyomar, Claire Lemaitre
المساهمون: Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage (GenPhySE ), Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT), Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse (ENSAT), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Scalable, Optimized and Parallel Algorithms for Genomics (GenScale), Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-GESTION DES DONNÉES ET DE LA CONNAISSANCE (IRISA-D7), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT), Annie Chateau, Mikaël Salson
المصدر: From Sequences to Graphs: Discrete Methods and Structures for Bioinformatics
From Sequences to Graphs: Discrete Methods and Structures for Bioinformatics, ISTE, 2022, 9781789450668مصطلحات موضوعية: [INFO.INFO-BI]Computer Science [cs]/Bioinformatics [q-bio.QM]
الوصول الحر: https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_dedup___::6bc5a3c7999691be4330addec86b6538Test
https://inria.hal.science/hal-03844316Test -
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المؤلفون: Anne Guichard, Fabrice Legeai, Denis Tagu, Claire Lemaitre
المساهمون: Scalable, Optimized and Parallel Algorithms for Genomics (GenScale), Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-GESTION DES DONNÉES ET DE LA CONNAISSANCE (IRISA-D7), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT)-Institut Mines-Télécom [Paris] (IMT), Institut de Génétique, Environnement et Protection des Plantes (IGEPP), Université de Rennes (UR)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro Rennes Angers, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), ANR-18-CE02-0019,Supergene,Les conséquences de l'évolution d'un supergène(2018), European Project: 764840,IGNITE
المصدر: BMC Bioinformatics
BMC Bioinformatics, 2023, 24, pp.17. ⟨10.1186/s12859-023-05395-w⟩مصطلحات موضوعية: Gap-filling, Local assembly, Linked-reads, [INFO]Computer Science [cs], [INFO.INFO-BI]Computer Science [cs]/Bioinformatics [q-bio.QM], Barcode
الوصول الحر: https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_dedup___::59c9d4596f4e41ebf618cc7c5e1690e6Test
https://hal.science/hal-03886951Test
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