المؤلفون: Akanksha Pandey, Edward L. Braun

المصدر: Biophysica, Vol 1, Iss 8, Pp 87-105 (2021)
Biophysica
Volume 1
Issue 2
Pages 8-105

مصطلحات موضوعية: 0106 biological sciences, 0301 basic medicine, QH301-705.5, Tree of life, relative solvent accessibility, Biology, Network topology, phylogeny, 010603 evolutionary biology, 01 natural sciences, Coalescent theory, 03 medical and health sciences, Phylogenetics, Phylogenomics, anatomy_morphology, protein structure, Biology (General), gene tree–species tree discordance, General Environmental Science, models of sequence evolution, Phylogenetic tree, Ctenophora, incomplete lineage sorting, secondary structure, Porifera, Tree (data structure), 030104 developmental biology, Taxon, Evolutionary biology, General Earth and Planetary Sciences

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المؤلفون: John Dransfield, Benedikt G. Kuhnhäuser, Sidonie Bellot, Simon J. Hiscock, Wolf L. Eiserhardt, William J. Baker, Thomas L. P. Couvreur, Guillaume Chomicki, Andrew Henderson, Rowan J. Schley

المصدر: Kuhnhäuser, B G, Bellot, S, Couvreur, T L P, Dransfield, J, Henderson, A, Schley, R, Chomicki, G, Eiserhardt, W L, Hiscock, S J & Baker, W J 2021, ' A robust phylogenomic framework for the calamoid palms ', Molecular Phylogenetics and Evolution, vol. 157, 107067 . https://doi.org/10.1016/j.ympev.2020.107067Test

مصطلحات موضوعية: Genetic Markers, 0106 biological sciences, 0301 basic medicine, Calamoideae, Systematics, Subfamily, Gene tree, conflict, Arecaceae, 010603 evolutionary biology, 01 natural sciences, 03 medical and health sciences, Phylogenomics, Genetics, Rattan, Molecular Biology, Phylogeny, Ecology, Evolution, Behavior and Systematics, Cell Nucleus, Base Sequence, biology, Phylogenetic tree, Gene tree conflict, Biodiversity, Exons, Genomics, 15. Life on land, biology.organism_classification, 030104 developmental biology, Evolutionary biology, Taxonomy (biology)

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المؤلفون: Julie Marin, Amaury Lambert, Guillaume Achaz, Anton Crombach

المساهمون: Centre interdisciplinaire de recherche en biologie (CIRB), Labex MemoLife, École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Collège de France (CdF (institution))-Ecole Superieure de Physique et de Chimie Industrielles de la Ville de Paris (ESPCI Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Systématique, Evolution, Biodiversité (ISYEB ), Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-École Pratique des Hautes Études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université des Antilles (UA), Éco-Anthropologie (EA), Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Artificial Evolution and Computational Biology (BEAGLE), Laboratoire d'InfoRmatique en Image et Systèmes d'information (LIRIS), Université Lumière - Lyon 2 (UL2)-École Centrale de Lyon (ECL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Lumière - Lyon 2 (UL2)-École Centrale de Lyon (ECL), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Inria Grenoble - Rhône-Alpes, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive - UMR 5558 (LBBE), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire de Probabilités, Statistique et Modélisation (LPSM (UMR_8001)), Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité), École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Muséum national d'Histoire naturelle (MNHN)-École pratique des hautes études (EPHE), Éco-Anthropologie (EAE), Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive - UMR 5558 (LBBE), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Inria Grenoble - Rhône-Alpes, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Laboratoire d'InfoRmatique en Image et Systèmes d'information (LIRIS), Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-École Centrale de Lyon (ECL), Université de Lyon-Université Lumière - Lyon 2 (UL2)-Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (INSA Lyon), Université de Lyon-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École Centrale de Lyon (ECL), Université de Lyon-Université Lumière - Lyon 2 (UL2), Laboratoire de Probabilités, Statistiques et Modélisations (LPSM (UMR_8001)), Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Paris (UP), Crombach, Anton

المصدر: Journal of Evolutionary Biology
Journal of Evolutionary Biology, 2020, 33 (10), pp.1387-1404. ⟨10.1111/jeb.13677⟩
Journal of Evolutionary Biology, Wiley, 2020, 33 (10), pp.1387-1404. ⟨10.1111/jeb.13677⟩

مصطلحات موضوعية: 0301 basic medicine, 0106 biological sciences, Genetic Speciation, [SDV]Life Sciences [q-bio], introgression, Population genetics, Inference, Diversification (marketing strategy), Biology, phylogeny, 010603 evolutionary biology, 01 natural sciences, species tree, Gene flow, Coalescent theory, 03 medical and health sciences, Genetic drift, Genetic algorithm, Gene, Ecology, Evolution, Behavior and Systematics, 030304 developmental biology, coalescent theory, 0303 health sciences, Genome, Hierarchy (mathematics), Models, Genetic, Gene tree, population genetics, Reproductive isolation, [SDV] Life Sciences [q-bio], Tree (data structure), multispecies coalescent, 030104 developmental biology, gene tree, speciation, Evolutionary biology, gene‐based diversification model, gene flow

