المؤلفون: Sempéré, Guilhem, Pétel, Adrien, Abbé, Magsen, Lefeuvre, Pierre, Roumagnac, Philippe, Mahé, Frédéric, Baurens, Gaël, Filloux, Denis

المساهمون: Interactions hôtes-vecteurs-parasites-environnement dans les maladies tropicales négligées dues aux trypanosomatides (UMR INTERTRYP), Université de Bordeaux (UB)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad), Département Systèmes Biologiques (Cirad-BIOS), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad), Peuplements végétaux et bioagresseurs en milieu tropical (UMR PVBMT), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université de La Réunion (UR)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Plant Health Institute of Montpellier (UMR PHIM), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université de Montpellier (UM)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), This work was supported by the Agropolis Foundation grant ESPACE (1504-004)., Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Université de Bordeaux (UB), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université de Montpellier (UM)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro - Montpellier SupAgro, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)

المصدر: GigaScience
GigaScience, BioMed Central, 2021, 10, pp.1-8. ⟨10.1093/gigascience/giab001⟩
GigaScience, 2021, 10, pp.1-8. ⟨10.1093/gigascience/giab001⟩

مصطلحات موضوعية: Gestion de données, Phylogénie, AcademicSubjects/SCI02254, [SDV]Life Sciences [q-bio], Logiciel, web, génomique, taxonomy, base de données sur le matériel génétique, shotgun, Technical Note, Phylogeny, metagenomics, U10 - Informatique, mathématiques et statistiques, Analyse de données, L60 - Taxonomie et géographie animales, NoSQL, Taxonomie, Genomics, sequence, L10 - Génétique et amélioration des animaux, sample, assignment, metabarcoding, AcademicSubjects/SCI00960, Metagenome, data management, Software

وصف الملف: text

الوصول الحر: https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=pmid_dedup__::4326e360dbff29f75cd2e3e7c38188ddTest
https://hal.inrae.fr/hal-03219063/file/GigaSci-02-2021.pdfTest

المؤلفون: Kuhl, Heiner, Li, Ling, Wuertz, Sven, Stöck, Matthias, Liang, Xu-Fang, Klopp, Christophe

المساهمون: Department of Ecophysiology and Aquaculture, Leibniz Institute of Freshwater Ecology and Inland Fisheries, Leibnitz-Leibnitz, College of Fisheries, Chinese Perch Research Center,Huazhong Agricultural University, Innovation Base for Chinese Perch Breeding, Key Lab of Freshwater AnimalBreeding, Ministry of Agriculture, Unité de Mathématiques et Informatique Appliquées de Toulouse (MIAT INRA), Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Système d'Information des GENomes des Animaux d'Elevage (SIGENAE), German Research Foundation (DFG) - KU 3596/1-1324050651

المصدر: GigaScience
GigaScience, BioMed Central, 2020, 9 (5), ⟨10.1093/gigascience/giaa034⟩
GigaScience, 9(5):giaa034

مصطلحات موضوعية: chromosomes, AcademicSubjects/SCI02254, Computational Biology, High-Throughput Nucleotide Sequencing, Genomics, Sequence Analysis, DNA, genome scaffolding, long-read, comparative genomics, genome evolution, Synteny, SEQUENCE, EVOLUTION, INSIGHTS, SIZE, vertebrates, genome assembly, [SDE]Environmental Sciences, Technical Note, AcademicSubjects/SCI00960, Animals, CONSERVED SYNTENY, [INFO]Computer Science [cs], Software

الوصول الحر: https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=pmid_dedup__::e201e9297b7b02c504f5e09f20876957Test
https://hal.inrae.fr/hal-03182981Test

المؤلفون: Eric Rivals, Bastien Cazaux, Gustavo Sacomoto, Leena Salmela, Camille Marchet, Yvan Le Bras, Raluca Uricaru, Olivier Collin, Alexan Andrieux, Cyril Monjeaud, Susete Alves-Carvalho, Amal Zine El Aabidine, Vincent Miele, Claire Lemaitre, Pierre Peterlongo, Vincent Lacroix

