المؤلفون: Valades-Cruz, Cesar Augusto, Leconte, Ludovic, Fouché, Gwendal, Blanc, Thomas, van Hille, Nathan, Fournier, Kevin, Laurent, Tao, Gallean, Benjamin, Deslandes, François, Hajj, Bassam, Faure, Emmanuel, Argelaguet, Ferran, Trubuil, Alain, Isenberg, Tobias, Masson, Jean-Baptiste, Salamero, Jean, Kervrann, Charles

المساهمون: Space-timE RePresentation, Imaging and cellular dynamics of molecular COmplexes (SERPICO), Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria), Biologie Cellulaire et Cancer, Institut Curie Paris -Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), 3D interaction with virtual environments using body and mind (Hybrid), Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-RÉALITÉ VIRTUELLE, HUMAINS VIRTUELS, INTERACTIONS ET ROBOTIQUE (IRISA-D5), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom Paris (IMT)-Institut Mines-Télécom Paris (IMT)-Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut Mines-Télécom Paris (IMT)-Institut Mines-Télécom Paris (IMT)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-IMT Atlantique (IMT Atlantique), Institut Mines-Télécom Paris (IMT)-Institut Mines-Télécom Paris (IMT), Laboratoire Physico-Chimie Curie Institut Curie (PCC), Institut Curie Paris -Institut de Chimie - CNRS Chimie (INC-CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Interdisciplinaire des Sciences du Numérique (LISN), Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-CentraleSupélec-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Image & Interaction (LIRMM, Laboratoire d'Informatique de Robotique et de Microélectronique de Montpellier (LIRMM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM), Mathématiques et Informatique Appliquées du Génome à l'Environnement Jouy-En-Josas (MaIAGE), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Analysis and Visualization (AVIZ), Inria Saclay - Ile de France, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Laboratoire Interdisciplinaire des Sciences du Numérique (LISN), Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-CentraleSupélec-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-CentraleSupélec-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Interaction avec l'Humain (IaH), Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-CentraleSupélec-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-CentraleSupélec-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Décision et processus Bayesiens - Decision and Bayesian Computation, Institut Pasteur Paris (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité), ANR-10-INBS-0004,France-BioImaging,Développment d'une infrastructure française distribuée coordonnée(2010), ANR-11-LABX-0038,CelTisPhyBio,Des cellules aux tissus: au croisement de la Physique et de la Biologie(2011), ANR-10-IDEX-0001,PSL,Paris Sciences et Lettres(2010), ANR-16-CONV-0005,INCEPTION,Institut Convergences pour l'étude de l'Emergence des Pathologies au Travers des Individus et des populatiONs(2016), ANR-10-LABX-0073,REVIVE,Stem Cells in Regenerative Biology and Medicine(2010), ANR-19-P3IA-0001,PRAIRIE,PaRis Artificial Intelligence Research InstitutE(2019)

المصدر: EISSN: 2673-7647 ; Frontiers in Bioinformatics ; https://inria.hal.science/hal-03790274Test ; Frontiers in Bioinformatics, 2022, 2, pp.997082:1-997082:9. ⟨10.3389/fbinf.2022.997082⟩

مصطلحات موضوعية: multi-dimensional biological data, virtual reality, augmented reality, intracellular imaging, bioimaging, [INFO.INFO-GR]Computer Science [cs]/Graphics [cs.GR], [SDV]Life Sciences [q-bio], [SDV.BC]Life Sciences [q-bio]/Cellular Biology

العلاقة: hal-03790274; https://inria.hal.science/hal-03790274Test; https://inria.hal.science/hal-03790274/documentTest; https://inria.hal.science/hal-03790274/file/fbinf-02-997082.pdfTest

الإتاحة: https://doi.org/10.3389/fbinf.2022.997082Test
https://inria.hal.science/hal-03790274Test
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https://inria.hal.science/hal-03790274/file/fbinf-02-997082.pdfTest

المؤلفون: Guérinot, Corentin, Marcon, Valentin, Godard, Charlotte, Blanc, Thomas, Verdier, Hippolyte, Planchon, Guillaume, Raimondi, Francesca, Boddaert, Nathalie, Alonso, Mariana, Sailor, Kurt, Lledo, Pierre-Marie, Hajj, Bassam, El Beheiry, Mohamed, Masson, Jean-Baptiste

