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1مؤتمر
المؤلفون: Truong, Tam, Khac Minh, Faure, Roland, Andonov, Rumen
المساهمون: Scalable, Optimized and Parallel Algorithms for Genomics (GenScale), Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-GESTION DES DONNÉES ET DE LA CONNAISSANCE (IRISA-D7), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom Paris (IMT)-Institut Mines-Télécom Paris (IMT)-Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut Mines-Télécom Paris (IMT)-Institut Mines-Télécom Paris (IMT)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom Paris (IMT)-Institut Mines-Télécom Paris (IMT), Service Evolution Biologique et Ecologie, Université libre de Bruxelles (ULB), AMX Ph.D. grant
المصدر: BIOINFORMATICS 2024 - 15th International conference on bioinformatics models, methods and algorithms ; https://inria.hal.science/hal-04349675Test ; BIOINFORMATICS 2024 - 15th International conference on bioinformatics models, methods and algorithms, Feb 2024, Rome, Italy. pp.1-10
مصطلحات موضوعية: Metagenomes, Integer Linear Programming, Genome assembly, [INFO.INFO-BI]Computer Science [cs]/Bioinformatics [q-bio.QM]
العلاقة: hal-04349675; https://inria.hal.science/hal-04349675Test; https://inria.hal.science/hal-04349675/documentTest; https://inria.hal.science/hal-04349675/file/Improving_metagenome_assembly_with_data_mining_and_discrete_optimization_reviewed.pdfTest
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2دورية أكاديمية
المؤلفون: Epain, Victor, Andonov, Rumen
المساهمون: Scalable, Optimized and Parallel Algorithms for Genomics (GenScale), Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-GESTION DES DONNÉES ET DE LA CONNAISSANCE (IRISA-D7), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom Paris (IMT)-Institut Mines-Télécom Paris (IMT)-Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut Mines-Télécom Paris (IMT)-Institut Mines-Télécom Paris (IMT)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom Paris (IMT)-Institut Mines-Télécom Paris (IMT), Financement de thèse Inria INRAe
المصدر: ISSN: 1748-7188 ; Algorithms for Molecular Biology ; https://inria.hal.science/hal-04134429Test ; Algorithms for Molecular Biology, 2024, 19 (5), pp.1-35. ⟨10.1186/s13015-023-00243-1⟩.
مصطلحات موضوعية: Genome assembly, Inverted repeats, Integer linear programming, NP-Complete problem, [INFO.INFO-BI]Computer Science [cs]/Bioinformatics [q-bio.QM], [INFO.INFO-DS]Computer Science [cs]/Data Structures and Algorithms [cs.DS], [INFO.INFO-RO]Computer Science [cs]/Operations Research [math.OC]
العلاقة: hal-04134429; https://inria.hal.science/hal-04134429Test; https://inria.hal.science/hal-04134429v3/documentTest; https://inria.hal.science/hal-04134429v3/file/khloraascaf.pdfTest
الإتاحة: https://doi.org/10.1186/s13015-023-00243-1Test
https://inria.hal.science/hal-04134429Test
https://inria.hal.science/hal-04134429v3/documentTest
https://inria.hal.science/hal-04134429v3/file/khloraascaf.pdfTest -
3تقرير
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4مؤتمر
المؤلفون: Epain, Victor, Andonov, Rumen, Lavenier, Dominique
المساهمون: Scalable, Optimized and Parallel Algorithms for Genomics (GenScale), Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-GESTION DES DONNÉES ET DE LA CONNAISSANCE (IRISA-D7), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom Paris (IMT)-Institut Mines-Télécom Paris (IMT)-Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut Mines-Télécom Paris (IMT)-Institut Mines-Télécom Paris (IMT)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom Paris (IMT)-Institut Mines-Télécom Paris (IMT)
المصدر: JOBIM2022 ; https://hal.inria.fr/hal-03625229Test ; JOBIM2022, Jul 2022, Rennes, France ; https://jobim2022.sciencesconf.orgTest
مصطلحات موضوعية: Genome assembly, Inverted repeats, De Bruijn graph, Assembly graph, NP-Hard, [INFO.INFO-BI]Computer Science [cs]/Bioinformatics [q-bio.QM]
العلاقة: hal-03625229; https://hal.inria.fr/hal-03625229Test; https://hal.inria.fr/hal-03625229/documentTest; https://hal.inria.fr/hal-03625229/file/JOBIM_2022_KhloraaScaf.pdfTest
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5مؤتمر
المؤلفون: Epain, Victor, Andonov, Rumen
