Convergence entre l’analyse biostatistique et les méthodes d’inversion hiérarchique bayésienne pour la recherche et la validation de biomarqueurs par spectrométrie de masse

التفاصيل البيبلوغرافية
العنوان: Convergence entre l’analyse biostatistique et les méthodes d’inversion hiérarchique bayésienne pour la recherche et la validation de biomarqueurs par spectrométrie de masse
المؤلفون: Grangeat, Pierre, Giovannelli, Jean-François, Roy, Pascal, Picaud, Vincent, Truntzer, Caroline, Lemoine, Jérôme, Mahé, Pierre, Charrier, Jean-Philippe, Gerfault, Laurent, Szacherski, Pascal, Giremus, Audrey, Dridi, Noura, Klich, Amna, Mercier, Catherine, Maucort-Boulch, Delphine, Gal, Olivier, Ducoroy, Patrick, Salvador, Arnaud, Fortin, Tanguy, Choquet-Kastylevsky, Geneviève, Lacroix, Bruno
المساهمون: Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives - Laboratoire d'Electronique et de Technologie de l'Information (CEA-LETI), Direction de Recherche Technologique (CEA) (DRT (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA), Laboratoire de l'intégration, du matériau au système (IMS), Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1 (UB)-Institut Polytechnique de Bordeaux-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Hospices Civils de Lyon (HCL), Service de Biostatistiques Lyon, Laboratoire Outils d'Analyse des Données (CEA, LIST) (LOAD (CEA, LIST)), Département Métrologie Instrumentation & Information (CEA, LIST) (DM2I (CEA, LIST)), Laboratoire d'Intégration des Systèmes et des Technologies (LIST (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Direction de Recherche Technologique (CEA) (DRT (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay-Laboratoire d'Intégration des Systèmes et des Technologies (LIST (CEA)), Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Université Paris-Saclay, CHU Dijon, Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon), Institut des Sciences Analytiques (ISA), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut de Chimie - CNRS Chimie (INC-CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), BIOMERIEUX, ISA-ANABIO-MS - Analyse biomoléculaire par spectrométrie de masse - Biological Analysis by Mass Spectrometry, Université de Lyon-Université de Lyon-Institut de Chimie - CNRS Chimie (INC-CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), SFGBM (Société Française du génie biologique et médical), ANR-10-BLAN-0313,BHI-PRO,Inversion hiérarchique bayésienne dédiée à la spectrométrie de masse. Application à la découverte et la validation de nouveaux marqueurs protéiques.(2010)
المصدر: GRETSI ; 24° Colloque sur le traitement du signal et des images ; https://cea.hal.science/cea-03996401Test ; 24° Colloque sur le traitement du signal et des images, SFGBM (Société Française du génie biologique et médical), Sep 2013, Brest, France ; https://www.sfgbm.fr/archives/248Test
بيانات النشر: HAL CCSD
GRETSI
سنة النشر: 2013
المجموعة: HAL-CEA (Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives)
مصطلحات موضوعية: signal processing, spectrum analysis, biostatistics, statistical analysis, Bayesian method, MALDI, MRM, mass spectrometry, cancer, [SDV.BIBS]Life Sciences [q-bio]/Quantitative Methods [q-bio.QM]
جغرافية الموضوع: Brest, France
الوصف: International audience ; In this communication, we are presenting an overview on the methods in biostatistical analysis and Bayesian hierarchical inversion we are studying on the BHI-PRO project for research and validation of biomarkers based on mass spectrometry in MALDI and MRM mode. We are also expliciting the performance criteria used and giving some first experimental results. In MRM mode, we are showing on a colorectal cancer cohort using the LFABP and PDI biomarkers a relevant improvement of the sensibility for a specificity satisfying the minimum requirement for a screening test. ; Dans cette communication, nous présentons une vue d’ensemble des méthodes d’analyse biostatistique et d’inversion hiérarchique Bayésienne que nous étudions sur le projet BHI-PRO pour la recherche et la validation de biomarqueurs par spectrométrie de masse en mode MALDI et MRM. Nous avons aussi explicité les critères de performance utilisés et présenter des premiers résultats expérimentaux. En mode MRM, nous avons montré sur une cohorte de cancer colorectal, en utilisant la LFABP et la PDI comme biomarqueurs, une amélioration significative de la sensibilité pour une spécificité correspondant aux performances demandées pour un test de dépistage.
نوع الوثيقة: conference object
اللغة: English
العلاقة: cea-03996401; https://cea.hal.science/cea-03996401Test; https://cea.hal.science/cea-03996401/documentTest; https://cea.hal.science/cea-03996401/file/article_PierreGrangeat_2013.pdfTest
الإتاحة: https://cea.hal.science/cea-03996401Test
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حقوق: info:eu-repo/semantics/OpenAccess
رقم الانضمام: edsbas.3101888
قاعدة البيانات: BASE