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1رسالة جامعية
المؤلفون: Olvera Vázquez, Sergio Gabriel
المساهمون: Génétique Quantitative et Evolution - Le Moulon (Génétique Végétale) (GQE-Le Moulon), AgroParisTech-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Université Paris-Saclay, Amandine Cornille
المصدر: https://theses.hal.science/tel-04639088Test ; Populations and Evolution [q-bio.PE]. Université Paris-Saclay, 2023. English. ⟨NNT : 2023UPASB063⟩.
مصطلحات موضوعية: Aphid, Chemoreception, Common garden, Divergence, Host-parasite interaction, Local adaptation, Puceron, Chimioréception, Jardin commun, Interaction hôte-parasite, Adaptation locale, [SDV.BID.EVO]Life Sciences [q-bio]/Biodiversity/Populations and Evolution [q-bio.PE], [SDV.EE.IEO]Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment/Symbiosis
الوصف: The relative contributions of biotic and abiotic factors to local adaptation still need to be studied. Understanding local adaptation processes in host-parasite interactions will also help to tackle pressing issues, such as how environmental changes alter the emergence of parasites, leading to host extinction. My Ph.D. project consisted of four main chapters to evaluate the genomic and ecological bases of adaptation in aphids. In particular, we investigated whether (local) adaptation occurred during the recent colonization of cultivated apple (Malus domestica) by Dysaphis plantaginea in Europe and what are the genomic bases associated with it. We investigated different scientific hypotheses at different evolutionary scales. In Chapter 1, we studied genes involved in aphid adaptation to their host at a macroevolutionary scale. We showed a higher evolutionary rate in an aphid subfamily known for its large host breath and including significant crop pests, driven by gene expansion and contraction with functions related to aphid adaptation to their hosts. We showed low synteny of olfactory receptors (OR) and gustatory receptors (GR) genes, evolving in tandem repeats following the birth-death model and under purifying selection. Transposable elements (TEs) did not have a role in the GR and OR gene evolution. However, we found species-specific TE dynamics, with major TEs burst in aphid infesting fruit trees. In Chapter 2, I used a microevolutionary lens and reconstructed the colonization history of D. plantaginea on the cultivated apple using microsatellite markers. We detected five populations in the US, Morocco, Western and Eastern Europe, and Spain. Populations showed weak genetic differentiation and high genetic diversity, except in Morocco and North America, likely due to recent colonization events there. Machine learning combined with coalescent-based simulations also indicated substantial gene flow among populations. In Chapter 3, I used single nucleotide polymorphisms (SNPs) to investigate genomic patterns of ...
العلاقة: NNT: 2023UPASB063; tel-04639088; https://theses.hal.science/tel-04639088Test; https://theses.hal.science/tel-04639088/documentTest; https://theses.hal.science/tel-04639088/file/113053_OLVERA_VAZQUEZ_2023_diffusion.pdfTest
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2مؤتمر
المؤلفون: Scotti-Saintagne, Caroline
المساهمون: Ecologie des Forêts Méditerranéennes (URFM), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Institut de Recherche pour le Développement (IRD). FRA.
