رسالة جامعية
Multiplexed Genetic Perturbations of the Regulatory Network of E. coli. ; Perturbations génétiques multiplexées du réseau régulateur de E. coli
| العنوان: | Multiplexed Genetic Perturbations of the Regulatory Network of E. coli. ; Perturbations génétiques multiplexées du réseau régulateur de E. coli |
|---|---|
| المؤلفون: | Deyell, Matthew |
| المساهمون: | Sorbonne Paris Cité, Griffiths, Andrew D., Nghe, Philippe |
| سنة النشر: | 2018 |
| المجموعة: | theses.fr |
| مصطلحات موضوعية: | CRISPR, Microfluidique, Réseau transcriptionnel, Association génotype-phénotype, Séquençage de l'ARN, Microfluidics, Transcriptional Network, Genotype to Phenotype Mapping, Single-cell RNA sequencing |
| الوصف: | Malgré les progrès réalisés dans le séquençage de l’ADN, nous n’avons pas encore compris comment le phénotype d’un organisme se rapporte au contenu de son génome. Cependant, il est devenu clair que l'impact des gènes dépend du contexte. La simple présence d'un gène dans un génome ne nous informe pas du moment où il est exprimé et des autres gènes qui y sont exprimés. Comprendre comment l'expression des gènes est régulée est un élément nécessaire pour comprendre comment les phénotypes émergent d'un génotype donné. Les facteurs de transcription, qui peuvent activer ou réprimer l'expression d'un gène, forment un réseau complexe d'interactions entre eux et leurs gènes ciblés. Ce réseau consiste en une hiérarchie de groupes de facteurs de transcription fortement liés, chacun lié à des processus cellulaires distincts. La structure de ce réseau de régulation transcriptionnelle est-elle significative pour la réponse transcriptionnelle d'une cellule? Ici, nous utilisons une protéine de liaison à l'ADN programmable appelée CRISPR (répétitions courtes palindromiques groupées régulièrement) pour perturber l'expression génique des régulateurs globaux au sein du réseau de régulation transcriptionnelle. Ces régulateurs mondiaux régulent de nombreux processus cellulaires distincts et ont de nombreuses cibles génétiques. Le système CRISPR nous permet de perturber ces régulateurs dans toutes les combinaisons possibles, y compris les perturbations d'ordre supérieur avec tous les régulateurs mondiaux potentiellement ciblés perturbés en même temps. Nous enregistrons ensuite à la fois le modèle d'expression du transciptome en utilisant le séquençage de l'ARN et l'adéquation de chaque souche. Nous trouvons que la structure du réseau de régulation augmente la dimensionnalité de la réponse transcriptionnelle plutôt que de la réduire. Cela se traduit par une épistasie importante au-delà des interactions par paires. Cela a des implications sur la façon dont ces réseaux évoluent. L'épistasie par paires que nous trouvons entre les facteurs ... |
| نوع الوثيقة: | thesis still image |
| اللغة: | English |
| العلاقة: | http://www.theses.fr/2018USPCC175/documentTest |
| الإتاحة: | http://www.theses.fr/2018USPCC175/documentTest |
| حقوق: | Open Access ; http://purl.org/eprint/accessRights/OpenAccessTest |
| رقم الانضمام: | edsbas.23B4BDD |
| قاعدة البيانات: | BASE |
| الوصف غير متاح. |