المساهمون: Service Expérimentation et Développement (SED [Rennes]), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes 1 (UR1), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria), Plateforme bioinformatique GenOuest [Rennes], Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Plateforme Génomique Santé Biogenouest®-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Télécom Bretagne-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-CentraleSupélec-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec, Baobab, Département PEGASE [LBBE] (PEGASE), Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive - UMR 5558 (LBBE), Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive - UMR 5558 (LBBE), Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Equipe de recherche européenne en algorithmique et biologie formelle et expérimentale (ERABLE), Inria Grenoble - Rhône-Alpes, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria), Institut de Biologie Computationnelle (IBC), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Méthodes et Algorithmes pour la Bioinformatique (MAB), Laboratoire d'Informatique de Robotique et de Microélectronique de Montpellier (LIRMM), Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Scalable, Optimized and Parallel Algorithms for Genomics (GenScale), GESTION DES DONNÉES ET DE LA CONNAISSANCE (IRISA-D7), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-CentraleSupélec-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-CentraleSupélec-Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Helsinki Institute for Information Technology (HIIT), Aalto University, Laboratoire Bordelais de Recherche en Informatique (LaBRI), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École Nationale Supérieure d'Électronique, Informatique et Radiocommunications de Bordeaux (ENSEIRB)-Université Sciences et Technologies - Bordeaux 1-Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2, Centre de Bioinformatique de Bordeaux (CBIB), CGFB, Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Université de Rennes (UR)-Plateforme Génomique Santé Biogenouest®-Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-GESTION DES DONNÉES ET DE LA CONNAISSANCE (IRISA-D7), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Helsingin yliopisto = Helsingfors universitet = University of Helsinki-Aalto University, Université de Bordeaux (UB)-École Nationale Supérieure d'Électronique, Informatique et Radiocommunications de Bordeaux (ENSEIRB)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), CentraleSupélec-Télécom Bretagne-Université de Rennes 1 (UR1), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-CentraleSupélec-Télécom Bretagne-Université de Rennes 1 (UR1), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Plateforme Génomique Santé Biogenouest®-Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Université de Montpellier (UM)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM), Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Université de Bretagne Sud (UBS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Rennes (UNIV-RENNES)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA), Aalto University-University of Helsinki, Université de Bordeaux (UB)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École Nationale Supérieure d'Électronique, Informatique et Radiocommunications de Bordeaux (ENSEIRB), Department of Computer Science, Helsinki Institute for Information Technology, Finnish Centre of Excellence in Algorithmic Data Analysis Research (Algodan), Genome-scale Algorithmics research group / Veli Mäkinen, Bioinformatics, Algorithmic Bioinformatics

المصدر: GigaScience
GigaScience, BioMed Central, 2016, 5 (1), ⟨10.1186/s13742-015-0105-2⟩
GigaScience, 2016, 5 (1), ⟨10.1186/s13742-015-0105-2⟩

مصطلحات موضوعية: 0301 basic medicine, Computer science, Molecular Sequence Data, 0206 medical engineering, Information Storage and Retrieval, Health Informatics, 02 engineering and technology, computer.software_genre, Whole-genome assembly-less treatment, De Bruijn graph, Set (abstract data type), 03 medical and health sciences, symbols.namesake, Bloom filter, Software, Variant calling, Technical Note, Cluster Analysis, Genome, Base Sequence, business.industry, Suite, Computational Biology, High-Throughput Nucleotide Sequencing, Reproducibility of Results, Genomics, 113 Computer and information sciences, [SDV.BIBS]Life Sciences [q-bio]/Quantitative Methods [q-bio.QM], Computer Science Applications, Information extraction, 030104 developmental biology, long read correction, NGS, Memory footprint, symbols, Data mining, Metagenomics, RNA-seq, [INFO.INFO-BI]Computer Science [cs]/Bioinformatics [q-bio.QM], Raw data, business, computer, 020602 bioinformatics

الوصول الحر: https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_dedup___::fb7800c26f76a6a584f27a47e0a14f69Test
https://hal.inria.fr/hal-01280238/documentTest

المؤلفون: Andres Legarra, Ignacy Misztal

المساهمون: Station d'Amélioration Génétique des Animaux (SAGA), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), University of Georgia [USA]

المصدر: Journal of Dairy Science
Journal of Dairy Science, American Dairy Science Association, 2008, 91 (1), pp.360-366

مصطلحات موضوعية: Male, [SDV.SA]Life Sciences [q-bio]/Agricultural sciences, Computation, Type (model theory), Polymorphism, Single Nucleotide, 03 medical and health sciences, Mice, Covariate, Genetics, Animals, Selection (genetic algorithm), ComputingMilieux_MISCELLANEOUS, 030304 developmental biology, Mathematics, 0303 health sciences, Markov chain, Models, Genetic, Body Weight, 0402 animal and dairy science, Computational Biology, Technical note, 04 agricultural and veterinary sciences, Genomics, Computer Science::Numerical Analysis, 040201 dairy & animal science, Data set, Genome-wide selection, genomic selection, genetic evaluation, marker-assisted selection, Animal Science and Zoology, Female, Algorithm, Algorithms, Food Science, Cholesky decomposition

الوصول الحر: https://explore.openaire.eu/search/publication?articleId=doi_dedup___::dd98a56a7653f07e9f6c9b2047048704Test
https://hal.inrae.fr/hal-02658143Test