المؤلفون: Dazzoni, Régine, Li, Yuanyuan, López-Castilla, Aracelys, Brier, Sébastien, Mechaly, Ariel, Cordier, Florence, Haouz, Ahmed, Nilges, Michael, Francetic, Olivera, Bardiaux, Benjamin, Izadi-Pruneyre, Nadia

المساهمون: Bioinformatique structurale - Structural Bioinformatics, Institut Pasteur Paris (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité), Biochimie des Interactions Macromoléculaires / Biochemistry of Macromolecular Interactions, Plateforme Technologique de RMN Biologique et HDX-MS - Biological NMR and HDX-MS Technological Platform, Cristallographie (Plateforme) - Crystallography (Platform), Systèmes transmembranaires bactériens - Bacterial transmembrane systems, This work was supported by the French Agence Nationale de la Recherche (ANR Synergy-T2SS ANR-19-CE11-0020-01) and the Fondation pour la Recherche Médicale (Equipe FRM 2017M.DEQ20170839114). Y.L. was funded by the Pasteur Paris University (PPU) international PhD program., ANR-19-CE11-0020,SYNERGY_T2SS,Structure et fonction moléculaire du pseudopilus dans la sécrétion de protéines par lla voiè de type 2(2019)

المصدر: ISSN: 0969-2126 ; Structure ; https://pasteur.hal.science/pasteur-03932612Test ; Structure, 2023, ⟨10.1016/j.str.2022.12.003⟩.

مصطلحات موضوعية: Type II Secretion System Assembly platform Type IV pili protein-protein interaction Ferredoxin-like fold, Type II Secretion System, Assembly platform, Type IV pili, protein-protein interaction, Ferredoxin-like fold, [SDV.BBM.BS]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Structural Biology [q-bio.BM]

العلاقة: info:eu-repo/semantics/altIdentifier/pmid/36586404; pasteur-03932612; https://pasteur.hal.science/pasteur-03932612Test; https://pasteur.hal.science/pasteur-03932612v2/documentTest; https://pasteur.hal.science/pasteur-03932612v2/file/Dazzoni%20et%20al_revision2.pdfTest; PUBMED: 36586404

الإتاحة: https://doi.org/10.1016/j.str.2022.12.003Test
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المؤلفون: Voegele, Alexis, Sadi, Mirko, O'Brien, Darragh P., Gehan, Pauline, Hoos, Sylviane, Brûlé, Sébastien, Raynal, Bertrand, Mechaly, Ariel, Haouz, Ahmed, Rodriguez, Nicolas, Vachette, Patrice, Durand, Dominique, Brier, Sébastien, Ladant, Daniel, Chenal, Alexandre

المصدر: Biophysical Journal ; volume 122, issue 3, page 370a ; ISSN 0006-3495

مصطلحات موضوعية: Biophysics

الإتاحة: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2022.11.2039Test
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المؤلفون: Leger, Corentin, Pitard, Irène, Sadi, Mirko, Carvalho, Nicolas, Brier, Sébastien, Mechaly, Ariel, Hoos, Sylviane, Vachette, Patrice, Durand, Dominique, Haouz, Ahmed, Guijarro, Inaki, Ladant, Daniel, Chenal, Alexandre

المصدر: Biophysical Journal ; volume 122, issue 3, page 41a ; ISSN 0006-3495

مصطلحات موضوعية: Biophysics

الإتاحة: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2022.11.432Test
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المؤلفون: Léger, Corentin, Pitard, Irène, Sadi, Mirko, Carvalho, Nicolas, Brier, Sébastien, Mechaly, Ariel, E, Raoux-Barbot, Dorothée, Davi, Maryline, Hoos, Sylviane, Weber, Patrick, Vachette, Patrice, Durand, Dominique, Haouz, Ahmed, Guijarro, J. Iñaki, Ladant, Daniel, Chenal, Alexandre

المساهمون: Biochimie des Interactions Macromoléculaires / Biochemistry of Macromolecular Interactions, Institut Pasteur Paris (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité), Plateforme Technologique de RMN Biologique et HDX-MS - Biological NMR and HDX-MS Technological Platform, Cristallographie (Plateforme) - Crystallography (Platform), Biophysique Moléculaire (plateforme) - Molecular Biophysics (platform), Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Agence Nationale de la Recherche (ANR 21-CE11-0014-01-TransCyaA, CACSICE Equipex ANR-11-EQPX-0008). CNRS (UMR 3528). Institut Pasteur (PTR 166-19, DARRI-Emergence S-PI15006-12B, PPUIP program), ANR-21-CE11-0014,3DTransCyaA,Structures et mécanisme de translocation de la toxine CyaA(2021), ANR-11-EQPX-0008,CACSICE,Centre d'analyse de systèmes complexes dans les environnements complexes(2011)

المصدر: ISSN: 1741-7007.