المساهمون: Décision et processus Bayesiens - Decision and Bayesian Computation, Institut Pasteur Paris (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité), Perception et Mémoire / Perception and Memory, Collège Doctoral, Sorbonne Université (SU), Université Paris Sciences et Lettres (PSL), Laboratoire Physico-Chimie Curie Institut Curie (PCC), Institut Curie Paris -Institut de Chimie - CNRS Chimie (INC-CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Hôpital Necker - Enfants Malades AP-HP, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP), We acknowledge funding from the Institut Pasteur, the Institut Curie, the Paris Science lettre (PSL) University, the sponsorships of CRPCEN, Gilead Science and foundation EDF, the INCEPTION project (PIA/ANR-16-CONV-0005, OG), the LabEx “Revive” (ANR-10-LABX-73), the programme d’investissement d’avenir supported by L’Agence Nationale de la Recherche ANR-19-P3IA-0001 Institut 3IA Prairie and the support of the AVIRON grant from the Région Ile-de-France (DIM-ELICIT). We acknowledge funding from the Fondation pour la recherche médicale (FRM, DEI20151234398), the Agence National de la recherche (ANR-19-CE42-0003-01), the LabEx CelTisPhyBio (ANR-10-LBX-0038, ANR-10-IDEX-0001-02) and the Institut Curie. We recognize the support of France-BioImaging infrastructure grant ANR-10-INBS-04 (Investments for the future). We acknowledge the financial support of the Agence pour la Recherche sur le Cancer (ARC Foundation), DIM ELICIT and from ITMO Cancer of Aviesan on funds administered by Inserm (grant No. 20CP092-00)., ANR-16-CONV-0005,INCEPTION,Institut Convergences pour l'étude de l'Emergence des Pathologies au Travers des Individus et des populatiONs(2016), ANR-10-LABX-0073,REVIVE,Stem Cells in Regenerative Biology and Medicine(2010), ANR-19-P3IA-0001,PRAIRIE,PaRis Artificial Intelligence Research InstitutE(2019), ANR-11-LABX-0038,CelTisPhyBio,Des cellules aux tissus: au croisement de la Physique et de la Biologie(2011), ANR-10-IDEX-0001,PSL,Paris Sciences et Lettres(2010), ANR-10-INBS-0004,France-BioImaging,Développment d'une infrastructure française distribuée coordonnée(2010)

المصدر: EISSN: 2673-7647 ; Frontiers in Bioinformatics ; https://hal.science/hal-03795778Test ; Frontiers in Bioinformatics, 2022, 1, pp.777101. ⟨10.3389/fbinf.2021.777101⟩

مصطلحات موضوعية: virtual reality, cloud computation, one-shot learning, inference, human-in-the-loop, MRI, CT-scan, [INFO]Computer Science [cs]

العلاقة: info:eu-repo/semantics/altIdentifier/pmid/36303792; hal-03795778; https://hal.science/hal-03795778Test; https://hal.science/hal-03795778/documentTest; https://hal.science/hal-03795778/file/2022_B_FrontiersInBioinformatics_annotations.pdfTest; PUBMED: 36303792; PUBMEDCENTRAL: PMC9580868

الإتاحة: https://doi.org/10.3389/fbinf.2021.777101Test
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https://hal.science/hal-03795778/file/2022_B_FrontiersInBioinformatics_annotations.pdfTest

المؤلفون: Blanc, Thomas, Verdier, Hippolyte, Regnier, Louise, Planchon, Guillaume, Guérinot, Corentin, El Beheiry, Mohamed, Masson, Jean-Baptiste, Hajj, Bassam

المساهمون: Laboratoire Physico-Chimie Curie Institut Curie (PCC), Institut Curie Paris -Institut de Chimie - CNRS Chimie (INC-CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Sorbonne Université (SU), Décision et processus Bayesiens - Decision and Bayesian Computation, Institut Pasteur Paris (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité), Collège Doctoral, We acknowledge funding from the Fondation pour la recherche médicale (FRM, DEI20151234398), the Agence National de la recherche (ANR-19-CE42-0003-01), the LabEx CelTisPhyBio (ANR-11-LABX-0038, ANR-10-IDEX-0001-02), and the Institut Curie. We recognize the support of France-BioImaging infrastructure grant ANR-10-INBS-04 (Investments for the future). We acknowledge the financial support of the Agence pour la Recherche sur le Cancer (ARC Foundation), DIM ELICIT and from ITMO Cancer of Aviesan on funds administered by Inserm (grant N° 20CP092-00). We acknowledge funding from the Institut Pasteur, the Institut Curie, the Paris Science lettre (PSL) University, the sponsorships of CRPCEN, Gilead Science and foundation EDF, the INCEPTION project (PIA/ANR-16-CONV-0005, OG), the programme d’investissement d’avenir supported by L’Agence Nationale de la Recherche ANR-19-P3IA-0001 Institut 3IA Prairie and the support of the AVIRON grant from the Région Ile-de-France (DIM-ELICIT)., ANR-19-CE42-0003,VISION,Excitation et imagerie super-résolution volumétrique confinée à basse température : étude de l'architecture du chromosome durant l'expression des gènes(2019), ANR-11-LABX-0038,CelTisPhyBio,Des cellules aux tissus: au croisement de la Physique et de la Biologie(2011), ANR-10-IDEX-0001,PSL,Paris Sciences et Lettres(2010), ANR-10-INBS-0004,France-BioImaging,Développment d'une infrastructure française distribuée coordonnée(2010), ANR-16-CONV-0005,INCEPTION,Institut Convergences pour l'étude de l'Emergence des Pathologies au Travers des Individus et des populatiONs(2016), ANR-19-P3IA-0001,PRAIRIE,PaRis Artificial Intelligence Research InstitutE(2019)