المصدر: Séminaire IRD ; https://hal.inrae.fr/hal-02788755Test ; Séminaire IRD, Institut de Recherche pour le Développement (IRD). FRA., Jun 2017, Montpellier, France. pp.42
مصطلحات موضوعية: Sapin pectiné, sapin méditerranéen, phylogéographie, Adaptation locale, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology
جغرافية الموضوع: Montpellier, France
الوصف: National audience
العلاقة: hal-02788755; https://hal.inrae.fr/hal-02788755Test; https://hal.inrae.fr/hal-02788755/documentTest; https://hal.inrae.fr/hal-02788755/file/Scotti-Saintagne_IRD_130617_1.pdfTest; PRODINRA: 425335
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3
المؤلفون: Alfaro Tapia, Armando
المساهمون: Ecosystèmes, biodiversité, évolution [Rennes] (ECOBIO), Université de Rennes (UR)-Institut Ecologie et Environnement (INEE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes (OSUR), Université de Rennes (UR)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Rennes 2 (UR2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Rennes 2 (UR2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Rennes, Universidad de Talca, Blas Lavandero, Joan Van Baaren
المصدر: Agricultural sciences. Université de Rennes; Universidad de Talca, 2022. English. ⟨NNT : 2022REN1B004⟩
مصطلحات موضوعية: [SDV.SA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, Effet hôte, Host effect, Plasticité thermique, Local adaptation, Host-Parasitoid interaction, Interaction hôte-Parasitoïde, Diapause, Adaptation locale, thermal plasticity
الوصف: Insects as small ectotherms are known to live in a wide range of thermal climates and have to adopt different strategies to resist unfavorable conditions such as: migration, enter in diapause or remain active. Throughout this Thesis, different ecological drivers have been explored in aphid parasitoids along a latitudinal gradient in the central‒south valley of Chile. We tested whether environmental conditions along this gradient led to a higher diapause incidence on high latitudes (colder) compared to low latitudes (warmer). In addition, we explored whether diapause is regulated by biotic stimulus (i.e., host effect, host availability, and maternal competition). We found an absence of a clear north-south latitudinal temperature gradient. Based on the intensity of winter, the sampled localities were categorized as either cold, mild, or warm winter areas. Low levels of diapause incidence were observed along the whole latitudinal gradient. Nevertheless, we observed changes in the compositions of aphid and parasitoid species, as their levels of relative abundance varied among the climatic areas, showing that most adult individuals within the parasitoid guild are active during winter. In addition, diapause in aphid parasitoids was influenced by the attacked host species and from the perception of host scarcity in winter diapause. Likewise, direct intraspecific competition among female parasitoids in summer conditions has been translated into an increase of the diapause offspring, however, this effect was not observed in winter conditions. Thus, developmental plasticity and the observed evolutionary responses offer a mechanistic explanation for adaptive life-history variation in aphid parasitoids suggesting the success of parasitoids as natural agents depends strongly on host density and timing of seasonal activities.; Les insectes, en tant qu’ectothermes, sont connus pour vivre dans une large gamme de climats et adoptent différentes stratégies pour résister aux conditions défavorables dont la migration, la diapause ou le maintien de l’activité. Tout au long de cette thèse, les réseaux trophiques de parasitoïdes de pucerons des céréales ont été étudiés le long d’un gradient latitudinal dans la vallée centre-sud du Chili. Nous avons testé si les conditions environnementales le long de ce gradient entraînaient une incidence de diapause plus élevée aux hautes latitudes (plus froides) par rapport aux basses latitudes (plus chaudes). De plus, nous avons exploré si la diapause était régulée par un stimulus biotique (c’est-à-dire l’effet de l’hôte, la disponibilité de l’hôte et la compétition maternelle). Nous avons constaté l’absence d’un gradient de température latitudinal nord-sud clair. Sur la base de l’intensité de l’hiver, les localités échantillonnées ont été classées en zones d’hiver froides, douces ou chaudes. De faibles niveaux d’incidence de diapause ont été observés tout au long du gradient latitudinal. Néanmoins, nous avons observé des changements dans la composition des espèces de pucerons et de parasitoïdes, car leurs niveaux d’abondance relative variaient selon les zones climatiques, montrant que la plupart des individus adultes au sein de la guilde des parasitoïdes étaient actifs pendant l’hiver. De plus, la diapause chez les parasitoïdes de pucerons était influencée par les espèces hôtes attaquées et par la perception de la rareté de l’hôte pendant la diapause hivernale. De même, la compétition intraspécifique directe entre les parasitoïdes femelles dans les conditions estivales s’est traduite par une augmentation de la progéniture en diapause, cependant, cet effet n’a pas été observé dans les conditions hivernales. Ainsi, la plasticité du développement et les réponses évolutives observées offrent une explication mécaniste de la variation adaptative du cycle de vie des parasitoïdes de pucerons, suggérant que le succès des parasitoïdes en tant qu’agents naturels de contrôle biologique dépend fortement de la densité d’hôtes et de l’activité saisonnière.
