المؤلفون: Bischerour, Julien, Arnaiz, Olivier, Zangarelli, Coralie, Régnier, Vinciane, Iehl, Florence, Ropars, Virginie, Charbonnier, Jean-Baptiste, Bétermier, Mireille

المساهمون: Fondation ARC pour la Recherche sur Le Cancer, ANR, FRM

المصدر: Cell Reports ; volume 43, issue 4, page 114001 ; ISSN 2211-1247

الإتاحة: https://doi.org/10.1016/j.celrep.2024.114001Test
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المؤلفون: Gout, Jean-Francois, Hao, Yue, Johri, Parul, Arnaiz, Olivier, Doak, Thomas, G, Bhullar, Simran, Couloux, Arnaud, Guérin, Fréderic, Malinsky, Sophie, Potekhin, Alexey, Sawka, Natalia, Sperling, Linda, Labadie, Karine, Meyer, Eric, Duharcourt, Sandra, Lynch, Michael

المساهمون: Indiana State University, Arizona State University Tempe (ASU), Mississippi State University Mississippi, Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de biologie de l'ENS Paris (IBENS), Département de Biologie - ENS Paris, École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Génomique métabolique (UMR 8030), Genoscope - Centre national de séquençage Evry (GENOSCOPE), Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Jacques Monod (IJM (UMR_7592)), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité), Saint Petersburg State University (SPBU), Polska Akademia Nauk = Polish Academy of Sciences = Académie polonaise des sciences (PAN), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Université Paris Cité (UPCité)

المصدر: ISSN: 0737-4038.

مصطلحات موضوعية: Paramecium aurelia whole genome duplication gene retention gene loss ohnologs orthologs, Paramecium aurelia, whole genome duplication, gene retention, gene loss, ohnologs, orthologs, [SDV]Life Sciences [q-bio]

العلاقة: hal-04239549; https://cnrs.hal.science/hal-04239549Test; https://cnrs.hal.science/hal-04239549/documentTest; https://cnrs.hal.science/hal-04239549/file/msad107.pdfTest

الإتاحة: https://doi.org/10.1093/molbev/msad107Test
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المؤلفون: Bazin-Gélis, Mélanie, Eleftheriou, Evangelia, Zangarelli, Coralie, Lelandais, Gaëlle, Sperling, Linda, Arnaiz, Olivier, Bétermier, Mireille

المساهمون: Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Immunité Innée - Innate Immunity, Institut Pasteur Paris (IP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris Cité (UPCité), Intramural funding from the Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) and grants from the Agence Nationale de la Recherche ‘PIGGYPACK’ ANR-14-CE10-0005 to M.B., L.S., O.A., ‘LaMarque’ ANR-18-CE12-0005-02 and ‘CURE’ ANR-21-CE12-0019-01 to M.B., ‘POLYCHROME’ ANR-19-CE12-0015 to O.A., Fondation pour la Recherche Médicale FRM EQU202103012766 to M.B., M.B.G. was supported by a PhD fellowship from Paris-Saclay University Ecole Doctorale no. 577 SDSV and by a training grant from the Department of Genome Biology of I2BC to attend the ‘DU-Omique’ course in bioinformatics (Université Paris-Cité), we acknowledge the sequencing and bioinformatics expertise of the I2BC high-throughput sequencing facility, supported by France Génomique funded by the French National Program ‘Investissement d’Avenir’ ANR-10-INBS-09, fluorescence-assisted nuclear sorting experiments benefited from the expertise of the Imagerie‐Gif core facility, supported by the Agence Nationale de la Recherche ANR-11-EQPX-0029/Morphoscope, ANR-10-INBS-04/FranceBioImaging, ANR‐11‐IDEX‐0003‐02/ Saclay Plant Sciences . Funding for open access charge: Fondation pour la Recherche Médicale FRM EQU202103012766 ., ANR-14-CE10-0005,PIGGYPACK,Domestication de transposases et épigénétique: Impact sur la dynamique des génomes(2014), ANR-18-CE12-0005,LaMarque,Transitions évolutives dans la reconnaissance du “soi” génomique: petits ARN, facteurs spécifiques de séquence et méthylation de l'ADN(2018), ANR-21-CE12-0019,CURE,Elimination programmée d'ADN chez un unicellulaire modèle : coordination entre coupure de l'ADN et réparation des cassures double-brin(2021), ANR-19-CE12-0015,POLYCHROME,Complexe Polycomb chez la paramécie: interaction avec la machinerie des petits ARN et spécificité de substrats(2019), ANR-10-INBS-0009,France Génomique,Organisation et montée en puissance d'une Infrastructure Nationale de Génomique(2010), ANR-11-EQPX-0029,MORPHOSCOPE 2,Imagerie et reconstruction multiéchelles de la morphogenèse. (Plateforme d'innovation technologique et méthodologique pour l'imagerie in vivo et la reconstruction des dynamiques multiéchelles de la morphogenèse)(2011), ANR-10-INBS-0004,France-BioImaging,Développment d'une infrastructure française distribuée coordonnée(2010)

