المؤلفون: Roos, Johannes

المساهمون: Bordeaux, Nägerl, Valentin

مصطلحات موضوعية: Bioimagerie, Analysis, Pipelines d'analysis, Open-Source, Plateforme logicielle, Microscopie intelligente, Bioimages, Analysis workflows, Software-Platform, Smart microscopy

الوصف: Les processus d'analyse d’images biologiques se sont transformés de manière spectaculaire au cours des dernières années, accélérés par l'émergence de l’intelligence artificielle et de l'apprentissage profond (deep learning) en particulier. En effet, des défis autrefois considérés comme impossibles à relever, tels que la segmentation 3D de données microscopiques complexes, ou la microscopie intelligente (pilotée par les données) semblent désormais réalisables. Les nouvelles modalités d'imagerie battent des records à la fois en termes de résolution et de vitesse d'acquisition.Cette évolution s'accompagne d'une variété de nouvelles plateformes logicielles et d'outils informatiques, ainsi que de l'exigence de ressources computationnelles dédiées telles que les GPU. En l'absence d'un cadre commun pour ces outils, la gestion fastidieuse des données, ainsi que l'orchestration complexe de ces nouvelles technologies limitent fortement ces nouvelles technologies à un nombre limité d’experts en programmation, réduisant leur impact en biologie.En outre, la plupart des méthodes existantes sont encore limitées dans leurs capacités à gérer les données en temps réel. Elles sont généralement restreintes à des analyses post-acquisitions, limitant l’émergence de la microscopie intelligente, où le résultat de l'analyse peut influencer l'acquisition.Ce travail de thèse présente un nouveau logiciel libre, Arkitekt, servant d'intermédiaire entre les utilisateurs et les applications en bio-imagerie. Arkitekt permet la conception graphique et conviviale de flux de travail, ou pipeline, orchestrant de manière fiable et efficace les logiciels de bioimagerie existants, localement ou à distance, en temps réel ou post-acquisition. Il s'interface avec les logiciels de visualisation et d'analyse les plus répandus, comme ImageJ ou Napari, et intègre également les scripts des développeurs et les logiciels d'acquisition.Cette thèse est organisée en 3 parties principales. Après une introduction générale sur l'histoire de l'analyse d’images ...

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المؤلفون: Roos, Jean

المساهمون: Université Côte d'Azur, Latour, Xavier

مصطلحات موضوعية: Danger, Droit constitutionnel, Droit administratif, Droit public, Libertés publiques, Police administrative, Constitutional law, Administrative law, Public liberties, Administrative police, Public law

الوصف: Envisagée par les théoriciens de l'État comme fondant le contrat social, la fin de l'état de nature n'a paradoxalement pas chassé le danger du sein de la société. Les risques environnementaux, les périls sanitaires, ou les menaces nées du terrorisme et d'ingérences étrangères peuvent notamment s'observer aux niveaux national et local. La collectivité est alors au défi d'y répondre tout en garantissant les principes de la démocratie libérale et de l'état de droit. La notion de danger, intégrée dans des instruments fondant à la fois le pouvoir et la défense des libertés, peut alors être analysée pour en comprendre les contours et le contenu en droit public. La proposition est alors de considérer cette notion comme reflétant une situation autant qu'une condition. En tant que situation, le danger permet de comprendre les relations qui unissent l'ordre public, l'intérêt général et les intérêts fondamentaux de la Nation. En tant que condition, le danger permet à la puissance publique une modulation entre l'exceptionnel, le dérogatoire et le droit commun, mais également entre la réparation, l'abstention et l'action. ; Envisioned by theorists of the State as founding the social contract, the end of the state of nature has paradoxically not chased away danger from the heart of modern societies. Environmental risks, health hazards, or threats arising from terrorism and foreign interferences can notably be observed at the national and local levels. The collectivity is then challenged to respond while guaranteeing the principles of liberal democracy and the rule of law. The notion of danger, integrated into instruments establishing both power and the defense of civil liberties, can then be analyzed to know its contours and content in public law. The proposal is then to consider this notion as reflecting a situation as much as a condition. As a situation, danger allows to understand the relationships that unite public order, the general interest and the fundamental interests of the Nation. As a condition, danger allows ...