الوصول الحر: https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=od______2755::85840bd5a78e46727e30456feb187934Test
https://theses.hal.science/tel-04147287/file/ALFARO_TAPIA_Armando.pdfTest -
4
المؤلفون: Castel, Jade
المساهمون: STAR, ABES
مصطلحات موضوعية: [SDE.BE] Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology, [SDV.BA] Life Sciences [q-bio]/Animal biology, Introgression, Speciation, Local adaptation, Environnement hydrothermal, Hydrothermal environment, Spéciation, Adaptation locale, Divergence, Alviniconcha, [SDV.BID] Life Sciences [q-bio]/Biodiversity
الوصف: Hydrothermal vents are not only environments that impose extreme living conditions on the species. They are also fragmented, locally ephemeral, and heterogeneous, making them an interesting study system to investigate the relative roles of geographic isolation and environmental variability on species evolution and speciation mechanisms. In the western Pacific, among the species inhabiting the hydrothermal environment, Alviniconcha (Gastropoda: Abyschrysoida) form a complex of 5 abundant architectural species. These large symbiotic gastropods, occupy the warm (7 - 42°C), sulfurous (250µM) and low oxygened (< 50µM) pole of this particular ecosystem. In my thesis, I investigated the impact of geography and spatial heterogeneity of the hydrothermal environment on the distribution, divergence, local adaptation, and speciation conditions of three Alviniconcha species (A. kojimai, A. strummeri, and A. boucheti) in five back-arc basins of the Southwest Pacific. Studies of the transcriptome, nuclear genomic polymorphism, and a gene fragment of the mitochondrial genome (Cox1) showed high divergence among the targeted species that reinforces the hypothesis of an allopatric origin of these species. But genetic inference of the most likely demographic scenario also suggests that divergence into allopatry was subsequently followed by partial recovery of gene flow by introgressive hybridization during the colonization of this environment. Several mechanisms potentially involved in interspecies reproductive barriers have been investigated. First, we found a system of genetic determinism of heterogametic male sex (XY) in A. boucheti and A. strummeri, which are both gonochoric, but this determinism is less clear in A. kojimai, which appears to be an androdiotic species. Furthermore, the local adaptation of the species to different ecological niches could have reinforced their geographical isolation when they were recontacted. Indeed, in A. boucheti the genes identified under positive selection are more specifically related to symbiosis and environmental stress. This could be related to the establishment of a particular symbiosis with Campylobacteria that tolerate higher concentrations of H2 and H2S and would explain why this species is present closer to the emissions contrary the other two species that share the same habitat with a recent positive evolution of their prezygotic mechanisms.
