التفاصيل البيبلوغرافية
| العنوان: |
Epigenetic Analysis of Long-term Epilepsy-Associated Tumors by Methylation-Specific Multiplex Ligation-dependent Probe Amplification |
| العنوان البديل: |
Análise Epigenética de Tumores Associados a Epilepsia de Longa Duração por Methylation-Specific Multiplex Ligation-dependent Probe Amplification |
| المؤلفون: |
Jesus-Ribeiro, Joana, Ribeiro, Ilda Patrícia, Pires, Luis Miguel, Rebelo, Olinda, Pereira, Ricardo, Bento, Conceição, Sales, Francisco, Santana, Isabel, Freire, António, Barbosa Melo, Joana |
| بيانات النشر: |
Portuguese Society of Neurology, 2024. |
| سنة النشر: |
2024 |
| مصطلحات موضوعية: |
Brain Neoplasms/diagnosis, Brain Neoplasms/genetics, DNA Methylation, Epilepsy, Gene Expression Profiling, Epilepsia, Metilação de DNA, Neoplasias Encefálicas/ diagnóstico, Neoplasias Encefálicas/ genética, Perfilação da Expressão Génica |
| الوصف: |
Introduction: Ganglioglioma and dysembryoplastic neuroepithelial tumor represent the most common neoplasms in the group of long-term epilepsy-associated tumors. Mapping of epigenetic alterations, particularly DNA methylation, has recently been shown to offer promising perspectives in brain tumors, identifying key genes that may serve as potential diagnostic biomarkers. We aim to perform a genetic and epigenetic analysis using long-term epilepsy-associated tumors’ tissue, to contribute to the identification of such biomarkers. Methods: DNA copy number alterations and methylation status in genes relevant to tumorigeneses were analyzed by methylation-specific multiplex ligation-dependent probe amplification using fresh frozen postoperative tissue obtained from epilepsy surgery. Results: From the six tumors included in the study (three gangliogliomas and three dysembryoplastic neuroepithelial tumors), one ganglioglioma harboring a BRAF:p.V600E mutation presented changes in methylation status. This particularly patient had a focal epilepsy with video-electroencephalogram (EEG) reveling an ictal pattern in the right occipito-parietal region. Brain magnetic resonance imaging revealed a right mesial temporal lesion. His seizure frequency increased despite antiepileptic treatment and two years later he underwent his first surgery. Two more surgeries were performed years later due to seizure recurrence associated to an increase of the residual tumor. Postsurgical Engel class is IIA at three years of follow-up. Copy number losses were detected in chromosomes 1p (TP73), 2p (MSH6), 3p (VHL), 10p (CREM), 11q (GSTP1), 12q (CHFR), 14q (MLH3), 16p (PYCARD), 17p (TP53), 17q (BRCA1) and 19p (STK11). Copy number gains were detected in chromosome 11p (CD44). The MGMT (58%) and CD44 (51%) genes were methylated. Conclusion: A high number of chromosomal aberrations were identified in one ganglioglioma, among which deletions dominated, reinforcing the spectrum of chromosomal abnormalities previously described. We observed copy number gain and methylation in CD44, which contributes to cell-cell/cell-matrix interactions. The methylation of MGMT, involved in DNA repair, is concordant to other studies. Our data highlight the importance of unravel new chromosomal imbalances and the role of DNA methylation in theses tumors, which may provide more arguments in favor of an integrative histological and (epi)genetic classification. |
| الوصف (مترجم): |
Introdução: O ganglioglioma e o tumor neuroepitelial disembrioplásico representam as neoplasias mais comuns no grupo de tumores associados a epilepsia de longa duração. O mapeamento de alterações epigenéticas, particularmente a metilação do DNA, demonstrou oferecer perspetivas promissoras nos tumores cerebrais, identificando genes-chave que podem representar potenciais biomarcadores diagnósticos. O nosso objetivo é realizar uma análise genética e epigenética usando tecido de tumores associados a epilepsia de longa duração, para contribuir na identificação de tais biomarcadores. Métodos: Alterações no número de cópias de DNA e padrão de metilação em genes relevantes para tumorigénese foram analisados por methylation-specific multiplex ligation-dependent probe amplification, usando tecido pós-operatório fresco congelado obtido na cirurgia de epilepsia. Resultados: Dos seis tumores incluídos no estudo (três gangliogliomas e três tumores neuroepiteliais disembrioplásicos), um ganglioglioma com mutação BRAF:p. V600E apresentou alterações na metilação. Este doente em particular tinha uma epilepsia focal, com o vídeo-eletroencefalograma (EEG) a revelar um padrão ictal na região occipito-parietal direita. A ressonância magnética cerebral revelou uma lesão temporal mesial direita. A frequência das crises aumentou apesar do tratamento antiepilético e dois anos depois foi submetido à sua primeira cirurgia. Mais duas cirurgias foram realizadas anos depois devido à recorrência de crises associada ao aumento do tumor residual. A classe de Engel pós-cirurgia é IIA aos três anos de seguimento. Perdas no número de cópias foram detetadas nos cromossomas 1p (TP73), 2p (MSH6), 3p (VHL), 10p (CREM), 11q (GSTP1), 12q (CHFR), 14q (MLH3), 16p (PYCARD), 17p (TP53), 17q (BRCA1) and 19p (STK11). Ganhos no número de cópias foram detetados no cromossoma 11p (CD44). Os genes MGMT (58%) e CD44 (51%) encontravam-se metilados. Conclusão: Identificou-se um elevado número de alterações cromossómicas num ganglioglioma, com predomínio de deleções, reforçando o espectro de alterações cromossómicas previamente descrito. Observámos um ganho no número de cópias e metilação do CD44, que contribui para interações célula-célula/célula-matriz. A metilação do MGMT, envolvida na reparação do DNA, está de acordo com outros estudos. Os nossos dados destacam a importância de desvendar novos desequilíbrios cromossómicos e o papel da metilação do DNA nesses tumores, fornecendo mais argumentos a favor de uma classificação histológica e (epi)genética integrada. |
| نوع الوثيقة: |
journal article |
| وصف الملف: |
application/pdf |
| اللغة: |
English |
| العلاقة: |
https://sinapse.pt/index.php/journal/article/view/50Test; https://sinapse.pt/index.php/journal/article/view/50/45Test |
| DOI: |
10.46531/sinapse/AO/220054/2023 |
| حقوق: |
Copyright (c) 2024 Joana Jesus-Ribeiro, Ilda Patrícia Ribeiro, Luis Miguel Pires, Olinda Rebelo, Ricardo Pereira, Conceição Bento, Francisco Sales, Isabel Santana, António Freire, Joana Barbosa Melo |
| رقم الانضمام: |
rcaap.com.SPN.sinapse.pt.article.50 |
| قاعدة البيانات: |
RCAAP |