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المؤلفون: Roos, Jérémy

المساهمون: Lyon, Bonnevay, Stéphane, Gavin, Gérald

مصطلحات موضوعية: Prévision à court terme, Flux de voyageurs, Réseaux bayésiens, Modèles de mélanges gaussiens, Algorithme espérance-maximisation, Short-term forecasting, Passenger flows, Bayesian networks, Gaussian mixture models, Expectation-maximisation algorithm

الوقت: 004

الوصف: Dans ces travaux de thèse, nous proposons un modèle de prévision à court terme des flux de voyageurs basé sur les réseaux bayésiens. Ce modèle est destiné à répondre à des besoins opérationnels divers liés à l'information voyageurs, la régulation des flux ou encore la planification de l'offre de transport. Conçu pour s'adapter à tout type de configuration spatiale, il permet de combiner des sources de données hétérogènes (validations des titres de transport, comptages à bord des trains et offre de transport) et fournit une représentation intuitive des relations de causalité spatio-temporelles entre les flux. Sa capacité à gérer les données manquantes lui permet de réaliser des prédictions en temps réel même en cas de défaillances techniques ou d'absences de systèmes de collecte ; In this thesis, we propose a Bayesian network model for short-term passenger flow forecasting. This model is intended to cater for various operational needs related to passenger information, passenger flow regulation or operation planning. As well as adapting to any spatial configuration, it is designed to combine heterogeneous data sources (ticket validation, on-board counts and transport service) and provides an intuitive representation of the causal spatio-temporal relationships between flows. Its ability to deal with missing data allows to make real-time predictions even in case of technical failures or absences of collection systems

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المؤلفون: Roos-Weil, Damien

المساهمون: Université Paris-Saclay (ComUE), Bernard, Olivier

مصطلحات موضوعية: Waldenström, NGS, SPI1, PU.1

الوصف: Les facteurs de transcription ETS sont divisés en sous-familles en fonction de leurs similitudes en matière de séquence protéique, de séquences de liaison à l'ADN et d’interactions avec différents cofacteurs. Ils sont régulés par des signaux extracellulaires et contribuent à divers processus cellulaires, dont la prolifération cellulaire et la transformation tumorale. Les gènes de la famille ETS sont fréquemment ciblés par des processus oncogéniques que ce soit des translocations chromosomiques ou des gains du nombre de leurs copies. Le gène PU.1/SPI1 est également ciblé par des mutations ponctuelles inactivatrices dans les hémopathies myéloïdes humaines. Nous avons étudié une mutation somatique récurrente du gène PU.1/SPI1 (c.676C>G, p.Q226E), identifiée chez environ 6% des patients atteints d’une macroglobulinémie de Waldenström (MW), un syndrome lymphoprolifératif B chronique rare. La mutation modifie les caractéristiques de liaison à l'ADN de la protéine mutante, passant des séquences classiques reconnues par SPI1 à des séquences reconnues par d’autres protéines ETS comme ETS1, et d’une liaison à des régions enhancer à une liaison à des régions promotrices. La liaison accrue du mutant de SPI1 aux régions promotrices active des programmes transcriptionnels impliquant des voies de signalisation intracellulaire généralement favorisées par d'autres membres de la famille ETS. Les conséquences fonctionnelles de cette mutation sont une augmentation de la prolifération cellulaire et une diminution de la différenciation lymphoïde B terminale dans une lignée cellulaire modèle et des échantillons primaires de MW. Nous décrivons ici un mécanisme de subversion oncogénique de la fonction d’un facteur de transcription suite à la modification subtile de la spécificité de liaison à l'ADN de la protéine mutante, menant à un arrêt de différenciation. La démonstration qu'une mutation somatique ponctuelle peut modifier l'équilibre de liaison d’un facteur de transcription à l’échelle du génome fournit un paradigme mécanistique ...

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المؤلفون: Roos, Valentine

المساهمون: Paris Sciences et Lettres (ComUE), Bernard, Patrick

مصطلحات موضوعية: Équation de Hamilton-Jacobi, Dynamique hamiltonienne non convexe, Solutions de viscosité, Solutions variationnelles, Fronts d'onde, Familles génératrices, Sélecteur minmax, Hamilton-Jacobi equation, Nonconvex Hamiltonian dynamics, Viscosity solutions, Variational solutions, Wavefronts, Generating families, Minmax selector