مصطلحات موضوعية: Calmodulin CaM Calmidazolium CDZ Calmodulin antagonist Structure Protein dynamics, Calmodulin, CaM, Calmidazolium, CDZ, Calmodulin antagonist, Structure, Protein dynamics, [SDV]Life Sciences [q-bio], [SDV.BC]Life Sciences [q-bio]/Cellular Biology

العلاقة: info:eu-repo/semantics/altIdentifier/pmid/35945584; pasteur-03880614; https://pasteur.hal.science/pasteur-03880614Test; https://pasteur.hal.science/pasteur-03880614/documentTest; https://pasteur.hal.science/pasteur-03880614/file/s12915-022-01381-5.pdfTest; PUBMED: 35945584; PUBMEDCENTRAL: PMC9361521

الإتاحة: https://doi.org/10.1186/s12915-022-01381-5Test
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المؤلفون: Gransagne, Marion, Aymé, Gabriel, Brier, Sébastien, Chauveau-Le Friec, Gaëlle, Meriaux, Véronique, Nowakowski, Mireille, Déjardin, François, Levallois, Sylvain, Dias de Melo, Guilherme, Donati, Flora, Prot, Matthieu, Brûlé, Sébastien, Raynal, Bertrand, Bellalou, Jacques, Goncalves, Pedro, Montagutelli, Xavier, Di Santo, James, P, Lazarini, Françoise, England, Patrick, Petres, Stéphane, Escriou, Nicolas, Lafaye, Pierre

المساهمون: Département de Santé Globale - Department Global Health, Institut Pasteur Paris (IP)-Université Paris Cité (UPCité), Ingénierie des Anticorps (plate-forme) - Antibody Engineering (Platform), Institut Pasteur Paris (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité), Plateforme Technologique de RMN Biologique et HDX-MS - Biological NMR and HDX-MS Technological Platform, Plateforme technologique Production et purification de protéines recombinantes – Production and Purification of Recombinant Proteins Technological Platform (PPR), Biologie des Infections - Biology of Infection, Institut Pasteur Paris (IP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité), Lyssavirus, épidémiologie et neuropathologie - Lyssavirus Epidemiology and Neuropathology, Génétique Moléculaire des Virus à ARN - Molecular Genetics of RNA Viruses (GMV-ARN (UMR_3569 / U-Pasteur_2)), Centre National de Référence des virus des infections respiratoires (dont la grippe) - National Reference Center Virus Influenzae Paris (CNR - laboratoire coordonnateur), Génomique évolutive des virus à ARN - Evolutionary genomics of RNA viruses, Biophysique Moléculaire (plateforme) - Molecular Biophysics (platform), Immunité Innée - Innate Immunity, Génétique de la souris - Mouse Genetics, Perception et Mémoire / Perception and Memory, Institut Pasteur Paris (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), P. G. and J. P. D. received support from the ANR grant “COVARIMM.”We want to thank Nicolas Wolff and Baptiste Colcombet-Cazenave for their technical help for the production of the different VHHs. The strain BetaCoV/France/IDF0372/2020 was supplied by the National Reference Centre for Respiratory Viruses hosted by Institut Pasteur (Paris, France) and headed by Pr. Sylvie van der Werf. The human sample from which strain BetaCoV/France/IDF0372/2020 was isolated was provided by Dr X. Lescure and Pr. Y. Yazdanpanah from the Bichat Hospital, Paris, France. Moreover, the strain BetaCoV/France/IDF0372/2020 was supplied through the European Virus Archive goes Global (Evag) platform, a project that has received funding from the European Union's Horizon 2020 research and innovation program under grant agreement No 653316. We are grateful to the National Reference Center for Respiratory Viruses for providing the variants of concern used in mouse experiments, to Sylvie van der Werf and Etienne Simon-Lorière for support and scientific advice, and to Grégory Jouvion for histological evaluation. We thank the Institut Pasteur Histology platform for histological slides preparation. Mouse experiments on variants of concern were supported by ANR grants HUMOCID (ANR-20-COVI-0028-01) and IBEID (ANR-10-LABX-62-IBEID) and by the EU Horizon 2020 RECOVER project (No. 101003589). The authors would like to thank the DIM 1HEALTH région Ile-de-France scheme for funding the Centrifection project that allowed to purchase the Optima ultracentrifuge. The CACSICE Equipex ANR-11-EQPX-0008 is acknowledged., ANR-20-COVI-0053,CoVarImm,Variation de la réponse immune systémique et muqueuse pendant l'infection par le SRAS-CoV-2 et la convalescence(2020), ANR-20-COVI-0028,HuMoCID,Développement de modèles murins de COVID-19(2020), ANR-10-LABX-0062,IBEID,Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases(2010), ANR-11-EQPX-0008,CACSICE,Centre d'analyse de systèmes complexes dans les environnements complexes(2011), European Project: 653316,H2020,H2020-INFRAIA-2014-2015,EVAg(2015)