Les sources hydrothermales ne sont pas seulement des environnements qui imposent des conditions de vie extrêmes aux espèces qui leurs sont inféodées. Ils sont également fragmentés, localement éphémères et hétérogènes, ce qui en fait un système d’étude intéressant pour étudier les rôles relatifs de l’isolement géographique et de la variabilité environnementale sur l'évolution des espèces et les mécanismes de spéciation. Dans le Pacifique Ouest, parmi les espèces peuplant l’environnement hydrothermal, les Alviniconcha (Gastropoda : Abyssochrysoida) forment un complexe de 5 espèces architectes abondantes. Ces gros gastéropodes symbiotiques, occupent le pôle chaud (7 – 42°C), soufré (250µM) et peu oxygéné (< 50µM) de cet écosystème particulier. Au cours de ma thèse, j’ai étudié l’impact de la géographie et de l'hétérogénéité spatiale de l'environnement hydrothermal sur la distribution, la divergence, l'adaptation locale et les conditions de la spéciation de trois espèces d’Alviniconcha (A. kojimai, A. strummeri et A. boucheti) dans cinq bassins arrière-arc du Pacifique sud-ouest. L’étude du transcriptome, du polymorphisme génomique nucléaire, et d'un fragment de gène du génome mitochondrial (Cox1) a montré une divergence élevée entre les espèces ciblées qui renforce l’hypothèse d’une origine allopatrique de ces espèces. Mais l'inférence génétique du scénario démographique le plus probable suggère également que la divergence en allopatrie a ensuite été suivie d'une reprise partielle des flux de gènes par hybridation introgressive lors de la colonisation de ce milieu. Plusieurs mécanismes potentiellement impliqués dans les barrières à la reproduction entre espèces ont été étudiés. En premier lieu, nous avons mis en évidence un système de déterminisme génétique du sexe hétérogamétique mâle (XY) chez A. boucheti et A. strummeri, qui sont toutes les deux gonochoriques, mais ce déterminisme est moins clair chez A. kojimai, qui semble être une espèce androdioïque. Par ailleurs, l’adaptation locale des espèces à différentes niches écologiques aurait pu renforcer leur isolement géographique lors de leur remise en contact. En effet, chez A. boucheti les gènes identifiés sous sélection positive sont plus spécifiquement liés à la symbiose et aux stress environnementaux. Cela pourrait être lié à la mise en place d’une symbiose particulière avec des Campylobacteria qui tolèrent de plus fortes concentrations en H2 et en H2S et expliquerait pourquoi cette espèce est présente au plus proche des émissions contrairement aux 2 autres espèces qui, elles, partagent le même habitat avec une évolution positive récente de leurs mécanismes pré-zygotiques.وصف الملف: application/pdf
الوصول الحر: https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=od_______166::2030997bc6f68dd662422d29e0bbd7a0Test
https://theses.hal.science/tel-03828258Test -
5رسالة جامعية
المؤلفون: Alfaro Tapia, Armando
المساهمون: Ecosystèmes, biodiversité, évolution Rennes (ECOBIO), Université de Rennes (UR)-Institut Ecologie et Environnement - CNRS Ecologie et Environnement (INEE-CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire des Sciences de l'Univers de Rennes (OSUR), Université de Rennes (UR)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Rennes 2 (UR2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Rennes 2 (UR2)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Rennes, Universidad de Talca, Blas Lavandero, Joan Van Baaren
المصدر: https://theses.hal.science/tel-04147287Test ; Agricultural sciences. Université de Rennes; Universidad de Talca, 2022. English. ⟨NNT : 2022REN1B004⟩.
مصطلحات موضوعية: Diapause, thermal plasticity, Local adaptation, Host-Parasitoid interaction, Host effect, Plasticité thermique, Adaptation locale, Interaction hôte-Parasitoïde, Effet hôte, [SDV.SA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences
الوصف: Insects as small ectotherms are known to live in a wide range of thermal climates and have to adopt different strategies to resist unfavorable conditions such as: migration, enter in diapause or remain active. Throughout this Thesis, different ecological drivers have been explored in aphid parasitoids along a latitudinal gradient in the central‒south valley of Chile. We tested whether environmental conditions along this gradient led to a higher diapause incidence on high latitudes (colder) compared to low latitudes (warmer). In addition, we explored whether diapause is regulated by biotic stimulus (i.e., host effect, host availability, and maternal competition). We found an absence of a clear north-south latitudinal temperature gradient. Based on the intensity of winter, the sampled localities were categorized as either cold, mild, or warm winter areas. Low levels of diapause incidence were observed along the whole latitudinal gradient. Nevertheless, we observed changes in the compositions of aphid and parasitoid species, as their levels of relative abundance varied among the climatic areas, showing that most adult individuals within the parasitoid guild are active during winter. In addition, diapause in aphid parasitoids was influenced by the attacked host species and from the perception of host scarcity in winter diapause. Likewise, direct intraspecific competition among female parasitoids in summer conditions has been translated into an increase of the diapause offspring, however, this effect was not observed in winter conditions. Thus, developmental plasticity and the observed evolutionary responses offer a mechanistic explanation for adaptive life-history variation in aphid parasitoids suggesting the success of parasitoids as natural agents depends strongly on host density and timing of seasonal activities. ; Les insectes, en tant qu’ectothermes, sont connus pour vivre dans une large gamme de climats et adoptent différentes stratégies pour résister aux conditions défavorables dont la migration, la diapause ...
