Multiomic analysis of malignant pleural mesothelioma identifies molecular axes and specialized tumor profiles driving intertumor heterogeneity
| العنوان: | Multiomic analysis of malignant pleural mesothelioma identifies molecular axes and specialized tumor profiles driving intertumor heterogeneity |
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| المؤلفون: | Lise Mangiante, Nicolas Alcala, Alexandra Sexton-Oates, Alex Di Genova, Abel Gonzalez-Perez, Azhar Khandekar, Erik N. Bergstrom, Jaehee Kim, Xiran Liu, Ricardo Blazquez-Encinas, Colin Giacobi, Nolwenn Le Stang, Sandrine Boyault, Cyrille Cuenin, Severine Tabone-Eglinger, Francesca Damiola, Catherine Voegele, Maude Ardin, Marie-Cecile Michallet, Lorraine Soudade, Tiffany M. Delhomme, Arnaud Poret, Marie Brevet, Marie-Christine Copin, Sophie Giusiano-Courcambeck, Diane Damotte, Cecile Girard, Veronique Hofman, Paul Hofman, Jérôme Mouroux, Charlotte Cohen, Stephanie Lacomme, Julien Mazieres, Vincent Thomas de Montpreville, Corinne Perrin, Gaetane Planchard, Nathalie Rousseau, Isabelle Rouquette, Christine Sagan, Arnaud Scherpereel, Francoise Thivolet, Jean-Michel Vignaud, Didier Jean, Anabelle Gilg Soit Ilg, Robert Olaso, Vincent Meyer, Anne Boland-Auge, Jean-Francois Deleuze, Janine Altmuller, Peter Nuernberg, Alejandro Ibáñez-Costa, Justo P. Castaño, Sylvie Lantuejoul, Akram Ghantous, Charles Maussion, Pierre Courtiol, Hector Hernandez-Vargas, Christophe Caux, Nicolas Girard, Nuria Lopez-Bigas, Ludmil B. Alexandrov, Françoise Galateau-Salle, Matthieu Foll, Lynnette Fernandez-Cuesta |
| المساهمون: | Centre International de Recherche contre le Cancer - International Agency for Research on Cancer (CIRC - IARC), Organisation Mondiale de la Santé / World Health Organization Office (OMS / WHO), Stanford University, Universidad de O'Higgins (UOH), Centre de modélisation mathématique (CMM), Universitad de Chile-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Barcelona Institute of Science and Technology (BIST), Instituto de Salud Carlos III [Madrid] (ISC), University of California [San Diego] (UC San Diego), University of California (UC), Cornell University [New York], Maimonides Institute of Biomedical Research of Cordoba, Partenaires INRAE, Universidad de Córdoba = University of Córdoba [Córdoba], Hospital Universitario Reina Sofia [Cordoue, Espagne], CIBER Fisiopatología de la Obesidad y Nutrición [Cordoue, Espagne] (CIBEROBN), Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon (UNICANCER/CRCL), Centre Léon Bérard [Lyon]-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre Léon Bérard [Lyon], Cypath and Cypath-rb [Villeurbanne] (2C), Tumorothèque du Centre de Référence Régional en Cancérologie [CHRU Lille] (T-C2RC), Université de Lille-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille)-Institut de Pathologie de Lille (IPL), Hôpital Nord [CHU - APHM], Centre de Recherche des Cordeliers (CRC (UMR_S_1138 / U1138)), École Pratique des Hautes Études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Université Paris Cité (UPCité), Tumorothèque - Centre de Ressources Biologiques Cancer Cochin [Hôpital Cochin AP-HP] (T-CRB Cancer Cochin), Hôpital Cochin [AP-HP], Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Groupes hospitalo-universitaires Paris Centre AP-HP [Paris] (GHU Paris Centre), FHU OncoAge - Pathologies liées à l’âge [CHU Nice] (OncoAge), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Pharmacologie Moléculaire et Cellulaire [UNIV Côte d'Azur] (UPMC)-Université Côte d'Azur (UCA), Université Côte d'Azur (UCA), Institut de Recherche sur le Cancer et le Vieillissement (IRCAN), Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Côte d'Azur (UCA), Centre Hospitalier Universitaire de Nice (CHU Nice), Hôpital Pasteur [Nice] (CHU), Nutrition-Génétique et Exposition aux Risques Environnementaux (NGERE), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lorraine (UL), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université de Toulouse (UT), Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Hôpital Marie-Lannelongue, Tissu-Tumorothèque Est - Centre de Ressources Biologiques [HCL, Lyon] (2TE - CRB HCL), Hospices Civils de Lyon (HCL), Réseau d'expertise anatomopathologique et de recherche sur les tumeurs de la plèvre [CHU Caen] (MESOPATH), CHU Caen, Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN)-Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN), Service Anatomie et cytologie pathologiques [CHU Toulouse], Pôle Biologie [CHU Toulouse], Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse)-Centre Hospitalier Universitaire de Toulouse (CHU Toulouse), Centre de Ressources Biologiques - Cancer - IUCT Oncopole [Toulouse] (CRB - Cancer Toulouse), Thérapies Laser Assistées par l'Image pour l'Oncologie - U 1189 (ONCO-THAI), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lille-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille), Centre Hospitalier Régional Universitaire de Nancy (CHRU Nancy), Santé publique France - French National Public Health Agency [Saint-Maurice, France], Centre National de Recherche en Génomique Humaine (CNRGH), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Cologne Centre for Genomics [Cologne, Germany] (2CG), Instituto Maimonides de Investigación Biomédica de Cordoba (IMIBIC), Universidad de Córdoba = University of Córdoba [Córdoba]-Hospital Universitario Reina Sofía, Université Grenoble Alpes (UGA), Owkin [New York, NY, USA] (O), Institut Curie [Paris], Institut Mutualiste de Montsouris (IMM), Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ), Université Paris-Saclay, Institució Catalana de Recerca i Estudis Avançats (ICREA) |
| المصدر: | Nature Genetics Nature Genetics, 2023, 55 (4), pp.607-618. ⟨10.1038/s41588-023-01321-1⟩ |
| بيانات النشر: | HAL CCSD, 2023. |
| سنة النشر: | 2023 |
| مصطلحات موضوعية: | [SDV]Life Sciences [q-bio], Genetics, Technology Platforms |
| الوصف: | Malignant pleural mesothelioma (MPM) is an aggressive cancer with rising incidence and challenging clinical management. Through a large series of whole-genome sequencing data, integrated with transcriptomic and epigenomic data using multiomics factor analysis, we demonstrate that the current World Health Organization classification only accounts for up to 10% of interpatient molecular differences. Instead, the MESOMICS project paves the way for a morphomolecular classification of MPM based on four dimensions: ploidy, tumor cell morphology, adaptive immune response and CpG island methylator profile. We show that these four dimensions are complementary, capture major interpatient molecular differences and are delimited by extreme phenotypes that—in the case of the interdependent tumor cell morphology and adapted immune response—reflect tumor specialization. These findings unearth the interplay between MPM functional biology and its genomic history, and provide insights into the variations observed in the clinical behavior of patients with MPM. |
| وصف الملف: | application/pdf |
| اللغة: | English |
| تدمد: | 1061-4036 1546-1718 |
| الوصول الحر: | https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_dedup___::34bf4a959d167d30c59abf20d776d9d7Test https://www.hal.inserm.fr/inserm-04062865Test |
| حقوق: | OPEN |
| رقم الانضمام: | edsair.doi.dedup.....34bf4a959d167d30c59abf20d776d9d7 |
| قاعدة البيانات: | OpenAIRE |
| تدمد: | 10614036 15461718 |
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