المصدر: ISSN: 0021-9258.

مصطلحات موضوعية: COVID-19, antibody engineering, diagnostic, hydrogen-deuterium exchange, immunochemistry, nanobodies, nucleoprotein, phage display, single domain antibodies, [SDV.BBM.BC]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Biochemistry [q-bio.BM]

العلاقة: info:eu-repo/semantics/altIdentifier/pmid/34678315; info:eu-repo/grantAgreement//653316/EU/European Virus Archive goes global/EVAg; pasteur-03524979; https://pasteur.hal.science/pasteur-03524979Test; https://pasteur.hal.science/pasteur-03524979/documentTest; https://pasteur.hal.science/pasteur-03524979/file/VHH%20anti%20SARS-CoV2%20nucleoprotein%20Lafaye%20JBC%20%281%29.pdfTest; PUBMED: 34678315; PUBMEDCENTRAL: PMC8526496

الإتاحة: https://doi.org/10.1016/j.jbc.2021.101290Test
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المؤلفون: Voegele, Alexis, Sadi, Mirko, O’Brien, Darragh P., Gehan, Pauline, Raoux-Barbot, Dorothée, Hoos, Sylviane, Brûlé, Sébastien, Raynal, Bertrand, Haouz, Ahmed, Rodriguez, Nicolas, Vachette, Patrice, Durand, Dominique, Brier, Sébastien, Ladant, Daniel, Chenal, Alexandre

المصدر: Biophysical Journal ; volume 121, issue 3, page 221a ; ISSN 0006-3495

مصطلحات موضوعية: Biophysics

الإتاحة: https://doi.org/10.1016/j.bpj.2021.11.1635Test
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المؤلفون: O’brien, Darragh, Hourdel, Véronique, Chenal, Alexandre, Brier, Sébastien

المساهمون: Biochimie des Interactions Macromoléculaires / Biochemistry of Macromolecular Interactions, Institut Pasteur Paris (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Target Discovery Institute Oxford, UK (TDI), University of Oxford, Microbiologie structurale - Structural Microbiology (Microb. Struc. (UMR_3528 / U-Pasteur_5)), Institut Pasteur Paris (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité), Environnement et Risques infectieux - Environment and Infectious Risks (ERI), Institut Pasteur Paris (IP), Plateforme technologique de RMN biologique - Biological NMR Technological Platform, The HDX-MS system was financed by the Equipex CACSICE(ANR-11-EQPX-0008)., Springer, SB would like to thank Alexandre Chenal,Nadia Izadi-Prunyere, Mariette Matondo, Florence Cordier,Thierry Lang, Daniel Ladant, In ̃aki Guijarro and Michael Nilgesfor their kindness and constant support over the last year., ANR-11-EQPX-0008,CACSICE,Centre d'analyse de systèmes complexes dans les environnements complexes(2011)

المصدر: Expression, Purification, and Structural Biology of Membrane Proteins ; https://pasteur.hal.science/pasteur-02559306Test ; Springer. Expression, Purification, and Structural Biology of Membrane Proteins, 2127, Humana, New York, NY, pp.339-358, 2020, Methods in Molecular Biology, 978-1-0716-0372-7. ⟨10.1007/978-1-0716-0373-4_22⟩