العلاقة: NNT: 2022REN1B004; tel-04147287; https://theses.hal.science/tel-04147287Test; https://theses.hal.science/tel-04147287/documentTest; https://theses.hal.science/tel-04147287/file/ALFARO_TAPIA_Armando.pdfTest
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6رسالة جامعية
المؤلفون: Quevarec, Loic
المساهمون: Laboratoire d'écotoxicologie des radionucléides (IRSN/PSE-ENV/SRTE/LECO), Service de recherche sur les transferts et les effets des radionucléides sur les écosystèmes (IRSN/PSE-ENV/SRTE), Institut de Radioprotection et de Sûreté Nucléaire (IRSN)-Institut de Radioprotection et de Sûreté Nucléaire (IRSN), Université du Québec à Montréal = University of Québec in Montréal (UQAM), Aix Marseille Université (AMU), IRSN, Aix-Marseille Université, Christelle ADAM GUILLERMIN
المصدر: https://irsn.hal.science/tel-04415392Test ; Sciences de l'environnement. Aix-Marseille Université, 2022. Français. ⟨NNT : 2022AIXM0342⟩.
مصطلحات موضوعية: Caenorhabditis elegans, Ionizing radiation, Experimental evolution, Local adaptation, Adaptative cost, Rayonnements ionisants, Evolution expérimentale, Adaptation locale, Coût adaptatif, Ecologie animale, Perturbations écologiques, Biologie - recherche, Radioécologie, Evolution (biologie), Nématodes, [SDE]Environmental Sciences
الوصف: Anthropogenic pressures on ecosystems, such as pollution by radioactive substances, can affect the survival and maintenance of populations. Faced with these stressors, individuals can respond rapidly through phenotypic plasticity and in the longer term, populations can adapt. However, these responses are accompanied by costs. Considering these mechanisms is important to estimate the consequences of stressors on the evolution of populations and their long-term maintenance. In this context, the aim of this project is to experimentally study the evolution of Caenorhabditis elegans populations exposed to gamma ionizing radiation (IR) and to evaluate the associated costs. For this purpose, measurements of several life history traits were performed on C. elegans populations exposed to IR (0 - 1.4 and 50 mGy.h-1) for 20 generations. Different experimental designs were also performed to establish the underlying causes of the observed trait changes and to highlight costs related to these changes. Briefly, the results showed that IR has deleterious impacts on reproduction, survival and population growth, especially at 50 mGy.h-1. In addition, we observed an adaptation of populations to IR accompanied by costs and selection of reproduction by outcrossing. These results show that an anthropogenic pressure such as IR can modify the evolutionary trajectory of a population, questioning the long-term survival of these organisms and highlight the need for such an approach in the context of an ecological risk assessment ; Les pressions anthropiques sur les écosystèmes, comme les pollutions par des substances radioactives, peuvent mettre à mal la survie et le maintien des populations. Face à ces stresseurs, les individus peuvent répondre rapidement par plasticité phénotypique et à plus long terme, les populations peuvent s’adapter. Toutefois, ces réponses s’accompagnent de coûts. La prise en compte de ces mécanismes est importante pour estimer les conséquences des stresseurs sur l’évolution des populations et leur maintien à long ...