الوصول الحر: https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_dedup___::59de6d2b60294b6e181a7597cda395c5Test
https://hal.science/hal-03137815Test

المؤلفون: Rodrigo M. Feitosa, Marcos S. Barbeitos, Marcio R. Pie, Gabriela P. Camacho

المصدر: Zoologica Scripta. 48:215-225

مصطلحات موضوعية: 0106 biological sciences, 0301 basic medicine, biology, Apidae, Gene tree, Hymenoptera, biology.organism_classification, 010603 evolutionary biology, 01 natural sciences, Coalescent theory, 03 medical and health sciences, 030104 developmental biology, Evolutionary biology, Genetics, Animal Science and Zoology, Molecular Biology, Ecology, Evolution, Behavior and Systematics

الوصول الحر: https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_________::48f18001bdda195bccd72dcd6bb856b5Test
https://doi.org/10.1111/zsc.12332Test

المؤلفون: Siavash Mirarab, Shubhanshu Shekhar, Sebastien Roch

المصدر: IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics. 15:1738-1747

مصطلحات موضوعية: FOS: Computer and information sciences, 0301 basic medicine, K-ary tree, Genetic Speciation, Genomic data, 0206 medical engineering, Mathematics - Statistics Theory, Statistics Theory (math.ST), 02 engineering and technology, Network topology, Coalescent theory, Computational Engineering, Finance, and Science (cs.CE), Combinatorics, 03 medical and health sciences, FOS: Mathematics, Genetics, Computer Simulation, Quantitative Biology - Populations and Evolution, Computer Science - Computational Engineering, Finance, and Science, Phylogeny, Mathematics, Models, Genetic, Sample complexity, Applied Mathematics, Probability (math.PR), Gene tree, Populations and Evolution (q-bio.PE), Computational Biology, Binary logarithm, Tree (data structure), 030104 developmental biology, FOS: Biological sciences, Algorithms, Software, Mathematics - Probability, 020602 bioinformatics, Biotechnology

الوصول الحر: https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_dedup___::ea788c27dd0659966c5015422be8c319Test
https://doi.org/10.1109/tcbb.2017.2757930Test

المؤلفون: Mukul S. Bansal, Soumya Kundu

المصدر: BMC Bioinformatics, Vol 19, Iss S9, Pp 21-31 (2018)
BMC Bioinformatics

مصطلحات موضوعية: 0301 basic medicine, Root (linguistics), Theoretical computer science, Gene Transfer, Horizontal, Computer science, lcsh:Computer applications to medicine. Medical informatics, Biochemistry, Evolution, Molecular, Gene trees, 03 medical and health sciences, Structural Biology, Phylogenetics, Transfer (computing), Gene Duplication, Gene duplication, Gene family, Molecular Biology, Gene, lcsh:QH301-705.5, Phylogeny, Structure (mathematical logic), 030102 biochemistry & molecular biology, Phylogenetic tree, Microbial evolution, Applied Mathematics, Research, Gene tree, Uncertainty, Genomics, Reconciliation, Horizontal gene transfer, Computer Science Applications, Tree (data structure), 030104 developmental biology, lcsh:Biology (General), Multigene Family, lcsh:R858-859.7, DNA microarray, Algorithms, Software

الوصول الحر: https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_dedup___::154f493301f5602ebc5391bca2ee92dcTest
http://link.springer.com/article/10.1186/s12859-018-2269-0Test

المؤلفون: Celine Scornavacca, Jakub Truszkowski, Fabio Pardi

المساهمون: Institut de Biologie Computationnelle (IBC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Université de Montpellier (UM), Méthodes et Algorithmes pour la Bioinformatique (MAB), Laboratoire d'Informatique de Robotique et de Microélectronique de Montpellier (LIRMM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM), Institut des Sciences de l'Evolution de Montpellier (UMR ISEM), École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Montpellier (UM)-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UR226, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-École Pratique des Hautes Études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université de Montpellier (UM)-Institut de recherche pour le développement [IRD] : UR226-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), ANR-19-CE45-0012,CoCoAlSeq,Combiner des algorithmes combinatoires d'inférence de réseaux et des méthodes d'inférence phylogénétique basées sur les séquences génétiques pour reconstruire des réseaux phylogénétiques explicites significatifs(2019)