المصدر: ISSN: 0305-1048.

مصطلحات موضوعية: [SDV]Life Sciences [q-bio]

العلاقة: hal-04291944; https://cnrs.hal.science/hal-04291944Test; https://cnrs.hal.science/hal-04291944/documentTest; https://cnrs.hal.science/hal-04291944/file/55_2023%20Bazin-G%C3%A9lis_NAR_Crosstalk.pdfTest

الإتاحة: https://doi.org/10.1093/nar/gkad1006Test
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المؤلفون: Zangarelli, Coralie, Arnaiz, Olivier, Bourge, Mickaël, Gorrichon, Kevin, Jaszczyszyn, Yan, Mathy, Nathalie, Escoriza, Loïc, Bétermier, Mireille, Régnier, Vinciane

المساهمون: Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Reproduction et développement des plantes (RDP), École normale supérieure de Lyon (ENS de Lyon)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Institut Universitaire du Cancer de Toulouse - Oncopole (IUCT Oncopole - UMR 1037), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), UFR Sciences du Vivant Sciences - Université Paris Cité (UFR SDV UPCité), Université Paris Cité (UPCité), ANR-18-CE12-0005,LaMarque,Transitions évolutives dans la reconnaissance du “soi” génomique: petits ARN, facteurs spécifiques de séquence et méthylation de l'ADN(2018), ANR-19-CE12-0015,POLYCHROME,Complexe Polycomb chez la paramécie: interaction avec la machinerie des petits ARN et spécificité de substrats(2019), ANR-21-CE12-0019,CURE,Elimination programmée d'ADN chez un unicellulaire modèle : coordination entre coupure de l'ADN et réparation des cassures double-brin(2021), ANR-11-EQPX-0029,MORPHOSCOPE 2,Imagerie et reconstruction multiéchelles de la morphogenèse. (Plateforme d'innovation technologique et méthodologique pour l'imagerie in vivo et la reconstruction des dynamiques multiéchelles de la morphogenèse)(2011)

المصدر: ISSN: 1088-9051.

مصطلحات موضوعية: [SDV]Life Sciences [q-bio]

العلاقة: info:eu-repo/semantics/altIdentifier/pmid/36418061; hal-03840719; https://hal.science/hal-03840719Test; https://hal.science/hal-03840719v3/documentTest; https://hal.science/hal-03840719v3/file/Genome%20Res.-2022-Zangarelli-2028-42.pdfTest; PUBMED: 36418061

الإتاحة: https://doi.org/10.1101/gr.277027.122Test
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المؤلفون: Pina, Caridad Miró, Charmant, Olivia, Kawaguchi, Takayuki, Holoch, Daniel, Michaud, Audrey, Cohen, Isadora, Humbert, Adeline, Chevreux, Guillaume, Jaszczyszyn, Yan, del Maestro, Laurence, Ait-Si-Ali, Slimane, Arnaiz, Olivier, Margueron, Raphaël, Duharcourt, Sandra

المساهمون: Institut Jacques Monod (IJM (UMR_7592)), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité), Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Département Plateforme (PF I2BC), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Plateforme de séquençage à haut débit (NGS), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), Centre épigénétique et destin cellulaire (EDC), Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), ANR-11-LABX-0071,WHO AM I,Determinants de l'Identité : de la molécule à l'individu(2011), ANR-11-IDEX-0005,USPC,Université Sorbonne Paris Cité(2011), ANR-18-CE12-0005,LaMarque,Transitions évolutives dans la reconnaissance du “soi” génomique: petits ARN, facteurs spécifiques de séquence et méthylation de l'ADN(2018), ANR-19-CE12-0015,POLYCHROME,Complexe Polycomb chez la paramécie: interaction avec la machinerie des petits ARN et spécificité de substrats(2019)

المصدر: ISSN: 1534-5807 ; Developmental Cell ; https://hal.science/hal-03358389Test ; Developmental Cell, 2022, 57 (8), pp.1037-1052.e8. ⟨10.1016/j.devcel.2022.03.014⟩.