الوقت: 511

الوصف: On étudie l'équation de Hamilton-Jacobi évolutive du premier ordre, couplée avec une donnée initiale lipschitzienne. Le but est de comparer les solutions de viscosité et les solutions variationnelles pour cette équation, deux notions de solutions faibles qui coïncident en dynamique hamiltonienne convexe. Pour travailler dans un cadre pertinent pour les deux types de solutions, on doit d’abord construire une solution variationnelle sans hypothèse de compacité sur la variété ou le hamiltonien étudiés. On retrace dans ce cas la construction historique des solutions variationnelles, en détaillant les propriétés de la famille génératrice obtenue par la méthode des géodésiques brisées. Il en découle des estimées permettant d’obtenir la solution de viscosité à partir de la solution variationnelle par un procédé d’itération. Après avoir vérifié que la solution variationnelle construite coïncide effectivement avec la solution de viscosité pour un Hamiltonien convexe, on caractérise les Hamiltoniens intégrables pour lesquels cette propriété persiste, en étudiant attentivement des exemples élémentaires en dimension 1 et 2. ; We study the first order Hamilton-Jacobi equation associated with a Lipschitz initial condition. The purpose of this thesis is to compare two notions of weak solutions for this equation, namely the viscosity solution and the variational solution, that are known to coincide in convex Hamiltonian dynamics. In order to work in a relevant framework for both notions, we first need to build a variational solution without compactness assumption on the manifold or the Hamiltonian. To do so, we follow the historical construction, detailing properties of the generating family obtained via the broken geodesics method. Local estimates allow to prove that the viscosity solution can be obtained from the variational solution via an iterative process. We then check that this construction gives effectively the viscosity solution for a convex Hamiltonian, and characterize the integrable Hamiltonians for which this ...

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المؤلفون: Roos, Orianne

المساهمون: Sorbonne Paris Cité, Bournaud, Frédéric, Juneau, Stéphanie

مصطلحات موضوعية: Trous noirs supermassifs, Vents galactiques, Galaxies à haut redshift, Supermassive black holes, Galactic winds, High-redshift galaxies

الوصف: Dans l’Univers, on observe des galaxies lointaines ne formant plus d’étoiles, mais les astrophysiciens n’ont pas encore identifié avec certitude les phénomènes physiques à l’origine de leur “mort”. Pour apporter des éléments de réponse, je me suis penchée sur l’étude de phénomènes qui pourraient y jouer un rôle : les processus de rétroaction des étoiles et des trous noirs supermassifs actifs, la formation stellaire, et les vents galactiques. Le Chapitre 1 présente toutes les notions nécessaires à la compréhension du problème : les caractéristiques des galaxies typiques de l’Univers proche et lointain ; les vents galactiques ; la mort des galaxies; les trous noirs supermassifs actifs (noyaux actifs de galaxies, AGN) et les étoiles ; et leur rétroaction. Dans le Chapitre 2, je présente les techniques numériques utilisées : le code de simulations astrophysiques RAMSES et le code de transfert radiatif Cloudy, que j’ai utilisé pour développer une méthode de calcul de l’état d’ionisation d’une galaxie, détaillée au Chapitre 3. Le Chapitre 4 étudie le couplage entre les trous noirs actifs et les étoiles, avec le projet POGO, Origines Physiques des Vents Galactiques. Durant cette thèse, j’ai montré que les trous noirs actifs n’étaient pas en mesure de tuer subitement leur hôte, même en prenant en compte la rétroaction des étoiles, et que leur couplage peut réduire ou renforcer les vents dans les galaxies en fonction de leur masse. Le Chapitre 5 fait un état de l’art du domaine avant et pendant mon doctorat, reprend les conclusions de cette thèse et donne quelques perspectives, notamment en ce qui concerne le rôle additionnel des rayons cosmiques dans la mort des galaxies ; In the Universe, we observe galaxies forming no, or almost no, stars anymore, but astrophysicists do not know yet what physical mechanisms cause their “death”. To give clues to solve the problem, I studied feedback processes from stars and active supermassive black holes, star formation and galactic outflows. Chapter 1 presents all the notions to ...

