رسالة جامعية
Regulação pós-transcricional em Halobacterium salinarum NRC-1: caracterização do gene VNG_RS05855 ; Post-transcriptional regulation in Halobacterium salinarum NRC-1: characterization of VNG_RS05855 gene
| العنوان: | Regulação pós-transcricional em Halobacterium salinarum NRC-1: caracterização do gene VNG_RS05855 ; Post-transcriptional regulation in Halobacterium salinarum NRC-1: characterization of VNG_RS05855 gene |
|---|---|
| المؤلفون: | Gutierrez, Junier Marrero |
| المساهمون: | Koide, Tie, Vencio, Ricardo Zorzetto Nicoliello |
| بيانات النشر: | Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP Universidade de São Paulo Bioinformática |
| سنة النشر: | 2019 |
| المجموعة: | University of São Paulo: Digital Library of Theses and Dissertations / Biblioteca Digital de Teses e Dissertações da USP |
| مصطلحات موضوعية: | VNG_RS05855, RNases, RNA-seq, Regulação pós-transcricional, Metalo-β-lactamases, Halobacterium salinarum NRC-1, bioinformática, Ensaios fenotípicos, asRNA, Atividade in vitro, Post-transcriptional regulation, Phenotypic assays, Bioinformatics, Metallo-β-lactamases, In vitro assays |
| الوصف: | A família das enzimas metalo-β-lactamases compreende um grupo de proteínas com participação no metabolismo dos ácidos nucleicos. Nos genomas procariotos, muitas proteínas estão anotadas como potenciais metalo-β-lactamases, porém sem função comprovada. Este é o caso do gene VNG_RS05855 de Halobacterium salinarum NRC-1, organismo em que os principais atores da regulação pós-transcricional, as RNases, também são pouco conhecidos. Nesta pesquisa, relatamos a primeira caracterização da metalo-β-lactamase VNG_RS05855 da arquéia halofílica H. salinarum NRC-1 no contexto da regulação pós-transcricional, mediante a integração de abordagens experimentais e computacionais. VNG_RS05855 compartilha similaridade de sequência com proteínas descritas com atividade ribonucleolítica, porém a ausência de domínios específicos (exosite) coloca em dúvida a afirmação desta função. O gene apresenta uma expressão relativa basal durante o crescimento, que se altera diante de perturbações ambientais e genéticas, e é correlacionada a outras RNases como ocorre com RNase de outros organismos. Embora a ausência do gene VNG_RS05855 não tenha afetado nem a viabilidade nem o crescimento da linhagem nocaute (VNG_RS05855), foram observadas ligeiras diferenças fenotípicas em relação a linhagem controle frente a baixas concentrações de metais de transição (Zn2+ , Cu2+ , Fe2+ , Mn 2+ , Co 2+ ), ao metalóide NaAsO2 , ao agente oxidante H2O2 e a variações de sais do meio de cultura. Outros fatores que poderiam ser responsáveis por essas diferenças como a liberação de vesículas de gás e a produção de bacteriorodopsina foram descartados. Também foram identificadas diferenças no pH diante das transições metabólicas promovidas por mudanças na disponibilidade de nutrientes e luz. Ao analisar a sobrevivência da linhagem nocaute em concentrações semi-letais de Cu 2+ , AsO 2 - e PQT não observamos diferenças em relação a linhagem controle, sugerindo que no prévio condicionamento ao estresse, VNG_RS05855 não participe nas respostas adaptativas. De acordo com ... |
| نوع الوثيقة: | doctoral or postdoctoral thesis |
| وصف الملف: | application/pdf |
| اللغة: | Portuguese |
| العلاقة: | https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-03122019-115209Test/ |
| DOI: | 10.11606/T.95.2019.tde-03122019-115209 |
| الإتاحة: | https://doi.org/10.11606/T.95.2019.tde-03122019-115209Test https://www.teses.usp.br/teses/disponiveis/95/95131/tde-03122019-115209Test/ |
| حقوق: | Liberar o conteúdo para acesso público. |
| رقم الانضمام: | edsbas.1762F72B |
| قاعدة البيانات: | BASE |
| DOI: | 10.11606/T.95.2019.tde-03122019-115209 |
|---|