العلاقة: NNT: 2022AIXM0342; tel-04415392; https://irsn.hal.science/tel-04415392Test; https://irsn.hal.science/tel-04415392/documentTest; https://irsn.hal.science/tel-04415392/file/221028_QUEVAREC.pdfTest
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7رسالة جامعية
المؤلفون: Castel, Jade
المساهمون: Adaptation et diversité en milieu marin (ADMM), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Station biologique de Roscoff = Roscoff Marine Station (SBR), Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Sorbonne Université, Didier Jollivet, Thomas Broquet
المصدر: https://theses.hal.science/tel-03828258Test ; Biodiversité. Sorbonne Université, 2022. Français. ⟨NNT : 2022SORUS160⟩.
مصطلحات موضوعية: Speciation, Divergence, Introgression, Local adaptation, Hydrothermal environment, Alviniconcha, Spéciation, Adaptation locale, Environnement hydrothermal, [SDV.BID]Life Sciences [q-bio]/Biodiversity, [SDV.BA]Life Sciences [q-bio]/Animal biology, [SDE.BE]Environmental Sciences/Biodiversity and Ecology
الوصف: Hydrothermal vents are not only environments that impose extreme living conditions on the species. They are also fragmented, locally ephemeral, and heterogeneous, making them an interesting study system to investigate the relative roles of geographic isolation and environmental variability on species evolution and speciation mechanisms. In the western Pacific, among the species inhabiting the hydrothermal environment, Alviniconcha (Gastropoda: Abyschrysoida) form a complex of 5 abundant architectural species. These large symbiotic gastropods, occupy the warm (7 - 42°C), sulfurous (250µM) and low oxygened (< 50µM) pole of this particular ecosystem. In my thesis, I investigated the impact of geography and spatial heterogeneity of the hydrothermal environment on the distribution, divergence, local adaptation, and speciation conditions of three Alviniconcha species (A. kojimai, A. strummeri, and A. boucheti) in five back-arc basins of the Southwest Pacific. Studies of the transcriptome, nuclear genomic polymorphism, and a gene fragment of the mitochondrial genome (Cox1) showed high divergence among the targeted species that reinforces the hypothesis of an allopatric origin of these species. But genetic inference of the most likely demographic scenario also suggests that divergence into allopatry was subsequently followed by partial recovery of gene flow by introgressive hybridization during the colonization of this environment. Several mechanisms potentially involved in interspecies reproductive barriers have been investigated. First, we found a system of genetic determinism of heterogametic male sex (XY) in A. boucheti and A. strummeri, which are both gonochoric, but this determinism is less clear in A. kojimai, which appears to be an androdiotic species. Furthermore, the local adaptation of the species to different ecological niches could have reinforced their geographical isolation when they were recontacted. Indeed, in A. boucheti the genes identified under positive selection are more specifically related to ...
