التفاصيل البيبلوغرافية
| العنوان: |
Dynamiques intracellulaires et imagerie de super résolution : la paroi bactérienne sondée à l'échelle moléculaire ; Intracellular dynamics and super-resolution imaging : the bacterial wall probed at the molecular scale |
| المؤلفون: |
Lu, Yunjiao |
| المساهمون: |
Rennes 1, Kervrann, Charles, Carballido-López, Rut, Muresan, Leila |
| سنة النشر: |
2021 |
| المجموعة: |
theses.fr |
| مصطلحات موضوعية: |
Analyse des trajectoires de particules uniques, Processus de diffusion, Vidéomicroscopie de haute résolution, Reconstruction/ traitement des images, Modélisation probabilistique, Estimation paramétrique, Single-Particle trajectory analysis, Diffusion process, Time-Lapse high-Resolution microscopy, Image reconstruction/ processing, Probabilistic modeling, Parametric estimation |
| الوصف: |
Dans cette thèse, les méthodes de modélisation physique, statistique, et mathématique pour l'analyse des trajectoires de particules uniques ont été étudiées, accompagnées d'une évaluation expérimentale sur un problème spécifique, concernant la dynamique d'agrégats de MreB. Dans un premier temps, nous avons proposé deux approches pour analyser les trajectoires de MreB à l'aide de processus de diffusion caractérisés par des équations différentielles stochastiques. La première approche consiste à analyser les trajectoires individuelles, à déterminer leur mode de diffusion (diffusion libre, super-diffusion ou sous-diffusion) et à estimer les caractéristiques de diffusion (dérive et coefficient de diffusion). La seconde approche consiste à étudier la dynamique des particules au voisinage d'un point dans le champ, et à obtenir ensuite le champ de dérive et le champ de diffusion. Dans la seconde partie de la thèse, une modélisation probabiliste est proposée afin de reconstruire des dynamiques de particules en mouvement sur une surface cylindrique à partir d'observations partielles de ces dernières. La modélisation s'appuie d'une part, sur un processus de naissance et mort et d'autre part un processus Brownien avec dérive. Elle a donné lieu à une procédure de reconstruction autonome par maximisation de vraisemblance. Cette procédure est évaluée sur des données de synthèse ainsi que des données réelles de dynamiques de MreB obtenue en microscopie TIRFM. ; In this thesis, physical, statistical and mathematical modeling methods for the analysis of single particle trajectories have been reviewed, accompanied by experimental evaluation on a specific problem, concerning the dynamics of MreB. Firstly, we proposed two approaches to analyze the trajectories of MreB based on diffusion characterized by Stochastic Differential Equations. The first approach consists in analyzing individual trajectories, determining their diffusion nature (free diffusion, super-diffusion or sub-diffusion) and estimating diffusion features (drift and ... |
| نوع الوثيقة: |
thesis |
| اللغة: |
English |
| العلاقة: |
http://www.theses.fr/2021REN1S082/documentTest |
| الإتاحة: |
http://www.theses.fr/2021REN1S082/documentTest |
| حقوق: |
Open Access ; http://purl.org/eprint/accessRights/OpenAccessTest |
| رقم الانضمام: |
edsbas.B98D82E8 |
| قاعدة البيانات: |
BASE |
