التفاصيل البيبلوغرافية
العنوان: |
Computational analysis of focal adhesion complexes spatiotemporal dynamics in galvanotactic response of 3T3 NIH fibroblasts ; Obliczeniowa analiza czasoprzestrzennej dynamiki kontaktów zogniskowanych w reakcji galwanotaktycznej fibroblastów NIH/3T3 |
المؤلفون: |
Cherepashuk, Ivan |
المجموعة: |
Jagiellonian University Repository |
مصطلحات موضوعية: |
galwanotaksja, dynamika kontaktów zogniskowanych, winkulina, ImageJ, 3T3 NIH, mikroskopia TIRF, galvanotaxis, focal adhesion dynamics, vinculin, TIRFM |
الوصف: |
Kontakty zogniskowane (ang. focal adhesions, FA) są kluczowymi mediatorami ruchu komórkowego, lecz ich rola w reakcji galwanotaktycznej jest w dużej mierze nieznana. Fibroblasty 3T3 NIH transfekowane plazmidem zawierającym gen kodujący winkulinę skoniugowaną z białkiem fluorescencyjnym obrazowano przy użyciu mikroskopii fluorescencyjnej całkowitego wewnętrznego odbicia w warunkach izotropowych, jak i w czasie aplikacji pola elektrycznego., W celu przeprowadzenia automatycznej analizy FA opracowano specjalistyczne oprogramowanie, nazwane Focal adhesion Analysis Based on cell Sectoring (FABS). FABS umożliwia ocenę właściwości FA w czasie ruchu komórki na rejestrowanych poklatkowo filmach, z dodatkowym rozgraniczeniem na FA obecne blisko skraju komórki, jak i z uwzględnieniem jej poszczególnych regionów. Udowodniono, że FABS zapewnia porównywalne wyniki z istniejącymi rozwiązaniami i nadaje się do oceny FA na przestrzeni serii obrazów, jak i w obrębie poszczególnych kroków czasowych, zarówno w kierunkowym, jak i spontanicznym ruchu komórek. Potwierdzono, że fibroblasty 3T3 NIH migrują kierunkowo do katody w odpowiedzi na pole elektryczne o natężeniu 2 V/cm, czemu towarzyszy wzrost ich aktywności ruchowej. Przykładowe dane dotyczące dynamiki FA przedstawiono dla spontanicznej migracji komórek oraz galwanotaksji. Nasiloną dynamikę FA zaobserwowano w rejonie komórki sięgającym 4 µm od jej krawędzi. Zmiany właściwości FA porównano dla obszarów komórki zwróconych do katody i anody. Po stronie katody zachodzi wzrost formowania nowych FA, podczas gdy ich stopień wydłużenia się zmniejsza; w celu oceny zmian ich orientacji względem linii pola elektrycznego wymagane są jednak dalsze badania. Po przeciwnej stronie komórki zaobserwowano z kolei hamowanie tworzenia nowych FA oraz wydłużenie już obecnych. Mniejszą dynamikę FA zanotowano w centralnym rejonie komórki, chociaż ich średni kąt w stosunku do linii pola elektrycznego stawał się z czasem bardziej prostopadły. Tworzenie nowych FA pokazano również na krawędzi wiodącej ... |
نوع الوثيقة: |
master thesis |
اللغة: |
English |
العلاقة: |
https://ruj.uj.edu.pl/xmlui/handle/item/243625Test |
الإتاحة: |
https://ruj.uj.edu.pl/xmlui/handle/item/243625Test |
رقم الانضمام: |
edsbas.E0884435 |
قاعدة البيانات: |
BASE |