المصدر: Theoretical Population Biology
Theoretical Population Biology, Elsevier, 2021, 137, pp.22-31. ⟨10.1016/j.tpb.2020.12.002⟩
Theoretical Population Biology, 2021, 137, pp.22-31. ⟨10.1016/j.tpb.2020.12.002⟩

مصطلحات موضوعية: 0106 biological sciences, 0301 basic medicine, FOS: Computer and information sciences, Theoretical computer science, Genetic Speciation, Population, Context (language use), Scale (descriptive set theory), Topology (electrical circuits), Network topology, 010603 evolutionary biology, 01 natural sciences, species tree, Coalescent theory, 03 medical and health sciences, Computer Science - Data Structures and Algorithms, Data Structures and Algorithms (cs.DS), education, Quantitative Biology - Populations and Evolution, Time complexity, Ecology, Evolution, Behavior and Systematics, Phylogeny, Mathematics, Probability, dynamic programming, education.field_of_study, Models, Genetic, Populations and Evolution (q-bio.PE), incomplete lineage sorting, coalescent, 92D15, Tree (data structure), multispecies coalescent, 030104 developmental biology, gene tree, FOS: Biological sciences, [INFO.INFO-BI]Computer Science [cs]/Bioinformatics [q-bio.QM], Algorithms

الوصول الحر: https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_dedup___::d380c55f1e19bf1c51e22cf493b59616Test
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03047963/file/2001.06741.pdfTest

المؤلفون: Mark S. Hibbins, Matthew W. Hahn, Matthew J. S. Gibson

المصدر: eLife, Vol 9 (2020)
eLife

مصطلحات موضوعية: 0106 biological sciences, 0301 basic medicine, Genotype, Genetic Speciation, QH301-705.5, Science, introgression, Introgression, Context (language use), Biology, Genetic Introgression, 010603 evolutionary biology, 01 natural sciences, General Biochemistry, Genetics and Molecular Biology, Coalescent theory, 03 medical and health sciences, Phylogenetics, Convergent evolution, None, Statistical inference, Animals, Humans, convergent evolution, comparative methods, Biology (General), Phylogeny, Evolutionary Biology, Models, Genetic, General Immunology and Microbiology, Phylogenetic tree, General Neuroscience, General Medicine, Phylogenetic comparative methods, gene tree discordance, phylogenetics, Phenotype, 030104 developmental biology, Evolutionary biology, Trait, Medicine, Software, Research Article

الوصول الحر: https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_dedup___::b725fc7c4c943a01e9eae1af4ade665eTest
https://elifesciences.org/articles/63753Test

المؤلفون: M. Sohel Rahman, Md. Shamsuzzoha Bayzid, Muhammad Ali Nayeem, Sakshar Chakravarty, Mohammad Saifur Rahman

المصدر: BIBE

مصطلحات موضوعية: 0106 biological sciences, 0301 basic medicine, Estimation, High probability, Computer science, Gene tree, Evolutionary algorithm, 010603 evolutionary biology, 01 natural sciences, Coalescent theory, 03 medical and health sciences, Tree (data structure), 030104 developmental biology, Phylogenomics, Metaheuristic, Algorithm

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https://doi.org/10.1109/bibe50027.2020.00021Test

المؤلفون: Ayed A. R. Alanzi, James H. Degnan

المصدر: PLoS ONE
PLoS ONE, Vol 16, Iss 5, p e0251107 (2021)

مصطلحات موضوعية: 0106 biological sciences, 0301 basic medicine, Leaves, Social Sciences, Variation (game tree), Plant Science, 01 natural sciences, Biochemistry, Coalescent theory, Trees, Nucleic Acids, Quantitative Biology::Populations and Evolution, Psychology, Coalescence (chemistry), Phylogeny, Mathematics, Data Management, Caterpillars, Multidisciplinary, Animal Behavior, Plant Anatomy, Gene tree, Eukaryota, Phylogenetic Analysis, Plants, Quantitative Biology::Genomics, Biological Evolution, Phylogenetics, Insects, Moths and Butterflies, Medicine, Imitation, Algorithms, Research Article, Computer and Information Sciences, Arthropoda, Genetic Speciation, Science, 010603 evolutionary biology, Statistics, Nonparametric, 03 medical and health sciences, Genetics, Animals, Humans, Evolutionary Systematics, Computer Simulation, Taxonomy, Evolutionary Biology, Behavior, Models, Statistical, Models, Genetic, Organisms, Biology and Life Sciences, Correction, Statistical model, DNA, Invertebrates, 030104 developmental biology, Taxon, Evolutionary biology, Genetic Loci, Tree (set theory), Zoology, Entomology, Software

الوصول الحر: https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_dedup___::b970bee85fdac97a2f62af66f11e81cbTest
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34370793Test