مصطلحات موضوعية: Integral membrane proteins, Deuterium exchange, Ligand binding, Mass spectrometry, MS-friendly detergents, [SDV]Life Sciences [q-bio], [SDV.BBM.BS]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Structural Biology [q-bio.BM]

العلاقة: info:eu-repo/semantics/altIdentifier/pmid/32112332; pasteur-02559306; https://pasteur.hal.science/pasteur-02559306Test; https://pasteur.hal.science/pasteur-02559306/documentTest; https://pasteur.hal.science/pasteur-02559306/file/HDX_Membrane%20proteins_OBrien_MMB_2127.pdfTest; PUBMED: 32112332

الإتاحة: https://doi.org/10.1007/978-1-0716-0373-4_22Test
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المؤلفون: Dazzoni, Régine, Li, Yuanyuan, López-Castilla, Aracelys, Brier, Sébastien, Mechaly, Ariel, Cordier, Florence, Haouz, Ahmed, Nilges, Michael, Francetic, Olivera, Bardiaux, Benjamin, Izadi-Pruneyre, Nadia

المساهمون: Bioinformatique structurale - Structural Bioinformatics, Institut Pasteur Paris -Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité), Biochimie des Interactions Macromoléculaires / Biochemistry of Macromolecular Interactions, Plateforme Technologique de RMN Biologique et HDX-MS - Biological NMR and HDX-MS Technological Platform, Cristallographie (Plateforme) - Crystallography (Platform), This work was funded by the French Agence Nationale de la Recherche (ANR Synergy-T2SS ANR-19-CE11-0020-01) and the Fondation pour la Recherche Médicale (Equipe FRM 2017M.DEQ20170839114). YL was funded by the Pasteur Paris University (PPU) international PhD program and the China National Biotec Group Company Limited, and by a doctoral fellowship from the China Scholarship Council. We thank Ingrid Guilvout and Maylis Lejeune for their constant help. We acknowledge Iñaki Guijarro, Rémy Le Meur, Bertrand Raynal, Sébastien Brûlé and Christophe Thomas of C2RT for their help and assistance. The 800-MHz NMR spectrometer and the optima AUC of the Institut Pasteur were partially funded by the Région Ile de France (SESAME 2014 NMRCHR grant no 4014526) and DIM one health, respectively. The authors are grateful to the staff of the Institut Pasteur Crystallography platform for robot-driven crystallization screening. We acknowledge the Synchrotron SOLEIL (St Aubin, France) staff for assistance and advice during data collection on PROXIMA-1 and PROXIMA-2A beamlines. This work used the computational and storage service (TARS cluster) provided by the IT Department at Institut Pasteur, Paris., ANR-19-CE11-0020,SYNERGY_T2SS,Structure et fonction moléculaire du pseudopilus dans la sécrétion de protéines par lla voiè de type 2(2019)

المصدر: https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03800588Test ; 2022.

مصطلحات موضوعية: Type II Secretion System, Assembly platform, NMR, X-ray crystallography, protein-protein interaction, Ferredoxin-like domain, [SDV]Life Sciences [q-bio]

العلاقة: hal-03800588; https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03800588Test; https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03800588/documentTest; https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03800588/file/2022.07.16.500195v1.full.pdfTest; BIORXIV: 2022.07.16.500195

الإتاحة: https://doi.org/10.1101/2022.07.16.500195Test
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المؤلفون: Voegele, Alexis, Sadi, Mirko, O'Brien, Darragh, Patrick, Gehan, Pauline, Raoux‐barbot, Dorothée, Davi, Maryline, Hoos, Sylviane, Brûlé, Sébastien, Raynal, Bertrand, Weber, Patrick, Mechaly, Ariel, Haouz, Ahmed, Rodriguez, Nicolas, Vachette, Patrice, Durand, Dominique, Brier, Sébastien, Ladant, Daniel, Chenal, Alexandre