العلاقة: NNT: 2022SORUS160; tel-03828258; https://theses.hal.science/tel-03828258Test; https://theses.hal.science/tel-03828258/documentTest; https://theses.hal.science/tel-03828258/file/CASTEL_Jade_2022.pdfTest
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8مؤتمر
المؤلفون: Dawson, Julie, Berthellot, Jean-François, Mercier, Florent, Kochko, Patrick, Galic, Nathalie, Giuliano, Simon, Serpolay-Besson, Estelle, Thomas, Mathieu, Goldringer, Isabelle
المساهمون: Génétique Quantitative et Evolution - Le Moulon (Génétique Végétale) (GQE-Le Moulon), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-AgroParisTech-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Réseau Semences Paysannes, SAD Paysage (SAD Paysage), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST
المصدر: Innovation & sustainable development in agriculture and food ; ISDA 2010 "Innovation & Sustainable Development in Agriculture and Food" ; https://hal.science/hal-01458574Test ; ISDA 2010 "Innovation & Sustainable Development in Agriculture and Food", Jun 2010, Montpellier, France
مصطلحات موضوعية: SÉLECTION PARTICIPATIVE VARIÉTÉS PAYSANNES, ADAPTATION LOCALE, DIVERSITÉ GÉNÉTIQUE, RECHERCHE-ACTION, [SDV]Life Sciences [q-bio]
جغرافية الموضوع: Montpellier, France
الوصف: La contribution des paysans au maintien de la diversité des espèces cultivées est bien reconnue dans les pays où l'agriculture traditionnelle est encore prédominante. Cette reconnaissance mériterait d'être étendue aux paysans des pays industrialisés qui participent à des programmes de sélection participative. En effet, les paysans pratiquant l’agriculture biologique (AB) ou à faible niveau d’intrants sont confrontés à un manque de variétés bien adaptées à leurs conditions environnementales complexes, et sont de plus en plus inquiets de la perte de diversité, qui peut affecter le potentiel adaptatif des espèces cultivées. La sélection à la ferme des variétés populations hétérogènes est une stratégie pour répondre au manque de variétés adaptées. La sélection participative vise à valoriser les connaissances et les savoirs-faire distribués entre paysans et chercheurs en fonctionnant sous forme de projet collaboratif. Deux projets de recherche sont présentés dans cet article, un dans le contexte d’un projet Européen sur l’adaptation et l’évolution des variétés paysannes, et l’autre dans le contexte d’un réseau d’échanges de semences entres paysans français dans lequel les acteurs sont en train de développer des nouvelles populations de blé tendre à partir de croisements entre variétés de pays et/ou variétés anciennes. Les résultats préliminaires montrent que les paysans apportent une approche holistique lors des phases de sélection, mais qu’il y a aussi des differences quantitatives entre les plantes qu’ils sélectionnent et la les plantes non-sélectionnées. Ce type de sélection conduit à des changements significatifs dans les générations précoces des populations issues des croisements. Ces expériences permettent aussi de mieux comprendre et de mieux apprécier les approches respectives des paysans et des chercheurs et leur apport réciproque dans le développement de programme de sélection en condition d’AB.
العلاقة: hal-01458574; https://hal.science/hal-01458574Test; https://hal.science/hal-01458574/documentTest; https://hal.science/hal-01458574/file/46145_20110318023723762_1.pdfTest; PRODINRA: 46145
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9رسالة جامعية
المؤلفون: Aubree, Flora
المساهمون: Institut Sophia Agrobiotech (ISA), Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Université Côte d'Azur (UniCA), Université Côte d'Azur, Vincent Calcagno
المصدر: https://theses.hal.science/tel-03564467Test ; Populations and Evolution [q-bio.PE]. Université Côte d'Azur, 2021. English. ⟨NNT : 2021COAZ6023⟩.
مصطلحات موضوعية: Adaptive dynamics, Eco-evolutionary dynamics, Species interactions, Population genetics, Temporally variable migration, Gene flow, Local adaptation, Stochastic simulations, Dynamiques adaptatives, Dynamiques éco-évolutives, Interactions entre espèces, Génétique des populations, Migration variable dans le temps, Flux génétique, Adaptation locale, Simulations stochastiques, [SDV.GEN.GPO]Life Sciences [q-bio]/Genetics/Populations and Evolution [q-bio.PE], [SDV.EE]Life Sciences [q-bio]/Ecology, environment, [SDV.BID.EVO]Life Sciences [q-bio]/Biodiversity/Populations and Evolution [q-bio.PE]
الوصف: The world is changing at an unprecedented rate in many interconnected aspects, and ecosystems are primarily concerned. The current shift in environmental conditions is accompanied by an increase in the temporal variability of environmental processes, which is also driven by anthropogenic activities. This work is part of the effort to understand how variability in key environmental processes impacts ecosystem composition and ecological and evolutionary functioning at different scales. The focus is made in particular on the interplay between such variability and the process of adaptation, which is a key aspect of ecosystem dynamics. Adaptation is integral to the functioning of ecosystems, yet it is still relatively little considered. In this thesis, three biological scales are considered – the scale of the community, the scale of the species, and the scale of populations. A theoretical modeling approach is used to introduce some aspects of variability and investigate how ecological and evolutionary dynamics are impacted.At the community scale, the impact that changes in the species co-adaptation level may have on some biodiversity-ecosystem functioning (BEF) relationships (diversity-productivity, diversity-stability and diversity-response to invasion relationships) is questioned. Random and co-adapted communities are compared using adaptive dynamics methods. Results show that species co-adaptation impacts most BEF relationships, sometimes inverting the slope of the relationship. At the species scale, the evolution of stress tolerance under a tolerance-fecundity trade-off model is explored using adaptive dynamics as well. The evolutionary outcomes are determined under different trade-offs and different stress distributions. The most critical parameters in determining the evolutionary outcomes (ESS trait value, branching) are highlighted, and they evidence that stress level heterogeneity is more critical than average stress level. At the population scale, gene flow between sub-populations of the same species is an ...