المصدر: EISSN: 2673-7647 ; Frontiers in Bioinformatics ; https://hal.science/hal-03795768Test ; Frontiers in Bioinformatics, 2022, 1, ⟨10.3389/fbinf.2021.775379⟩

مصطلحات موضوعية: virtual reality, point clouds, inference, microscopy, human in the loop, 3D maps, [INFO.INFO-AI]Computer Science [cs]/Artificial Intelligence [cs.AI], [SDV]Life Sciences [q-bio]

العلاقة: hal-03795768; https://hal.science/hal-03795768Test; https://hal.science/hal-03795768/documentTest; https://hal.science/hal-03795768/file/2022_A_FrontiersInBioinformatics_Genuage.pdfTest

الإتاحة: https://doi.org/10.3389/fbinf.2021.775379Test
https://hal.science/hal-03795768Test
https://hal.science/hal-03795768/documentTest
https://hal.science/hal-03795768/file/2022_A_FrontiersInBioinformatics_Genuage.pdfTest

المؤلفون: El Beheiry, Mohamed, Godard, Charlotte, Caporal, Cĺement, Marcon, Valentin, Ostertag, Cecilia, Sliti, Oumaima, Doutreligne, Śebastien, Fournier, Sephane, Hajj, Bassam, Dahan, Maxime, Masson, Jean-Baptiste

المساهمون: Physico-Chimie-Curie (PCC), Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut Curie Paris -Institut de Chimie - CNRS Chimie (INC-CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Décision et processus Bayesiens - Decision and Bayesian Computation, Institut Pasteur Paris (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), We acknowledge funding from the Institut Pasteur (J.B.M), The Institut Curie (M.D.), Paris Science Lettres (M.D., J.B.M.) the sponsorship of CRPCEN (J.B.M), the sponsorship of Gilead-Science (J.B.M.), sponsorship of the fondation EDF (J.B.M.), the ANR-17-CE23-0016 TRamWAy (J.B.M),the INCEPTION project (PIA/ANR-16-CONV-0005, OG) (J.B.M), the ”Investissements d’avenir” program under the management of Agence Nationale de la Recherche, reference ANR-19-P3IA-0001 (PRAIRIE 3IA Institute)., We thank Kurt Sailor (Institut Pasteur), Richard Weinberg (University of North Carolina), Thomas Rubin and Jean-Ren Huynh (Collège de France) for the image datasets provided to generate the figures, We thank all the research teams from Institut Curie, Institut Pasteur, Collège de France who tested the DIVA software and provided feedbacks that have strongly influence the development of the software., ANR-16-CONV-0005,INCEPTION,Institut Convergences pour l'étude de l'Emergence des Pathologies au Travers des Individus et des populatiONs(2016), ANR-17-CE23-0016,TRamWAy,L'Analyseur Automatique de Marches Aléatoires Biomoléculaires: La Science des molécules uniques à l'époque des données massives(2017), ANR-19-P3IA-0001,PRAIRIE,PaRis Artificial Intelligence Research InstitutE(2019)

المصدر: ISSN: 0022-2836.

مصطلحات موضوعية: Virtual Reality, Data Visualisation, Image Processing, Data Treatment, Human-in-the-Loop, Microscopy, Data visualization, [SPI]Engineering Sciences [physics], [PHYS]Physics [physics]

العلاقة: info:eu-repo/semantics/altIdentifier/pmid/32512003; pasteur-02872140; https://pasteur.hal.science/pasteur-02872140Test; https://pasteur.hal.science/pasteur-02872140/documentTest; https://pasteur.hal.science/pasteur-02872140/file/DIVA-no-color.pdfTest; PUBMED: 32512003

الإتاحة: https://doi.org/10.1016/j.jmb.2020.05.026Test
https://pasteur.hal.science/pasteur-02872140Test
https://pasteur.hal.science/pasteur-02872140/documentTest
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