المساهمون: Biochimie des Interactions Macromoléculaires / Biochemistry of Macromolecular Interactions, Institut Pasteur Paris (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Paris Cité (UPCité), Laboratoire des biomolécules (LBM UMR 7203), Chimie Moléculaire de Paris Centre (FR 2769), École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Ecole Superieure de Physique et de Chimie Industrielles de la Ville de Paris (ESPCI Paris), Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Institut de Chimie - CNRS Chimie (INC-CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Institut de Chimie - CNRS Chimie (INC-CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Département de Chimie - ENS Paris, Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Biophysique Moléculaire (plateforme) - Molecular Biophysics (platform), Cristallographie (Plateforme) - Crystallography (Platform), Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Plateforme technologique de RMN biologique - Biological NMR Technological Platform, A.V. was supported by a DIM MalInf grant from the region Ile‐de‐France. M.S. was supported by the Pasteur – Paris University (PPU) International PhD Program. D.P.O.B. was supported by Institut Pasteur (grants PasteurInnoV15006‐01A and PTR451). P.G. was supported by Sorbonne Université. Funding is acknowledged from Agence Nationale de la Recherche (grant number CACSICE Equipex ANR‐11‐EQPX‐0008). Region Ile de France (grant number DIM MalInf 2016), CNRS (UMR 3528), Institut Pasteur (grant numbers PasteurInnoV15006‐01A, PTR451 and PTR166‐19, PPUIP program). The funders have no role in study design, data collection and analysis, decision to publish, or preparation of the manuscript., The authors acknowledge SOLEIL and ESRF for provision of synchrotron radiation facilities. The authors thank the staffs of the DISCO, PROXIMA‐1, and SWING beamlines for constant support and help during data collection (Synchrotron SOLEIL, St Aubin, France) and MASSIF (Synchrotron ESRF, Grenoble, France) beamlines for assistance during the X‐ray diffraction data collection., ANR-11-EQPX-0008,CACSICE,Centre d'analyse de systèmes complexes dans les environnements complexes(2011)

المصدر: ISSN: 2198-3844 ; Advanced Science ; https://pasteur.hal.science/pasteur-03211832Test ; Advanced Science, 2021, pp.2003630. ⟨10.1002/advs.202003630⟩.

مصطلحات موضوعية: adenylate cyclase, Bordetella pertussis, calmodulin, CyaA toxin, membrane translocation, protein membrane interaction, protein–protein interactions, [SDV.BBM.BP]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Biophysics, [SDV.BBM.BC]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Biochemistry [q-bio.BM], [SDV.BBM.BM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Molecular biology, [SDV.BBM.BS]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Structural Biology [q-bio.BM]

العلاقة: pasteur-03211832; https://pasteur.hal.science/pasteur-03211832Test; https://pasteur.hal.science/pasteur-03211832/documentTest; https://pasteur.hal.science/pasteur-03211832/file/advs.202003630%20with%20supfiles.pdfTest

الإتاحة: https://doi.org/10.1002/advs.202003630Test
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المؤلفون: Brier, Sébastien, Rasetti-Escargueil, Christine, Wijkhuisen, Anne, Simon, Stéphanie, Marechal, Maud, Lemichez, Emmanuel, Popoff, Michel

المساهمون: Plateforme technologique de RMN biologique - Biological NMR Technological Platform, Institut Pasteur Paris (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Toxines bactériennes - Bacterial Toxins, Médicaments et Technologies pour la Santé (MTS), Université Paris-Saclay-Institut des Sciences du Vivant Frédéric JOLIOT (JOLIOT), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Service de Pharmacologie et Immunoanalyse (SPI), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Paris-Saclay-Institut des Sciences du Vivant Frédéric JOLIOT (JOLIOT), Laboratoire d'Etudes et de Recherches en Immunoanalyses (LERI), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Médicaments et Technologies pour la Santé (MTS), French joint ministerial program against CBRNE, ANR-11-EQPX-0008,CACSICE,Centre d'analyse de systèmes complexes dans les environnements complexes(2011)

المصدر: ISSN: 0892-6638.

مصطلحات موضوعية: botulism, epitope mapping, mass spectrometry, monoclonal antibody, synaptic vesicle protein 2, GT1b, Hydrogen-Deuterium eXchange, botulinum neurotoxin, [SDV.BBM.BS]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Structural Biology [q-bio.BM]

العلاقة: info:eu-repo/semantics/altIdentifier/pmid/33817838; pasteur-03254500; https://pasteur.hal.science/pasteur-03254500Test; https://pasteur.hal.science/pasteur-03254500/documentTest; https://pasteur.hal.science/pasteur-03254500/file/20210224_PapierTA12_FASEB_Revised%20final.pdfTest; PUBMED: 33817838; WOS: 000645260100084

الإتاحة: https://doi.org/10.1096/fj.202002492RTest
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