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المؤلفون: Roos, Kevin

المساهمون: Bordeaux, Carlotti, Stéphane

مصطلحات موضوعية: Polymérisation anionique par ouverture de cycle, Polyamide-3, Acrylamide, Polymérisation par transfert d’hydrogène, Réticulation, Polyéther, Activation du monomère, Anionic ring-opening polymerization, Hydrogen-transfer polymerization, Crosslinking, Polyether, Monomer activation

الوصف: Ces travaux de thèse traitent de la polymérisation anionique combinée à deux méthodologies différentes d’activation du monomère visant à contrôler les réactivités des monomères et/ou des espèces actives lors de la propagation pour la synthèse de polyéthers et de polyamide-3. L’étude de nouveaux systèmes efficaces d’amorçage/propagation à base de magnésium et d’aluminium pour la polymérisation anionique par ouverture de cycles des époxydes substitués est présentée. Deux types de polyéthers réticulables ont également été synthétisés par l’utilisation de bromure de tétraoctylammonium et de triisobutyl-aluminium. Dans le premier cas, l’objectif est d’incorporer des fonctions furane pendantes le long des chaînes polyéthers. Dans le second cas il s’agit d’introduire des doubles liaisons au sein même du squelette polyéther. Les réticulations ont ensuite été effectuées thermiquement par le biais d’une chimie réversible de type Diels-Alder entre groupement furane et maléimide pour le premier cas et par vulcanisation pour le deuxième. Enfin, une étude menant à une compréhension mécanistique a été conduite sur la synthèse de polyamide-3 en masse par polymérisation par transfert d’hydrogène à partir de l’acrylamide. ; The studies presented in this thesis report on the use of the anionic polymerization with two different methodologies of monomer activation aiming to control the reactivity of monomers and/or growing species for the synthesis of polyethers and polyamide-3. New magnesium/aluminium active systems efficient for the anionic ringopening polymerization of substituted epoxides are proposed and developed. Cross-linkable polyethers were also synthesized by using the combination of tetraoctylammonium bromide with triisobutylaluminum. Furan groups or double bonds were introduced as pendant or inchain functions respectively in polyether-based materials. The so-formed polymers were cross-linked using reversible Diels-Alder reaction between furan and maleimide, and vulcanization for the double bonds. Finally, we ...

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المؤلفون: Said ahmed, Mahado

المساهمون: Antilles, Roos, Christophe, Lebrini, Mounim

مصطلحات موضوعية: Corrosion atmosphérique, Biodégradation des sargasses, H2S, Cuivre, Zinc, Acier, Atmospheric corrosion, Sargassum algae biodegradation, Copper, Steel, 620.112 23, 578.776 362

الوصف: Ce travail étudie l’influence des gaz issus de la biodégradation des sargasses, en particulier le sulfure d’hydrogène (H2S), sur la corrosion atmosphérique de l’acier, du cuivre et du zinc. Il a été montré que la présence de sulfure d’hydrogène issu de la biodégradation des algues échouées dans les zones impactées par les arrivages conséquents joue un rôle important dans la dégradation/corrosion prématurée des métaux usuels (connectique notamment). Ce facteur s’ajoute à d’autres facteurs caractéristiques d’une atmosphère marine tropicale déjà très agressive vis-à-vis des matériaux métalliques (TOW important, embruns marins chargés en ions Cl-, températures constantes et élevées tout au long de l’année). Dans cette étude, des nombreux paramètres ont été considérés (concentration en H2S et en sel marin, distance par rapport au rivage…etc) pour caractériser la corrosivité des sites. Dans la première partie de ce travail, l’étude de la corrosion atmosphérique du cuivre a montré que des vitesses de corrosion obtenues par gravimétrie sont très élevées dans les zones impactées. Cette étude a été appuyée par des analyses de surface (MEB/EDX et DRX) révélant des surfaces de corrosion très dégradées, altérées par la présence du H2S dans l’atmosphère. Les études électrochimiques (via les techniques de spectroscopie d’impédance électrochimique et de polarisation linéaire) ont permis de proposer un modèle électrochimique des phénomènes de corrosion se produisant à la surface des métaux. Les deuxième et troisième parties de ce travail portent respectivement sur l’étude de la corrosion atmosphérique, dans ces conditions particulièrement agressives, du zinc et de l’acier. ; This work investigates the influence of gases from biodegradation of Sargassum algae, in particular hydrogen sulphide (H2S), on the atmospheric corrosion of steel, copper and zinc. It has been shown that the presence of hydrogen sulphide from the biodegradation of stranded algae in the areas impacted by large arrivals plays an important role in the premature ...