مصطلحات موضوعية: Polycomb repressive complex, Transposable elements, Histone modifications, RNA interference, Small RNA, Programed DNA elimination, Ciliates, [SDV]Life Sciences [q-bio]

العلاقة: hal-03358389; https://hal.science/hal-03358389Test; https://hal.science/hal-03358389/documentTest; https://hal.science/hal-03358389/file/2021.08.12.456067.full.pdfTest; BIORXIV: 2021.08.12.456067

الإتاحة: https://doi.org/10.1016/j.devcel.2022.03.014Test
https://hal.science/hal-03358389Test
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المؤلفون: Gnan, Stefano, Matelot, Mélody, Weiman, Marion, Arnaiz, Olivier, Guérin, Frédéric, Sperling, Linda, Bétermier, Mireille, Thermes, Claude, Chen, Chun-Long, Duharcourt, Sandra

المساهمون: Dynamique de l'information génétique : bases fondamentales et cancer (DIG CANCER), Institut Curie Paris -Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut Jacques Monod (IJM (UMR_7592)), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité), Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

المصدر: ISSN: 1088-9051.

مصطلحات موضوعية: [SDV]Life Sciences [q-bio]

العلاقة: hal-03400776; https://hal.science/hal-03400776Test; https://hal.science/hal-03400776/documentTest; https://hal.science/hal-03400776/file/2021.08.05.455221v1.full.pdfTest; BIORXIV: 2021.08.05.455221

الإتاحة: https://doi.org/10.1101/2021.08.05.455221Test
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المؤلفون: Owsian, Dawid, Gruchota, Julita, Arnaiz, Olivier, Nowak, Jacek K

المساهمون: National Science Centre, Poland

المصدر: Nucleic Acids Research ; volume 50, issue 5, page 2603-2620 ; ISSN 0305-1048 1362-4962

الإتاحة: https://doi.org/10.1093/nar/gkac106Test
https://academic.oup.com/nar/article-pdf/50/5/2603/42921277/gkac106.pdfTest

المؤلفون: Miró-Pina, Caridad, Charmant, Olivia, Kawaguchi, Takayuki, Holoch, Daniel, Michaud, Audrey, Cohen, Isadora, Humbert, Adeline, Jaszczyszyn, Yan, Chevreux, Guillaume, Del Maestro, Laurence, Ait-Si-Ali, Slimane, Arnaiz, Olivier, Margueron, Raphaël, Duharcourt, Sandra

المصدر: Developmental Cell ; volume 57, issue 8, page 1037-1052.e8 ; ISSN 1534-5807

مصطلحات موضوعية: Developmental Biology, Cell Biology, General Biochemistry, Genetics and Molecular Biology, Molecular Biology