المساهمون: Scalable, Optimized and Parallel Algorithms for Genomics (GenScale), Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-GESTION DES DONNÉES ET DE LA CONNAISSANCE (IRISA-D7), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom Paris (IMT)-Institut Mines-Télécom Paris (IMT)-Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut Mines-Télécom Paris (IMT)-Institut Mines-Télécom Paris (IMT)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom Paris (IMT)-Institut Mines-Télécom Paris (IMT), INSA Lyon
المصدر: 23ème congrès annuel de la Société Française de Recherche Opérationnelle et d'Aide à la Décision
https://hal.science/hal-03558978Test
23ème congrès annuel de la Société Française de Recherche Opérationnelle et d'Aide à la Décision, INSA Lyon, Feb 2022, Lyon, Franceمصطلحات موضوعية: de novo genome assembly, contigs graph, inverted repeats, nested pairs, [INFO.INFO-BI]Computer Science [cs]/Bioinformatics [q-bio.QM], [INFO.INFO-RO]Computer Science [cs]/Operations Research [cs.RO]
العلاقة: hal-03558978; https://hal.science/hal-03558978Test; https://hal.science/hal-03558978/documentTest; https://hal.science/hal-03558978/file/ROADEF2022_khloraa%20%281%29.pdfTest
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6تقرير
المؤلفون: Epain, Victor, Andonov, Rumen
المساهمون: Scalable, Optimized and Parallel Algorithms for Genomics (GenScale), Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-GESTION DES DONNÉES ET DE LA CONNAISSANCE (IRISA-D7), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom Paris (IMT)-Institut Mines-Télécom Paris (IMT)-Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut Mines-Télécom Paris (IMT)-Institut Mines-Télécom Paris (IMT)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom Paris (IMT)-Institut Mines-Télécom Paris (IMT)
المصدر: https://inria.hal.science/hal-04134429Test ; 2023.
مصطلحات موضوعية: Genome assembly, Inverted repeats, Integer linear programming, NP-Complete, [INFO.INFO-BI]Computer Science [cs]/Bioinformatics [q-bio.QM], [INFO.INFO-RO]Computer Science [cs]/Operations Research [cs.RO]
العلاقة: hal-04134429; https://inria.hal.science/hal-04134429Test; https://inria.hal.science/hal-04134429v2/documentTest; https://inria.hal.science/hal-04134429v2/file/khloraascaf.pdfTest
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7دورية أكاديمية
المؤلفون: Epain, Victor, Andonov, Rumen
المصدر: Algorithms for Molecular Biology; 2/6/2024, Vol. 19 Issue 1, p1-34, 34p
مصطلحات موضوعية: GLOBAL optimization, HAPLOTYPES, CHLOROPLASTS, CHLOROPLAST DNA, BIOLOGICAL models, NP-complete problems, LINEAR programming
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8مؤتمر
المؤلفون: Andonov, Rumen, Epain, Victor, Lavenier, Dominique
المساهمون: Scalable, Optimized and Parallel Algorithms for Genomics (GenScale), Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-GESTION DES DONNÉES ET DE LA CONNAISSANCE (IRISA-D7), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom Paris (IMT)-Institut Mines-Télécom Paris (IMT)-Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut Mines-Télécom Paris (IMT)-Institut Mines-Télécom Paris (IMT)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom Paris (IMT)-Institut Mines-Télécom Paris (IMT)
المصدر: BiATA 2021 - 4th International conference Bioinformatics: from Algorithms to Applications ; https://hal.inria.fr/hal-03534195Test ; BiATA 2021 - 4th International conference Bioinformatics: from Algorithms to Applications, Jul 2021, St. Petersbourg, Russia. pp.1-2
مصطلحات موضوعية: [SDV.BIBS]Life Sciences [q-bio]/Quantitative Methods [q-bio.QM]
جغرافية الموضوع: St. Petersbourg, Russia
العلاقة: hal-03534195; https://hal.inria.fr/hal-03534195Test; https://hal.inria.fr/hal-03534195/documentTest; https://hal.inria.fr/hal-03534195/file/BiATA_2021_formatted_abstract_ANDONOV_EPAIN.pdfTest
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9تقرير
المؤلفون: Wohlers, Inken, Malod-Dognin, Noël, Andonov, Rumen, Klau, Gunnar W.
المصدر: N° RR-7874 (2012)
مصطلحات موضوعية: Quantitative Biology - Quantitative Methods
الوصول الحر: http://arxiv.org/abs/1202.2670Test
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10تقرير
المؤلفون: Wohlers, Inken, Andonov, Rumen, Klau, Gunnar W.
المصدر: Optimization Letters (2011)
مصطلحات موضوعية: Quantitative Biology - Quantitative Methods
الوصول الحر: http://arxiv.org/abs/1104.2995Test
النص الكامل