DNS folytonossághiányok vizsgálata Saccharomyces cerevisiae sejtekben ; A Study of DNA Discontinuities in Sacchromyces Cerevisiae Cells

التفاصيل البيبلوغرافية
العنوان: DNS folytonossághiányok vizsgálata Saccharomyces cerevisiae sejtekben ; A Study of DNA Discontinuities in Sacchromyces Cerevisiae Cells
المؤلفون: Hegedüs, Éva
المساهمون: Szabó, Gábor, Molekuláris sejt- és immunbiológia doktori iskola, DE--OEC--Általános Orvostudományi Kar -- Biofizikai és Sejtbiológiai Intézet
سنة النشر: 2010
المجموعة: University of Debrecen Electronic Archive (DEA) / Debreceni Egyetem elektronikus Archívum
مصطلحات موضوعية: élesztő, yeast, kromatin, chromatin, fragmentáció, fragmentation, rDNS, rDNA, hurok, loop, replikáció, replication, gélelektroforézis, gel electrophoresis, S. cerevisiae, S. pombe, nick, Elméleti orvostudományok, Orvostudományok
الوصف: Kolónia-képzési teszttel igazoltam, hogy a kromatin fragmentációs jelenséget nem-apoptotikus, 100 %-os életképességű élesztő sejtek mutatják. Logaritmikus és stacioner fázisú S. cerevisiae és S. pombe sejtekből származó, agarózba ágyazott deproteinizált kromatin 20-200 kb-os fragmentációját figyeltem meg S1 nukleáz emésztésüket, urea/hő-denaturációjukat, ill. alkalikus denaturálásukat követően egyaránt. Megállapítottam, hogy mindkét genomban hurok-méretű szakaszokat határoló egyszál folytonossághiányok találhatóak. S. cerevisiae sejteket G1-, S- és G2 sejtciklus fázisban szinkronizálva sem találtam számottevő eltérést a teljes genom fragmentációs mintázatában. Megállapítottam, hogy a hurok-méretű kromatin fragmentáció minden kromoszómára kiterjed S1 nukleáz, ill. urea/hő-denaturálást követően. S. cerevisiae I. kromoszómáján a hurok-méretű fragmentumokat kijelölő nick-ek és ARS szekvenciák egymás tágabb környezetében helyezkednek el. S. cerevisiae esetében kimutattam, hogy a 100-200 tandem ismétlődő, azonos szekvenciájú 9,1 kb-os egységekből felépülő mintegy 1,5 Mb-nyi rDNS klaszter hurok-méretű fragmentációt mutat, az össz-DNS-hez hasonlóan, S1 nukleáz és urea/hő-denaturálás hatására. Ez azt jelenti, hogy átlagosan minden 11. egységen belül fordulnak elő nick-ek – vagyis ezek előfordulását epigenetikai tényezők határozzák meg. rDNS specifikus Southern szonda segítségével térképeztem az rDNS szakaszokon belül a hurok-méretű fragmentációt kijelölő nick-ek helyét. Behatároltam annak a régiónak a helyét az rDNS egységeken belül, ahol a nick-ek előfordulása szabályosságot mutat: ez a RFB-ével esett egybe. Folytonossághiányok és RNS/DNS hibridek kimutatására alkalmas „Ab-Southern” módszert dolgoztam ki. Új elektroforetikus és mikrogyöngy alapú áramlási citometriás módszereket dolgoztam ki. --- By the colony-forming test, I confirmed that the chromatin fragmentation phenomena observed reflect features of ~ 100 % viable cells. 20-200 kb fragmentation of agarose embedded deproteinized S. cerevisiae and S. pombe chromatin ...
نوع الوثيقة: other/unknown material
وصف الملف: 94 p.; application/msword; application/pdf
اللغة: Hungarian
English
العلاقة: http://hdl.handle.net/2437/98575Test
الإتاحة: http://hdl.handle.net/2437/98575Test
رقم الانضمام: edsbas.B13AB55A
قاعدة البيانات: BASE