الإتاحة: https://doi.org/10.1016/j.devcel.2022.03.014Test
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المؤلفون: Smedley, Damian, Haider, Syed, Durinck, Steffen, Pandini, Luca, Provero, Paolo, Allen, James, Arnaiz, Olivier, Awedh, Mohammad Hamza, Baldock, Richard, Barbiera, Giulia, Bardou, Philippe, Beck, Tim, Blake, Andrew, Bonierbale, Merideth, Brookes, Anthony J, Bucci, Gabriele, Buetti, Iwan, Burge, Sarah, Cabau, Cédric, Carlson, Joseph W, Chelala, Claude, Chrysostomou, Charalambos, Cittaro, Davide, Collin, Olivier, Cordova, Raul, Cutts, Rosalind J, Dassi, Erik, Di Genova, Alex, Djari, Anis, Esposito, Anthony, Estrella, Heather, Eyras, Eduardo, Fernandez-Banet, Julio, Forbes, Simon, Free, Robert C, Fujisawa, Takatomo, Gadaleta, Emanuela, Garcia-Manteiga, Jose M, Goodstein, David, Gray, Kristian, Guerra-Assunção, José Afonso, Haggarty, Bernard, Han, Dong-Jin, Han, Byung Woo, Harris, Todd, Harshbarger, Jayson, Hastings, Robert K, Hayes, Richard D, Hoede, Claire, Hu, Shen, Hu, Zhi-Liang, Hutchins, Lucie, Kan, Zhengyan, Kawaji, Hideya, Keliet, Aminah, Kerhornou, Arnaud, Kim, Sunghoon, Kinsella, Rhoda, Klopp, Christophe, Kong, Lei, Lawson, Daniel, Lazarevic, Dejan, Lee, Ji-Hyun, Letellier, Thomas, Li, Chuan-Yun, Lio, Pietro, Liu, Chu-Jun, Luo, Jie, Maass, Alejandro, Mariette, Jerome, Maurel, Thomas, Merella, Stefania, Mohamed, Azza Mostafa, Moreews, Francois, Nabihoudine, Ibounyamine, Ndegwa, Nelson, Noirot, Céline, Perez-Llamas, Cristian, Primig, Michael, Quattrone, Alessandro, Quesneville, Hadi, Rambaldi, Davide, Reecy, James, Riba, Michela, Rosanoff, Steven, Saddiq, Amna Ali, Salas, Elisa, Sallou, Olivier, Shepherd, Rebecca, Simon, Reinhard, Sperling, Linda, Spooner, William, Staines, Daniel M, Steinbach, Delphine, Stone, Kevin, Stupka, Elia, Teague, Jon W, Dayem Ullah, Abu Z, Wang, Jun, Ware, Doreen

المصدر: Nucleic acids research. 43(W1)

مصطلحات موضوعية: Humans, Neoplasms, Proteomics, Genomics, Internet, Database Management Systems, Developmental Biology, Environmental Sciences, Biological Sciences, Information and Computing Sciences

وصف الملف: application/pdf

الوصول الحر: https://escholarship.org/uc/item/5vh4j43wTest

المؤلفون: Sellis, Diamantis, Guérin, Frédéric, Arnaiz, Olivier, Pett, Walker, Lerat, Emmanuelle, Boggetto, Nicole, Krenek, Sascha, Berendonk, Thomas, Couloux, Arnaud, Aury, Jean-Marc, Labadie, Karine, Malinsky, Sophie, Bhullar, Simran, Meyer, Eric, Sperling, Linda, Duret, Laurent, Duharcourt, Sandra

المساهمون: Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive - UMR 5558 (LBBE), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Bioinformatique, phylogénie et génomique évolutive (BPGE), Département PEGASE LBBE (PEGASE), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive - UMR 5558 (LBBE), Institut Jacques Monod (IJM (UMR_7592)), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité), Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Eléments transposables, évolution, populations, Département génétique, interactions et évolution des génomes LBBE (GINSENG), Technische Universität Dresden = Dresden University of Technology (TU Dresden), Laboratoire de Bioinformatique pour la Génomique et la Biodiversité (LBGB), Génomique métabolique (UMR 8030), Genoscope - Centre national de séquençage Evry (GENOSCOPE), Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Genoscope - Centre national de séquençage Evry (GENOSCOPE), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Institut de biologie de l'ENS Paris (IBENS), Département de Biologie - ENS Paris, École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), ANR-18-CE12-0005,LaMarque,Transitions évolutives dans la reconnaissance du “soi” génomique: petits ARN, facteurs spécifiques de séquence et méthylation de l'ADN(2018), ANR-19-CE12-0015,POLYCHROME,Complexe Polycomb chez la paramécie: interaction avec la machinerie des petits ARN et spécificité de substrats(2019)

المصدر: ISSN: 1544-9173.

مصطلحات موضوعية: [SDV.MP.PRO]Life Sciences [q-bio]/Microbiology and Parasitology/Protistology, [SDV.BIBS]Life Sciences [q-bio]/Quantitative Methods [q-bio.QM], [SDV.BID.EVO]Life Sciences [q-bio]/Biodiversity/Populations and Evolution [q-bio.PE]

العلاقة: hal-03366429; https://hal.science/hal-03366429Test; https://hal.science/hal-03366429/documentTest; https://hal.science/hal-03366429/file/Sellis_PLoSBiol2021.pdfTest

الإتاحة: https://doi.org/10.1371/journal.pbio.3001309Test
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