دورية أكاديمية

Analysis of bacterial communities associated with Mountain Chickadees (Poecile gambeli) across urban and rural habitats.

التفاصيل البيبلوغرافية
العنوان: Analysis of bacterial communities associated with Mountain Chickadees (Poecile gambeli) across urban and rural habitats.
المؤلفون: Stephens, Colton R.A.1 (AUTHOR), McAmmond, Breanne M.1,2 (AUTHOR), Van Hamme, Jonathan D.1 (AUTHOR), Otter, Ken A.1,2 (AUTHOR), Reudink, Matthew W.1 (AUTHOR), Bottos, Eric M.1,2 (AUTHOR) ebottos@tru.ca
المصدر: Canadian Journal of Microbiology. 2021, Vol. 67 Issue 8, p572-583. 12p.
مصطلحات موضوعية: *HABITATS, *CHICKADEES, *MICROBIAL communities, *BACTERIAL communities, *URBAN animals, *PHYLA (Genus), *URBANIZATION
الملخص (بالإنجليزية): Host-associated microbial communities play important roles in wildlife health, but these dynamics can be influenced by environmental factors. Urbanization has numerous effects on wildlife; however, the degree to which wildlife-associated bacterial communities and potential bacterial pathogens vary across urban–rural/native habitat gradients remains largely unknown. We used 16S rRNA gene amplicon sequencing to examine bacterial communities found on Mountain Chickadee (Poecile gambeli) feathers and nests in urban and rural habitats. The feathers and nests in urban and rural sites had similar abundances of major bacterial phyla and dominant genera with pathogenic members. However, richness of bacterial communities and potential pathogens on birds were higher in urban habitats, and potential pathogens accounted for some of the differences in bacterial occurrence between urban and rural environments. We predicted habitat using potential pathogen occurrence with a 90% success rate for feather bacteria, and a 72.2% success rate for nest bacteria, suggesting an influence of urban environments on the presence of potential pathogens. We additionally observed similarities in bacterial communities between nests and their occupants, suggesting bacterial transmission between them. These findings improve our understanding of the bacterial communities associated with urban wildlife and suggest that urbanization impacts the composition of wildlife-associated bacterial communities. [ABSTRACT FROM AUTHOR]
Abstract (French): Les communautés microbiennes associées à l'hôte jouent un rôle important dans la santé de la faune sauvage, mais cette dynamique peut être influencée par des facteurs environnementaux. L'urbanisation a de nombreuses conséquences sur la faune sauvage ; toutefois, le degré de variation des communautés bactériennes et des agents pathogènes bactériens potentiels associés à la faune sauvage à travers des gradients d'habitats urbains et ruraux/naturels reste largement inconnu. Les auteurs ont utilisé le séquençage de l'amplicon du gène de l' ARNr 16S pour examiner les communautés bactériennes trouvées sur les plumes et dans les nids des mésanges de Gambel (Poecile gambeli) dans des habitats urbains et ruraux. Les plumes et les nids des sites urbains et ruraux présentaient des abondances similaires de phylums bactériens majeurs et de genres dominants ayant des membres pathogènes. Cependant, la richesse des communautés bactériennes et des agents pathogènes potentiels sur les oiseaux était plus élevée dans les habitats urbains, et les agents pathogènes potentiels expliquaient certaines des différences de présence bactérienne entre les environnements urbains et ruraux. Ils ont prédit l'habitat en utilisant la présence d'agents pathogènes potentiels avec un taux de réussite de 90 % pour les bactéries des plumes et de 72,2 % pour les bactéries des nids, ce qui suggère une influence des environnements urbains sur la présence d'agents pathogènes potentiels. Ils ont en outre observé des similitudes dans les communautés bactériennes entre les nids et leurs occupants, ce qui suggère une transmission bactérienne entre eux. Ces résultats améliorent notre compréhension des communautés bactériennes associées à la faune urbaine et suggèrent que l'urbanisation peut avoir un impact sur la composition des communautés bactériennes associées à la faune. [Traduit par la Rédaction] [ABSTRACT FROM AUTHOR]
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تدمد:00084166
DOI:10.1139/cjm-2020-0320