العلاقة: NNT: 2021COAZ6023; tel-03564467; https://theses.hal.science/tel-03564467Test; https://theses.hal.science/tel-03564467/documentTest; https://theses.hal.science/tel-03564467/file/2021COAZ6023.pdfTest
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10رسالة جامعية
المؤلفون: Gauff, Robin
المساهمون: Adaptation et diversité en milieu marin (ADMM), Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Station biologique de Roscoff = Roscoff Marine Station (SBR), Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Sorbonne Université, Dominique Davoult, Christophe Lejeusne
المصدر: https://theses.hal.science/tel-03904604Test ; Biodiversity. Sorbonne Université, 2021. English. ⟨NNT : 2021SORUS278⟩.
مصطلحات موضوعية: Introduced species, Urbanization, Pollution, Local adaptation, Climate change, Espèces introduites, Urbanisation, Adaptation locale, Changement climatique, [SDV.BID]Life Sciences [q-bio]/Biodiversity
الوصف: Marine infrastructures offer new substrates, colonized by a variety of organisms (biofouling), but are different from natural habitats since environmental filters and ecological processes differ, biotic composition differs from natural habitats, and they are characterized by a high diversity and abundance of non-indigenous species (NIS). Artificialization in marinas modifies hydrodynamism, affecting the water column characteristics like temperature and favoring the concentration of anthropic disturbances like pollutants. Environmental gradients may be present, with higher levels of disturbance in the innermost parts of marinas, acting as selective filters for organisms. The present work aimed to understand the diversity and functioning of sessile communities in marinas by studying how disturbance gradients shape community structure and function between the entrances of marinas and their more disturbed inner parts. A particular focus laid on NIS, which are common in marinas and constitute an important societal challenge. An experimental approach (reciprocal transplant) in six marinas from two regions (Mediterranean, Atlantic), revealed that differences in community structure are caused by local pollution levels, associated to local adaptation at small spatial scale (<100m). However, other processes might affect these dynamics like biotic interactions (predation) and pulse disturbances (heat waves). In the context of climate change, we also tested how projected seawater warming (+3°C) may impact marina communities and might favor NIS. These results might help understanding how disturbances in marine urban ecosystems drive biodiversity and especially the prevalence of NIS. ; Les infrastructures marines offrent des nouveaux substrats, colonisés par divers organismes (biofouling), mais qui diffèrent des habitats naturels par leurs filtres environnementaux et processus écologiques, leur composition biotique et leur grande diversité/abondance d’espèces non indigènes (ENI). L’artificialisation dans les marinas ...
العلاقة: NNT: 2021SORUS278; tel-03904604; https://theses.hal.science/tel-03904604Test; https://theses.hal.science/tel-03904604/documentTest; https://theses.hal.science/tel-03904604/file/GAUFF_Robin_these_2021.pdfTest
