التفاصيل البيبلوغرافية
| العنوان: |
Estudio de diversidad de accesiones de guayabo (Psidium guajava L.) mediante el marcador molecular ISTR. (Spanish) |
| العنوان البديل: |
Studying the diversity of guava (Psidium guajava L.) accessions using ISTR molecular markers. (English) |
| المؤلفون: |
Rodríguez Medina, Narciso N., Herrero, Juliette Valdés-Infante, Llanes, Miguel Angel Keb, Sánchez, Aileen O'Connor, Rohde, Wolfgang |
| المصدر: |
Revista Colombiana de Biotecnología; jul2010, Vol. 12 Issue 1, p113-123, 11p, 3 Charts, 1 Graph |
| مصطلحات موضوعية: |
GUAVA, POLYMERASE chain reaction, PLANT diversity, CLUSTER analysis (Statistics), PLEOMORPHIC fungi, AMPLIFIED fragment length polymorphism, PLANT germplasm, GENOTYPE-environment interaction, GENETIC polymorphisms |
| الملخص (بالإنجليزية): |
Genetic variability studies can be useful for the rational management of material as well as its conservation and improvement. Inverse sequence-tagged repeat (ISTR) is a PCR-based technique which allows individuals and populations' genetic diversity to be studied, cultivars to be identified, etc. The present work was thus aimed at using this molecular marker to study guava accession diversity. An absence-presence matrix for polymorphic bands was generated for data analysis; cluster analysis was developed from this, based on Jaccard's coefficient and the UPGMA method for dendrogram construction using NTSYS-pc software. Guava genotype evaluation with the ISTR marker generated 52 polymorphic bands, allowing all the materials being evaluated to be differentiated, thereby corroborating this technique's use for identifying accessions in the specie. Cluster analysis revealed the formation of four defined diversity groups and the presence of four external accessions. The differences encountered for accession clustering with ISTR regarding those previously obtained by AFLP and SSR suggested that choosing the most appropriate technique for determinate studies can be difficult. The results indicated the need for carrying out integrated studies on this crop's germplasm bank to ensure more suitable management. [ABSTRACT FROM AUTHOR] |
| Abstract (Spanish): |
Los estudios de variabilidad genética resultan útiles para el manejo racional del material, tanto para su conservación como para el mejoramiento. La Repetición de Secuencias Inversas Marcadas (ISTR) es una técnica basada en la PCR que permite el estudio de la diversidad genética de individuos y poblaciones; identificación de cultivares, entre otras aplicaciones. En este sentido, el objetivo del presente trabajo fue estudiar la diversidad de accesiones de guayabo empleando este marcador molecular. Para el análisis de los datos se generó una matriz de ausencia-presencia de las bandas polimórficas, a partir de la cual se desarrolló un análisis de agrupamiento basado en el coeficiente de Jaccard y el método UPGMA para la construcción del dendrograma con el programa NTSYS-pc. La evaluación de los genotipos de guayabo con el marcador ISTR generó un total de 52 bandas polimórficas, las cuales permitieron diferenciar todos los materiales evaluados, corroborando la utilidad de esta técnica para la identificación de accesiones en la especie. El análisis de agrupamiento permitió evidenciar la formación de cuatro grupos de diversidad definidos y la presencia de cuatro accesiones externas. Las diferencias encontradas en el agrupamiento de las accesiones por ISTR respecto a las obtenidas previamente por AFLP y SSR sugieren que el elegir la técnica más apropiada para determinados estudios puede resultar un proceso difícil. Los resultados discutidos en este trabajo indican la necesidad de realizar estudios integrados en el banco de germoplasma de este cultivo para lograr un manejo más racional de la base genética del mismo. [ABSTRACT FROM AUTHOR] |
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