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المؤلفون: Phalke, Vikram

المساهمون: Université Paris sciences et lettres, Forest, Samuel, Roos, Arjen

مصطلحات موضوعية: Effet de taille, Bande de cisaillement adiabatique, Monocristalline, Polycristalline, Plasticité cristalline à gradient de déformation, Modèle d’ordre réduit, Energie stockée, Thermomécanique, Size effect, Adiabatic shear band, Single crystals, Polycrystalline, Strain gradient crystal plasticity, Reduced-Order models, FCC metallic materials, Stored energy, Thermo-mechanics, 620.11

الوصف: Les modèles classiques de plasticité cristalline ne parviennent pas à capturer les effets de taille observés expérimentalement, à savoir, plus la taille est petite, plus la force est grande. Ces modèles montrent également une dépendance du maillage dans les problèmes de localisation de déformation due à l’absence d’une échelle de longueur caractéristique dans le cadre constitutif. Les modèles de plasticité cristalline à gradient de déformation peuvent surmonter les limites susmentionnées des modèles de plasticité de cristalline classiques. Cependant, la mise en œuvre du modèle de plasticité à gradient de déformation dans le logiciel commercial des techniciens de maintenance est difficile en raison du cadre constitutif complexe. Dans le présent travail, les modèles de plasticité des cristalline à gradient de déformation, spécifiquement la plasticité des cristalline micromorphique réduit et les modèles fondés sur le multiplicateur de Lagrange, sont utilisés pour prédire l’effet de taille dans des tests de torsion de microfils monocristallins. Une comparaison est effectuée entre l’effet de taille prévu en utilisant le modèle fondés sur le multiplicateur de Lagrange et celui fait par le modèle CurlFp de la littérature, qui est fondés sur le tenseur de densité de dislocation complet. De plus, la localisation des déformations due à l’élevation de la température est étudiée. Une formulation thermodynamique cohérente des équations constitutives est proposée pour les modèles de plasticité cristalline classique et micromorphique. Ce cadre thermodynamique cohérent est appliqué pour étudier le processus de formation de bandes de cisaillement adiabatique dans des matériaux métalliques cubiques à face centrées (CFC) monocristallins et poly-cristallins. Cinq orientations cristallines différentes d’un seul spécimen en forme de chapeau sont considérées pour étudier la formation, l’intensité et l’orientation des bandes de cisaillement. La formation de bandes de cisaillement adiabatiques et l’effet granulométrique sont étudiés ...

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المؤلفون: Thai, Sovanna

المساهمون: Toulouse, ISAE, Roos, Clément, Theodoulis, Spilios

مصطلحات موضوعية: Commande robuste, Synthèse anti-Windup, Séquencement de gain, Mu-Analyse probabiliste, Robust control, Anti-Windup synthesis, Gain scheduling, Probabilistic mu-Analysis

الوصف: Dans le secteur aérospatial, la conception de contrôleurs pour des systèmes évoluant sur un domaine de vol étendu constitue un défi majeur. La dépendance non-linéaire de la dynamique de ces systèmes à des paramètres variant dans le temps, les saturations des actionneurs, et les incertitudes de modélisation comptent parmi les sources de difficulté les plus importantes. Les exigences croissantes en terme de performance et les contraintes de coût associées aux applications industrielles modernes rendent la tâche d’autant plus ardue pour l’ingénieur automaticien, qui doit alors le plus souvent recourir à un processus itératif coûteux. Il existe donc un réel besoin de développer des algorithmes et des outils avancés pour traiter les non-linéarités et les incertitudes, et qui soient applicables à des systèmes aérospatiaux réalistes. Les travaux de thèse s’inscrivent dans ce contexte. L’objectif est de mettre en place une méthodologie pour la conception de lois de contrôle pour des systèmes incertains à paramètres variants, et avec saturation des actionneurs. Pour ce faire, l’idée est d’exploiter et de combiner de manière pertinente le séquencement de gain, la théorie de la commande robuste H-infini, la synthèse anti-windup, et les méthodes d’analyse de robustesse (mu-analyse et analyse IQC) durant la phase de conception. Dans cette optique, la mu-analyse probabiliste fait l’objet de contributions théoriques et algorithmiques qui permettent de mieux répondre aux besoins industriels par rapport à la mu-analyse classique. Le développement de la méthodologie générale s’appuie sur l’étude d’une application aéronautique spécifique, à savoir un concept innovant de projectile guidé gyrostabilisé, caractérisé par de fortes non-linéarités et des couplages dynamiques importants. L’étude de ce système va de la modélisation en boucle ouverte jusqu’aux simulations de Monte Carlo non-linéaires en boucle fermée, illustrant la méthodologie proposée dans un cadre applicatif réaliste. ; In the aerospace field, a major challenge related ...

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